Transkriptom Pacbio dawa lengkap

Sequencing Transkriptom Panjang Penuh PacBio, Isoseq, nggampangake identifikasi isoform transkrip sing akurat, menehi cahya babagan poliadenylasi lan splicing alternatif, lan ndadékaké analisis ekspresi gen sing luwih akurat. Pipa Transkriptom Panjang Penuh BMKCloud PacBio dirancang kanggo nganalisis pustaka cDNA sing diurutake ing mode Circular Consensus Sequencing (CCS) lan ngidentifikasi urutan Non-Chimeric Panjang Penuh (FLNC), sing banjur dikelompokake dadi transkrip non-redundan. Analisis BUSCO sabanjure neliti kelengkapan perakitan transkriptom. Saka transkriptom sing dirakit, pirang-pirang analisis ditindakake: splicing alternatif, pengulangan urutan prasaja (SSR), prediksi lncRNA lan gen target sing cocog, prediksi gen anyar, analisis kulawarga gen, analisis faktor transkripsi, lan anotasi fungsional transkrip.