● panipisan rRNA ngiring dening preparation perpustakaan mRNA pituduh.
● Sequencing ing Illumina NovaSeq.
●Sinau Owah-owahan Komunitas Mikroba Komplek:Iki kedadeyan ing tingkat transkripsi lan njelajah gen anyar sing potensial.
●Nerangake Interaksi Komunitas Mikroba karo Inang utawa Lingkungan.
●Analisis Bioinformatika Komprehensif: Iki menehi wawasan babagan taksonomi komunitas lan komposisi fungsional, uga analisis ekspresi gen diferensial.
●Anotasi Gen Ekstensif:Nggunakake database fungsi gen sing paling anyar kanggo informasi ekspresi gen informatif komunitas mikroba.
●Dhukungan Pasca Penjualan:Komitmen kita ngluwihi proyek rampung kanthi wektu layanan sawise adol 3 wulan. Sajrone wektu iki, kita nawakake tindak lanjut proyek, pitulungan ngatasi masalah, lan sesi Q&A kanggo ngatasi pitakon apa wae sing ana gandhengane karo asil.
Platform urutan | Strategi Sequencing | Data dianjurake | Kontrol Kualitas Data |
Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
Konsentrasi (ng/µL) | Jumlah total (µg) | Volume (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Kalebu analisis ing ngisor iki:
● Kontrol Kualitas Data Urutan
● Majelis Transkrip
● Anotasi Taksonomi lan Kelimpahan
● Anotasi Fungsional lan Kelimpahan
● Kuantitas Ekspresi lan Analisis Diferensial
Distribusi taksonomi saben sampel:
Analisis keragaman beta: UPGMA
Anotasi fungsional - GO turah mbrawah
Kelimpahan taksonomi diferensial - LEFSE
Jelajahi kemajuan sing difasilitasi dening layanan urutan transkriptomi meta BMKGene liwat koleksi publikasi sing dipilih.
Lu, Z. et al. (2023) 'Toleransi asam bakteri sing nggunakake laktat saka ordo Bacteroidales nyumbang kanggo nyegah acidosis ruminal ing wedhus sing diadaptasi menyang diet konsentrasi dhuwur',Nutrisi Kewan, 14, kaca 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) 'Ngurai mikrobiota fungsional inti ing fermentasi solid-state tradisional kanthi amplicons throughput dhuwur lan urutan metatranscriptomics',Frontiers ing Mikrobiologi, 8 (JUL). doi: 10.3389 / FMICB.2017.01294 / FULL.
Wang, W. et al. (2022) 'Mycoviruses Novel Ditemokake saka Survey Metatranscriptomics saka Jamur Alternaria Phytopathogenic',Virus, 14(11), p. 2552. doi: 10.3390 / V14112552 / S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Analisis metatranscriptome paralel nuduhake degradasi metabolit sekunder tanduran dening kumbang lan simbion usus',Molekul Ekologi, 31(15), kaca 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.