条形banner-03

Produk

Non-Referensi adhedhasar mRNA Sequencing-NGS

Urutan mRNA nguatake profil lengkap kabeh transkrip mRNA ing sel ing kahanan tartamtu. Teknologi mutakhir iki minangka alat sing kuat, mbukak profil ekspresi gen sing rumit, struktur gen, lan mekanisme molekuler sing ana gandhengane karo proses biologi sing beda-beda. Diadopsi sacara umum ing riset dhasar, diagnostik klinis, lan pangembangan obat, urutan mRNA nawakake wawasan babagan seluk-beluk dinamika seluler lan regulasi genetik.

Platform: Illumina NovaSeq X; DNSSEQ-T7


Rincian Layanan

Bioinformatika

Asil Demo

Publikasi Pilihan

Fitur

● Jupuk poly mRNA sadurunge preparation perpustakaan

● Bebas saka genom referensi apa wae: adhedhasar perakitan transkrip de novo, ngasilake dhaptar unigenes sing dianotasi karo pirang-pirang basis data (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG)

● Analisis bioinformatik lengkap babagan ekspresi gen lan struktur transkrip

Kaluwihan Service

Keahlian ekstensif: kanthi rekaman ngolah luwih saka 600.000 conto ing BMKGENE, kalebu macem-macem jinis sampel kayata kultur sel, jaringan, lan cairan awak, tim kita ndadekke akeh pengalaman kanggo saben proyek. Kita wis sukses nutup luwih saka 100.000 proyek mRNA-Seq ing macem-macem domain riset.

Kontrol Kualitas sing ketat: kita ngetrapake titik kontrol inti ing kabeh tahapan, saka persiapan sampel lan perpustakaan nganti urutan lan bioinformatika. Pemantauan sing tliti iki njamin asil kualitas sing terus-terusan.

● Anotasi Komprehensif: kita nggunakake macem-macem database kanggo fungsi annotate ing Differentially Expressed Genes (DEGs) lan nindakake analisis pengayaan sing cocog, menehi wawasan ing proses seluler lan molekul ndasari respon transcriptome.

Dhukungan Post-Sales: prasetya kita ngluwihi proyek rampung kanthi wektu layanan sawise-sale 3 sasi. Sajrone wektu iki, kita nawakake tindak lanjut proyek, pitulungan ngatasi masalah, lan sesi Q&A kanggo ngatasi pitakon apa wae sing ana gandhengane karo asil.

Syarat Sampel lan Pangiriman

Pustaka

Strategi urutan

Data dianjurake

Kontrol kualitas

Poly A enriched

Illumina PE 150 Kab

DNSSEQ-T7

6-10 Gb

Q30≥85%

Syarat Sampel:

Nukleotida:

Konk.(ng/μl)

Jumlah (μg)

Kemurnian

Integritas

≥ 10

≥ 0.2

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0,5-2,5

Kontaminasi protein utawa DNA diwatesi utawa ora ditampilake ing gel.

Kanggo tetanduran: RIN≥4.0;

Kanggo kewan: RIN≥4.5;

5.0≥28S/18S≥1.0;

winates utawa ora elevasi baseline

● Tanduran:

ROOT, Batang utawa Petal: 450 mg

Godhong utawa Wiji: 300 mg

Woh: 1,2 g

● Kewan:

Jantung utawa Usus: 300 mg

Viscera utawa Otak: 240 mg

Otot: 450 mg

Balung, Rambut utawa Kulit: 1g

● Artropoda:

serangga: 6 g

Crustacea: 300 mg

● Getih wutuh: 1 tub

● Sel: 106 sel

Pangiriman Sampel sing Disaranake

Wadah: 2 ml tabung centrifuge (Timah foil ora dianjurake)

Labeling sampel: Group+replikat contone A1, A2, A3; B1, B2, B3.

Kintunan:

1. Es garing: Sampel kudu dikemas ing tas lan dikubur ing es garing.

2. Tabung RNAstable: Sampel RNA bisa dikeringake ing tabung stabilisasi RNA (umpamane RNAstable®) lan dikirim ing suhu kamar.

Alur Kerja Layanan

Sampel QC

Desain eksperimen

pangiriman sampel

pangiriman sampel

Eksperimen pilot

Ekstraksi RNA

Persiapan Pustaka

Konstruksi perpustakaan

Sequencing

Sequencing

Analisis data

Analisis data

Layanan sawise sale

Layanan sawise-sale


  • Sadurunge:
  • Sabanjure:

  • Bioinformatika

    wps_doc_11

    Majelis transkriptom lan pilihan unigene

     

    图片6

     

     

     Anotasi unigene

    图片7 

     

    Korelasi sampel lan penilaian replika biologis

     

     图片8

     

     

    Differentially Expressed Gens (DEG)

     

     图片9

     

     

    Anotasi Fungsional DEGs

     

    图片10

     

    Pengayaan Fungsional saka DEGs

     

    图片11

    Jelajahi kemajuan sing difasilitasi dening layanan urutan mRNA NGS eukariotik BMKGene liwat koleksi publikasi sing dipilih.

     

    Shen, F. et al. (2020) 'De novo transcriptome assembly and sex-biased gene expression in the gonads of Amur catfish (Silurus asotus)', Genomics, 112(3), pp. 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.

    Zhang, C. et al. (2016) 'Analisis transkriptome metabolisme sukrosa sajrone pembengkakan lan pangembangan bohlam ing bawang (Allium cepa L.)', Frontiers in Plant Science, 7 (September), p. 212763. doi: 10.3389 / FPLS.2016.01425 / BIBTEX.

    Zhu, C. et al. (2017) 'De novo assembly, characterization and annotation for the transcriptome of Sarcocheilichthys sinensis', PLoS ONE, 12(2). doi: 10.1371/JURNAL.PONE.0171966.

    Zou, L. et al. (2021) 'Analisis transkriptom De novo nyedhiyakake wawasan babagan toleransi uyah Podocarpus macrophyllus ing tekanan salinitas', BMC Plant Biology, 21(1), pp. 1-17. doi: 10.1186 / S12870-021-03274-1 / GAMBAR / 9.

    njaluk kutipan

    Tulis pesen sampeyan ing kene lan kirimake menyang kita

    Kirim pesen kanggo kita: