Urutan DNA/RNA – Nanopore Sequencer

Urutan DNA/RNA – Gambar Unggulan Nanopore Sequencer

Urutan ONT minangka molekul siji teknologi urutan sinyal listrik wektu nyata adhedhasar nanopores, prinsip urutan saben platform padha.DNA / RNA untaian kaping pindho bakal ikatan karo protein nanoporous sing ditempelake ing biofilm lan unwinding ing sangisore timbal protein motor, miturut tumindak beda voltase saka loro-lorone biofilm, untaian DNA / RNA ngliwati protein saluran nanopore ing tartamtu. rate.Amarga bedane sifat kimia saka basa sing beda ing untaian DNA/RNA, nalika siji basa utawa molekul DNA ngliwati saluran nanopore, bakal nyebabake owah-owahan sinyal listrik sing beda.Kanthi ndeteksi lan cocog karo sinyal kasebut, jinis basis sing cocog bisa diwilang, lan deteksi wektu nyata saka urutan kasebut bisa rampung.

Hubungi Kita

Rincian Layanan

Hasil Demo

Fitur Detail Layanan

Platform	Ukuran Pustaka	Hasil Data Teoretis (Per Sel)	Akurasi basis tunggal	Aplikasi
Nanopore	8 Kb, 10 kb, 20 kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/sel	85-92%	Panggilan SV, De novo, Urutan lengkap, Iso-Seq, Anotasi gen, Deteksi metilasi DNA

Kaluwihan Service

● Pengalaman liwat 5 taun ing platform urutan PacBio kanthi ewonan proyek tertutup kanthi macem-macem spesies.
● BMKGENE minangka mitra resmi Oxford Nanopore, kanthi sertifikasi RNA/DNA platform ganda.
● Ana model utama saka sequencers karo peralatan lengkap lan cekap sequencer throughput.
● Adhedhasar platform Nanopore, luwih saka 10 riset kewan lan tanduran Denovo wis diterbitake ing jurnal internasional sing misuwur.

Syarat Sampel

Tipe Sampel

Jumlah

Konsentrasi (Qubit ®)

Volume

Kemurnian

liyane

DNA genomik

Gumantung ing Kebutuhan Data

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5；

Puncak bening ing 260 nm, ora ana kontaminasi

Konsentrasi kudu diukur kanthi Qubit lan Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA total

≥1,2 μg

≥100 μg / μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; ora ana kontaminasi

Nilai RIN ≥7.5

Alur Kerja Layanan

Persiapan sampel

Konstruksi perpustakaan

Sequencing

Analisis data

Pangiriman proyek

Sadurunge: Urutan DNA/RNA – Sequencer Illumina

Sabanjure: Urutan Fragmen Diperkuat Lokus Khusus (SLAF-Seq)

Assesmen Kualitas Data Sampel DNA

Tabel 1. Statistik data resik.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	resikN50Len	resikN90Len	resikMeanLen	resikMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25.90	28.014	15.764	23.090	143,181	9