mRNA-seq (NGS) – De novo

Urutan mRNA ngidini profiling kabeh transkrip mRNA ing sel ing kahanan tartamtu lan minangka teknologi sing digunakake sacara wiyar ing macem-macem bidang riset. Pipa sekuensing mRNA-de novo BMKCloud dirancang kanggo nganalisis pustaka sekuensing sing diperkaya poli-A nalika ora ana genom referensi sing kasedhiya. Pipa kasebut diwiwiti kanthi kontrol kualitas, banjur diterusake karoanyarPerakitan transkrip lan pemilihan set unigen. Analisis struktur unigen ngramalake urutan pengkodean (CDS) lan pengulangan urutan prasaja (SSR). Sabanjure, analisis ekspresi diferensial nemokake gen sing diekspresikan kanthi beda (DEG) ing antarane kondisi sing diuji, banjur diterusake karo anotasi fungsional lan pengayaan DEG kanggo njupuk wawasan biologis.