BMKCloud Log in
条形banner-03

Produk

Analisis Asosiasi Genome-wide

Studi asosiasi genom (GWAS) nduweni tujuan kanggo ngenali varian genetik (genotip) sing ana gandhengane karo sifat spesifik (fenotipe).Panaliten GWAS nyelidiki tandha-tandha genetik nyabrang kabeh genom saka akeh individu lan prédhiksi asosiasi genotipe-fenotip kanthi analisis statistik ing tingkat populasi.Wis akeh diterapake ing riset babagan penyakit manungsa lan pertambangan gen fungsional babagan sifat kompleks kewan utawa tanduran.


Rincian Layanan

Hasil Demo

Publikasi Pilihan

gambar3

1.Kaluwihan Service

● Kasus Proyek sing akeh banget: wiwit diadegake ing taun 2009, BMKGENE wis ngrampungake atusan proyek spesies ing riset GWAS populasi, mbantu peneliti nerbitake luwih saka 100 artikel, lan faktor dampak kumulatif tekan 500.
● Analis profesional.
● Siklus analisis singkat.
● data mining akurat.

2. Spesifikasi Layanan

Jinis

Skala Populasi

Strategi urutan lan ambane

SLAF-GWAS Nomer sampel ≥200 Ukuran genom <400M, kanthi ref-genome, WGS dianjurake

Genom ukuran ≤ 1G, 100K Tag lan 10X

1G ≤ Ukuran genom ≤ 2G, Tag 200K lan 10X

Ukuran genom > 2G, 300K Tag lan 10X

WGS-GWAS

Nomer sampel ≥200

10X kanggo saben sampel

3. Pamilihing Materi

动物1
动物2
gambar7

Varietas beda, subspesies, landraces / genebanks / kulawarga campuran / sumber daya alam bébas

Macem-macem varietas, subspesies, landraces

kulawarga setengah sib / kulawarga full-sib / sumber alam bébas

4. Analisis Bioinformatika

● Analisis asosiasi genome-wide
● Analisis lan screening SNP sing signifikan
● Anotasi fungsional gen calon

5. Alur Kerja Layanan

Sampel QC

Desain eksperimen

pangiriman sampel

pangiriman sampel

Eksperimen pilot

Ekstraksi RNA

Persiapan Pustaka

Konstruksi perpustakaan

Sequencing

Sequencing

Analisis data

Analisis data

Layanan sawise sale

Layanan sawise-sale


  • Sadurunge:
  • Sabanjure:

  • a.QC fenotipe

    Histogram distribusi frekuensi

    gambar 9

    Statistik fenotipe

    gambar10

    b.Analisis asosiasi (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

    Plot QQ

    gambar11

    Plot Manhattan

    Ammonia_emmax_manhattan_00

    taun

    Jurnal

    IF

    judhul

    2022

    NC

    17.69

    Dasar genom saka kromosom giga lan genom giga saka peony wit Paeonia ostii

    2015

    NP

    7.43

    Jejak domestikasi jangkar wilayah genom sing wigati agronomis ing kedele

    2018

    MP

    9.32

    Resequencing kabeh genom saka koleksi aksesi rapeseed ing saindenging jagad nuduhake basis genetis saka divergensi ekotipe.

    2022

    HR

    7.29

    Analisis asosiasi genom menehi wawasan molekuler babagan variasi alami ukuran wiji semangka

    njaluk kutipan

    Tulis pesen sampeyan ing kene lan kirimake menyang kita

    Kirim pesen kanggo kita: