-
PacBio-Full-length Transcriptome (Non-Referensi)
Platform Amplicon (16S / 18S / ITS) dikembangake kanthi pengalaman pirang-pirang taun ing analisis proyek keragaman mikroba, sing ngemot analisis dhasar standar lan analisis pribadi: analisis dhasar nyakup isi analisis utama riset mikroba saiki, isi analisis sugih lan komprehensif, lan asil analisis ditampilake ing wangun laporan proyek;Isi analisis pribadi iku macem-macem.Sampel bisa dipilih lan paramèter bisa disetel kanthi fleksibel miturut laporan analisis dhasar lan tujuan riset, kanggo mujudake syarat pribadi.Sistem operasi Windows, prasaja lan cepet.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (Non-Referensi)
Njupuk data urutan Isoform Pacific Biosciences (PacBio) minangka input, App iki bisa ngenali urutan transkrip lengkap (tanpa perakitan).Kanthi pemetaan sekuens lengkap nglawan genom referensi, transkrip bisa dioptimalake kanthi gen, transkrip, wilayah pengkodean, lsp. Ing kasus iki, identifikasi struktur mRNA sing luwih akurat, kayata splicing alternatif, etc, bisa digayuh.Analisis gabungan karo data urutan transkriptom NGS mbisakake anotasi sing luwih lengkap lan kuantifikasi sing luwih akurat ing ekspresi ing tingkat transkrip, sing umume entuk manfaat saka ekspresi diferensial hilir lan analisis fungsional.
-
Toolkits
BMKCloud minangka platform bioinformatik terkemuka sing nyedhiyakake solusi siji-mandeg kanggo program genomik, sing dipercaya banget dening peneliti ing macem-macem arena kalebu medis, pertanian, lingkungan, lan liya-liyane. , sumber daya komputasi, basis data umum, kursus online bioinformtik, lsp. BMKCloud nduweni macem-macem alat bioinformatika sing kerep digunakake kalebu anotasi gen, alat genetik evolusioner, ncRNA, kontrol kualitas data, perakitan, keselarasan, ekstraksi data, mutasi, statistik, generator angka, urutan analisis, lsp.
-
RNA cilik
RNA cilik minangka jinis RNA non-coding sing cendhak kanthi dawa rata-rata 18-30 nt, kalebu miRNA, siRNA lan piRNA.RNA cilik iki wis dilaporake sacara massal melu macem-macem proses biologis kayata degradasi mRNA, inhibisi terjemahan, pembentukan heterochromatin, lan liya-liyane. platform analisis urutan kasusun saka analisis standar lan data mining majeng.Ing basis data RNA-seq, analisis standar bisa entuk identifikasi lan prediksi miRNA, prediksi gen target miRNA, anotasi lan analisis ekspresi.Analisis lanjut ngidini telusuran lan ekstraksi miRNA sing disesuaikan, generasi diagram Venn, miRNA lan bangunan jaringan gen target.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS minangka platform analisis urutan ulang genom kabeh, sing dikembangake kanthi basis pengalaman sing sugih ing Biomarker Technologies.Platform sing gampang digunakake iki ngidini ngirim cepet alur kerja analisis terpadu kanthi mung nyetel sawetara parameter dhasar, sing cocog karo data urutan DNA sing diasilake saka platform Illumina lan platform urutan BGI.Platform iki disebarake ing server komputasi kanthi kinerja dhuwur, sing nguatake analisis data sing efisien banget sajrone wektu sing winates.Penambangan data pribadi kasedhiya ing basis analisis standar, kalebu pitakon gen mutasi, desain primer PCR, lsp.
-
mRNA (Referensi)
Transkriptom minangka pranala antarane informasi genetik genomik lan proteome fungsi biologis.Regulasi tingkat transkripsi minangka cara regulasi organisme sing paling penting lan paling akeh diteliti.Urutan transkrip bisa ngurutake transkriptom ing sembarang titik ing wektu utawa ing kondisi apa wae, kanthi resolusi akurat kanggo nukleotida siji. Bisa kanthi dinamis nggambarake tingkat transkripsi gen, kanthi bebarengan ngenali lan ngitung transkrip langka lan normal, lan nyedhiyakake informasi struktural saka sampel transkrip tartamtu.
Saiki, teknologi urutan transkriptom wis akeh digunakake ing agronomi, obat-obatan lan lapangan riset liyane, kalebu regulasi pangembangan kewan lan tanduran, adaptasi lingkungan, interaksi kekebalan, lokalisasi gen, evolusi genetik spesies lan deteksi tumor lan penyakit genetik.
-
Metagenomik (NGS)
Platform analisis iki dirancang kanggo analisis data metagenomik shotgun adhedhasar pengalaman taun.Iki kalebu alur kerja terpadu sing ngemot macem-macem analisis metagenomik sing umum dibutuhake kalebu pangolahan data, studi tingkat spesies, studi tingkat fungsi gen, binning metagenome, lan sapiturute. , setelan parameter, nggawe tokoh pribadi, etc.
-
LncRNA
Long non-coding RNAs (lncRNA) minangka jinis transkrip sing dawane luwih saka 200 nt, sing ora bisa ngode protein.Bukti akumulatif nuduhake manawa umume lncRNA bisa uga fungsional.Teknologi sekuensing throughput dhuwur lan alat analisa bioinformatik menehi daya kanggo mbukak urutan lncRNA lan informasi posisi kanthi luwih efisien lan nuntun kita nemokake lncRNA kanthi fungsi pangaturan sing penting.BMKCloud bangga nyedhiyakake platform analisis urutan lncRNA kanggo entuk analisis lncRNA sing cepet, dipercaya lan fleksibel.
-
GWAS
Studi asosiasi genom (GWAS) nduweni tujuan kanggo ngenali varian genetis (genotip) sing ana gandhengane karo sifat spesifik (fenotipe).Pasinaon GWA nyelidiki tandha-tandha genetik nyabrang kabeh genom saka jumlah akeh individu lan prédhiksi asosiasi genotipe-fenotip kanthi analisis statistik ing tingkat populasi.Resequencing genom kabeh bisa nemokake kabeh varian genetik.Gandheng karo data fenotipik, GWAS bisa diproses kanggo ngenali SNP sing gegandhengan karo fenotipe, QTL lan gen calon, sing ndhukung pembiakan kewan / tanduran modern.SLAF minangka strategi urutan genom sing disederhanakake sing dikembangake dhewe, sing nemokake marker sing disebarake genom, SNP.SNP iki, minangka penanda genetik molekuler, bisa diproses kanggo studi asosiasi kanthi sipat sing ditarget.Iku strategi biaya-efektif kanggo ngenali sipat Komplek gadhah variasi genetik.
-
Nanopore Transkriptomi lengkap
Isoform alternatif sing kompleks lan variabel ing organisme minangka mekanisme genetik sing penting kanggo ngatur ekspresi gen lan keragaman protein.Identifikasi struktur transkrip sing akurat minangka basis kanggo sinau kanthi jero babagan pola regulasi ekspresi gen.Platform urutan nanopore wis kasil nggawa studi transkriptomik menyang tingkat isoform.Platform analisis iki dirancang kanggo nganalisa data RNA-Seq sing diasilake ing platform Nanopore ing basis genom referensi, sing entuk analisis kualitatif lan kuantitatif ing tingkat gen lan tingkat transkrip.
