Urutan Bisulfit Representasi sing Dikurangi (RRBS)
Sekuensing bisulfit representasi sing dikurangi (RRBS) gumantung marang pengayaan wilayah sing sugih pulo CpG kanthi pembelahan MspI sing diikuti karo pemilihan ukuran fragmen 200-500/600 bps. Akibate, mung wilayah sing proksimal karo pulo CpG sing diurut, dene sing duwe pulo CpG sing adoh ora kalebu ing analisis. Proses iki, digabungake karo sekuensing bisulfit, ngidini deteksi metilasi DNA kanthi resolusi dhuwur, lan pendekatan sekuensing, PE150, fokus khusus ing ujung sisipan tinimbang tengah, nambah efisiensi profil metilasi.
Teknik iki wis muncul minangka alternatif sing efektif biaya lan efisien kanggo Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) ing riset metilasi DNA. Nalika WGBS menehi wawasan lengkap kanthi mriksa kabeh genom ing resolusi basa tunggal, biaya sing dhuwur bisa dadi faktor pembatas, sing RRBS kanthi strategis nyuda tantangan iki kanthi selektif nganalisis bagean sing representatif saka genom. Metodologi iki minangka alat sing ora ana regane sing ngidini riset metilasi DNA sing efektif biaya lan ngembangake kawruh babagan mekanisme epigenetik.
Fitur Layanan
● Urutan ing Illumina NovaSeq.
● Mbutuhake genom referensi.
● DNA Lambda digunakake kanggo ngawasi efisiensi konversi bisulfit.
● Efisiensi pencernaan MspI uga dipantau.
● Pencernaan enzim ganda kanggo conto tanduran.
Kauntungan Layanan
●Alternatif sing hemat biaya lan efisien kanggo WGBSIki nggampangake analisis ditindakake kanthi biaya sing luwih murah lan syarat sampel sing luwih murah.
●Platform Lengkap:Kita nyedhiyakake layanan siji-mandeg sing apik banget wiwit saka pangolahan sampel, konstruksi perpustakaan, lan sekuensing nganti analisis bioinformatika.
●Keahlian sing jembarKita sukses ing macem-macem spesies. BMKGENE nduweni pengalaman luwih saka dasawarsa, tim analisis sing trampil, konten sing komprehensif, lan dhukungan pasca-penjualan sing apik banget.
Spesifikasi Layanan
| Perpustakaan | Strategi Urutan | Output data sing disaranake | Kontrol kualitas |
| Pustaka sing dicerna MspI lan diolah nganggo Bisulfit | Illumina PE150 | 8 Gb | Q30 ≥ 85% Konversi bisulfit > 99% Efisiensi pemotongan MspI > 95% |
Sarat Conto
| Konsentrasi (ng/µL) | Jumlah total (µg) |
| |
| DNA genomik | ≥ 30 | ≥ 1 | Degradasi utawa kontaminasi sing winates |
Alur Kerja Layanan
Pangiriman conto
Konstruksi perpustakaan
Urutan
Analisis data
Layanan sawise dodolan
Analisis BI kalebu:
● Kontrol kualitas sekuensing mentah;
● Pemetaan menyang genom referensi;
● Deteksi basa termetilasi 5mC lan identifikasi motif;
● Analisis distribusi metilasi lan perbandingan sampel;
● Analisis Wilayah Metilasi Diferensial (DMR);
● Anotasi fungsional gen sing ana gandhengane karo DMR.
Kontrol kualitas: efisiensi pencernaan (ing pemetaan genom)
Kontrol kualitas: konversi bisulfit (ing ekstraksi info metilasi)
Peta metilasi: distribusi genom metilasi 5mC
Conto perbandingan: Analisis Komponen Utama
Analisis Wilayah Metilasi Diferensial (DMR): peta panas
Jelajahi kemajuan riset sing difasilitasi dening layanan sekuensing bisulfit genom lengkap BMKGene liwat koleksi publikasi sing dikuratori.
Li, Z. et al. (2022) 'Pemrograman ulang kanthi akurasi dhuwur menyang sel kaya Leydig kanthi aktivasi CRISPR lan faktor parakrin',PNAS Nexus, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
Tian, H. et al. (2023) 'Analisis metilasi DNA sak genom babagan komposisi awak ing kembar monozigot Cina',Jurnal Investigasi Klinis Eropa, 53(11), p. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'Metilasi DNA lan rasio pinggang-pinggul: studi asosiasi epigenom ing kembar monozigot Cina',Jurnal Investigasi Endokrinologis, 45(12), kaca 2365–2376. doi: 10.1007 / S40618-022-01878-4.
