| Platform | Ukuran Perpustakaan | Hasil Data Teoretis (Per Sel) | Akurasi Basis Tunggal | Aplikasi |
| Nanopore | 8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90Gb/Sel | 85-92% | Panggilan SV, De novo, Sekuensing lengkap, Iso-Seq, Anotasi gen, Deteksi metilasi DNA |
● Pengalaman luwih saka 5 taun ing platform sekuensing PacBio karo ewonan proyèk tertutup kanthi maneka warna spesies.
● BMKGENE minangka mitra resmi Oxford Nanopore, kanthi sertifikasi RNA/DNA platform ganda.
● Ana model sequencer umum kanthi peralatan lengkap lan throughput sekuensing sing cukup.
● Adhedhasar platform Nanopore, luwih saka 10 riset kewan lan tanduran Denovo wis diterbitake ing jurnal internasional sing misuwur.
| Jinis Sampel | Jumlah | Konsentrasi (Qubit ®) | Volume | Kasucian | Liyane |
| DNA genomik | Gumantung marang Kebutuhan Data | ≥20ng/µl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; Puncak sing cetha ing 260 nm, ora ana kontaminasi | Konsentrasi kudu diukur nganggo Qubit lan Qubit/Nanopore ≤ 2 |
| RNA sakabèhé | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5; ora ana kontaminasi | Nilai RIN ≥7.5 |
Penilaian Kualitas Data Sampel DNA
Tabel 1. Statistik babagan data resik.
| BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | NomerUrutanResik | cleanSumBase | resikN50Len | resikN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | resikMeanQuality |
| DNA_BMK01 | 1.218.239 | 26.37 | 1.121.736 | 25.90 | 28.014 | 15.764 | 23.090 | 143.181 | 9 |
Penilaian Kualitas Data Sampel RNA
Tabel 1. Statistik babagan data resik.
| Jeneng Berkas | ID Klien | MacaNumber | BaseNumber | N50 | Dawane Rata-rata | Dawane Maksimal | Skor Rata-rata |
| RNA_BMK001 | C2 | 8.947.708 | 4.047.230.083 | 398 | 452 | 129.227 | Q12 |
Gambar 1. Distribusi dawa maca
Gambar 2. Distribusi skor kualitas data resik
Gambar 3. Distribusi skor dawa lan kualitas data resik