Urutan RNA Prokariotik
Fitur-fitur
● Pangolahan sampel RNA nglibatake penipisan rRNA banjur persiapan pustaka RNA arah.
● Analisis bioinformatika adhedhasar panyelarasan karo genom referensi
● Analisis kalebu ekspresi gen lan DEG nanging uga struktur transkrip lan analisis sRNA
Kauntungan Layanan
●Kontrol Kualitas sing KetatKita ngetrapake titik kontrol inti ing kabeh tahapan, wiwit saka persiapan sampel lan perpustakaan nganti sekuensing lan bioinformatika. Pemantauan sing teliti iki njamin pangiriman asil sing berkualitas tinggi kanthi konsisten.
●Data Urutan Spesifik Untaianamarga persiapan perpustakaan RNA iku directional, saengga bisa identifikasi transkrip anti-sense.
●Analisis Lengkap sing Disesuaikan karo Transkriptom ProkariotikPipa bioinformatika ora mung kalebu analisis ekspresi gen nanging uga analisis struktur transkrip, kalebu identifikasi operon, UTR, lan promotor. Iki uga kalebu analisis sRNA, yaiku anotasi lan prediksi struktur lan target sekunder.
●Dhukungan Pasca-PenjualanKomitmen kita ngluwihi rampunging proyek kanthi periode layanan purna jual 3 sasi. Sajrone wektu iki, kita nawakake tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, lan sesi tanya jawab kanggo njawab pitakon apa wae sing ana gandhengane karo asil.
Sarat lan Pangiriman Conto
| Perpustakaan | Strategi urutan | Data sing disaranake | Kontrol Kualitas |
| Pustaka arah rRNA sing wis entek | Illumina PE150 | 1-2 Gb | Q30≥85% |
Sarat Conto:
| Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah (μg) | Kasucian | Integritas |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260/280=1.8-2.0 OD260/230=1.0-2.5 Kontaminasi protein utawa DNA winates utawa ora ana sing dituduhake ing gel. | RIN≥6.5 |
Pangiriman Sampel sing Disaranake
Wadhah: tabung centrifuge 2 ml (Foil timah ora disaranake)
Conto pelabelan: Klompokake+replikasi contone A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pangiriman:
1. Es garing: Sampel kudu dikemas ing kantong lan dikubur ing es garing.
2. Tabung RNA stabil: Sampel RNA bisa dikeringake ing tabung stabilisasi RNA (kayata RNA stabil®) lan dikirim ing suhu ruangan.
Alur Kerja Layanan
Pangiriman conto
Konstruksi perpustakaan
Urutan
Analisis data
Layanan sawise dodolan
Alur Kerja Analisis Bioinformatika
Kalebu Analisis ing ngisor iki:
● Kontrol kualitas data mentah
● Penyelarasan karo genom referensi
● Penilaian Kualitas Perpustakaan: Keacakan fragmentasi RNA, ukuran sisipan, lan saturasi sekuensing
● Anotasi fungsional saka gen pengkode sing diprediksi
● Analisis Ekspresi: korelasi lan Analisis Komponen Utama (PCA)
● Ekspresi Gen Diferensial (DEG)
● Anotasi fungsional lan pengayaan DEG
● Analisis sRNA: prediksi, anotasi, target, lan prediksi struktur sekunder
● Analisis Struktur Transkrip: operon, posisi awal lan pungkasan, wilayah Untranslated (UTS), promotor, lan analisis SNP/InDel
Saturasi urutan
Anotasi fungsional gen pengkode
Korelasi antarane sampel
Analisis Gen Ekspresi Diferensial (DEG)
Analisis pengayaan fungsional
Anotasi sRNA
Jelajahi kemajuan sing difasilitasi dening layanan sekuensing mRNA lengkap Nanopore BMKGene ing publikasi unggulan iki.
Guan, CP et al. (2018) 'Owah-owahan Transkripsi Global Staphylococcus epidermidis sing Mbentuk Biofilm sing Nanggapi Total Alkaloid Sophorea alopecuroides',Jurnal Mikrobiologi Polandia, 67(2), p. 223. doi: 10.21307 / PJM-2018-024.
