Urutan Sirkulasi-Illumina
Fitur-fitur
● Penipisan rRNA diterusake karo persiapan pustaka arah, sing ngaktifake data sekuensing spesifik untaian.
● Alur kerja bioinformatika nggampangake prediksi circRNA lan kuantifikasi ekspresi.
Kauntungan Layanan
●Keahlian sing jembarKita wis ngolah luwih saka 20.000 sampel, sing nyakup macem-macem jinis sampel, kita nggawa akeh keahlian kanggo saben proyek.
●Kontrol Kualitas sing KetatKita ngetrapake titik kontrol inti ing kabeh tahapan, wiwit saka persiapan sampel nganti persiapan perpustakaan, sekuensing, lan bioinformatika. Pemantauan sing tliti njamin asil sing berkualitas tinggi kanthi konsisten.
●Pustaka RNA sing Luwih Lengkap:Kita nggunakake penipisan rRNA tinimbang penipisan RNA linier ing persiapan pra-perpustakaan, kanggo mesthekake yen data sekuensing ora mung kalebu circRNA nanging uga mRNA lan lncRNA, sing ngidini analisis gabungan saka set data kasebut.
●Analisis Opsional Jaringan RNA Endogen Kompetitif (ceRNA)Nyedhiyakake wawasan sing luwih jero babagan mekanisme pangaturan seluler.
● Dhukungan Pasca-PenjualanKita ngerti pentinge ana ing kene, mula komitmen kita ngluwihi rampunge proyek kanthi periode layanan purna jual 3 sasi. Sajrone wektu iki, kita nawakake tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, lan sesi tanya jawab kanggo njawab pitakon apa wae sing ana gandhengane karo asil.
Sarat lan Pangiriman Conto
| Perpustakaan | Platform | Data sing disaranake | QC Data |
| Pustaka arah rRNA sing wis entek | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Sarat Conto:
Nukleotida:
| Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah (μg) | Kasucian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminasi protein utawa DNA winates utawa ora ana sing dituduhake ing gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; elevasi dhasar sing winates utawa ora ana |
● Tanduran:
Oyot, Gagang utawa Kelopak: 450 mg
Godhong utawa Wiji: 300 mg
Woh-wohan: 1,2 g
● Kewan:
Jantung utawa Usus: 450 mg
Jeroan utawa Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Balung, Rambut utawa Kulit: 1,5g
● Arthropoda:
Serangga: 9g
Krustasea: 450 mg
● Getih utuh:2 tabung
● Sel: 106 sel-sel
● Serum lan Plasma6 ml
Pangiriman Sampel sing Disaranake
Wadhah: tabung centrifuge 2 ml (Foil timah ora disaranake)
Conto pelabelan: Kelompokake+replikasi contone A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pangiriman:
1. Es garing: Sampel kudu dikemas ing kantong lan dikubur ing es garing.
2. Tabung RNA stabil: Sampel RNA bisa dikeringake ing tabung stabilisasi RNA (contone, RNA stabil®) lan dikirim ing suhu kamar.
Alur Kerja Layanan
Desain eksperimen
Pangiriman conto
Ekstraksi RNA
Konstruksi perpustakaan
Urutan
Analisis data
Layanan sawise dodolan
Bioinformatika
- QC Data
- Penyelarasan genom
- Identifikasi SirkuitRNA
- Ekspresi SirkuitRNA
- Analisis ekspresi diferensial
Prediksi sirkumRNA: distribusi kromosom
SirkuRNA sing Diekspresikan kanthi Beda – Plot gunung geni
SirkRNA sing Diekspresikan kanthi Diferensial – kluster hierarkis
Pengayaan fungsional gen inang circRNA
Jelajahi kemajuan riset sing difasilitasi dening layanan sekuensing circRNA BMKGene liwat koleksi publikasi sing dikuratori.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 ngatur pembentukan circRNA lan pembungkaman gen sing dimediasi microRNA ing karsinoma hepatoseluler',Onkogen2021 40:25, 40(25), hlm. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'Transkriptom responsif X nuduhake peran RNA133 bunder ing resistensi penyakit kanthi ngatur ekspresi OsARAB ing beras',Riset Fitopatologi, 5(1), hlm. 1–14. doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/GAMBAR/6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 ngowahi keseimbangan transkrip sirkular lan linier ing karsinoma hepatoseluler'. doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'Evaluasi komprehensif sirRNA ing kardiomiopati sirosis sadurunge lan sawise transplantasi ati',Imunofarmakologi Internasional, 114, p. 109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
