条形banner-03

Produk

Urutan DNA/RNA – Sekuencer Nanopore

Sekuensing ONT iku teknologi sekuensing sinyal listrik wektu nyata molekul tunggal adhedhasar nanopori, prinsip sekuensing saben platform padha. DNA/RNA untaian ganda bakal kaiket karo protein nanopori sing ana ing biofilm lan bakal ucul ing sangisore protein motor, ing sangisore aksi beda voltase saka loro-lorone biofilm, untaian DNA/RNA ngliwati protein saluran nanopori kanthi kecepatan tartamtu. Amarga bedane sifat kimia saka basa sing beda ing untaian DNA/RNA, nalika basa tunggal utawa molekul DNA ngliwati saluran nanopori, bakal nyebabake owah-owahan sinyal listrik sing beda. Kanthi ndeteksi lan cocog karo sinyal kasebut, jinis basa sing cocog bisa diitung, lan deteksi wektu nyata saka urutan kasebut bisa dirampungake.


Rincian Layanan

Asil Demo

Fitur Rincian Layanan

Platform

Ukuran Perpustakaan

Hasil Data Teoretis (Per Sel)

Akurasi Basis Tunggal

Aplikasi

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/Sel

85-92%

Panggilan SV, De novo, Sekuensing lengkap, Iso-Seq, Anotasi gen, Deteksi metilasi DNA

Kauntungan Layanan

● Pengalaman luwih saka 5 taun ing platform sekuensing PacBio karo ewonan proyèk tertutup kanthi maneka warna spesies.
● BMKGENE minangka mitra resmi Oxford Nanopore, kanthi sertifikasi RNA/DNA platform ganda.
● Ana model sequencer umum kanthi peralatan lengkap lan throughput sekuensing sing cukup.
● Adhedhasar platform Nanopore, luwih saka 10 riset kewan lan tanduran Denovo wis diterbitake ing jurnal internasional sing misuwur.

Sarat Conto


Jinis Sampel

Jumlah

Konsentrasi (Qubit ®)

Volume

Kasucian

Liyane

DNA genomik

Gumantung marang Kebutuhan Data

 ≥20ng/µl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Puncak sing cetha ing 260 nm, ora ana kontaminasi

Konsentrasi kudu diukur nganggo Qubit lan Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA sakabèhé

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; ora ana kontaminasi

Nilai RIN ≥7.5

 

Alur Kerja Layanan

persiapan sampel

Persiapan sampel

Persiapan Perpustakaan

Konstruksi perpustakaan

Urutan

Urutan

Analisis data

Analisis data

QC conto

Pangiriman proyek


  • Sadurunge:
  • Sabanjure:

  • Penilaian Kualitas Data Sampel DNA

    Tabel 1. Statistik babagan data resik.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    NomerUrutanResik

    cleanSumBase

    resikN50Len

    resikN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    resikMeanQuality

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Penilaian Kualitas Data Sampel RNA

    Tabel 1. Statistik babagan data resik.

    Jeneng Berkas

    ID Klien

    MacaNumber

    BaseNumber

    N50

    Dawane Rata-rata

    Dawane Maksimal

    Skor Rata-rata

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Gambar 1. Distribusi dawa maca

    A3

    Gambar 2. Distribusi skor kualitas data resik

    A4

    Gambar 3. Distribusi skor dawa lan kualitas data resik

    A5

    njaluk kutipan

    Tulis pesenmu ing kene lan kirim menyang kita

    Kirim pesen sampeyan menyang kita: