Transkriptom Spasial BMKMANU S1000
Skema Teknis Transkriptom Tata Ruang BMKMANU S1000
Kaluwihan BMKMANU S1000
1) Resolusi sub-selular: Saben area panangkepan ngemot > 2 yuta Titik Barcode spasial kanthi diameter 2,5 µm lan jarak 5 µm ing antarane pusat titik, ngidini analisis transkriptom spasial kanthi resolusi sub-selular (5 µm).
2) Analisis résolusi multi-level: Analisis multi-tingkat sing fleksibel saka 100 μm nganti 5 μm kanggo ngatasi fitur jaringan sing manéka warna kanthi résolusi sing optimal.
3) Profil transkriptom sing komprehensif: Transkrip sing dijupuk saka kabeh geser jaringan bisa dianalisis, tanpa watesan ing jumlah gen target lan area target.
Spesifikasi Layanan
| Pustaka | Strategi urutan | Output Data dianjurake |
| Pustaka cDNA S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/sampel |
Syarat Sampel
| Sampel | Nomer | Ukuran | Kualitas RNA |
| Blok jaringan sing dipasang OCT | 2-3 blok/sampel | Kira-kira.6.8x6.8x6.8 mm3 | RIN≥7 |
Kanggo rincian liyane babagan panuntun dhumateng preparation sampel lan alur kerja layanan, please aran gratis kanggo diajak aahli BMKGENE
Alur Kerja Layanan
Desain eksperimen
pangiriman sampel
Pra-eksperimen
Barcode spasial
Konstruksi perpustakaan
Sequencing
Analisis data
Layanan sawise-sale
Data sing diasilake dening BMKMANU S1000 dianalisis nggunakake piranti lunak "BSTMatrix", sing dirancang kanthi mandiri dening BMKGENE, kalebu:
1) Generasi matriks ekspresi gen
2) Pengolahan gambar HE
3) Kompatibel karo piranti lunak pihak katelu hilir kanggo analisis
4) Online "BSTViewer" mbantu entuk asil visualisasi kanthi resolusi sing beda.
1. Spot clustering
2. Distribusi spasial
Note: Resolusitingkat = 13 (100 µm, ngiwa); 7 (50 µm, tengen)
3.Penandha expression turah mbrawah clustering heatmap
4. Analisis data antar sampel
