-
Urutan mRNA lengkap-Nanopore
Urutan RNA wis dadi alat sing penting kanggo analisis transkriptom lengkap.Mesthi wae, urutan maca cekak tradisional entuk akeh pangembangan penting ing kene.Nanging, asring nemoni watesan ing identifikasi isoform lengkap, kuantifikasi, bias PCR.
Urutan nanopore mbedakake dhewe saka platform urutan liyane, amarga nukleotida diwaca langsung tanpa sintesis DNA lan ngasilake maca dawa ing puluhan kilobase.Iki nguatake transkrip lengkap sing diwaca langsung lan ngatasi tantangan ing studi tingkat isoform.
Platform:Nanopore PromethION
Pustaka:cDNA-PCR
-
De novo Full-dawa Transcriptome sequencing -PacBio
Saikiurutan transkriptom lengkap, uga dikenal minangkaSaikiIso-Seq njupuk kaluwihan saka sequencer PacBio ing dawa maca, kang mbisakake urutan molekul cDNA lengkap-dawa tanpa break.Iki rampung ngindhari kesalahan sing digawe ing langkah perakitan transkrip lan nggawe set unigene kanthi resolusi tingkat isoform.Set unigene iki nyedhiyakake informasi genetik sing kuat minangka "genom referensi" ing tingkat transkriptom.Kajaba iku, nggabungake data urutan generasi sabanjure, layanan iki nguatake kuantitas ekspresi tingkat isoform sing akurat.
Platform: PacBio Sekuel IIPerpustakaan: perpustakaan lonceng SMRT -
Urutan mRNA eukariotik-Illumina
Urutan mRNA mbisakake profil kabeh mRNA sing ditranskrip saka sel ing kahanan tartamtu.Iki minangka teknologi sing kuat kanggo mbukak profil ekspresi gen, struktur gen lan mekanisme molekuler saka proses biologi tartamtu.Nganti saiki, urutan mRNA wis akeh digunakake ing riset dhasar, diagnostik klinis, pangembangan obat, lsp.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Non-Referensi adhedhasar urutan mRNA-Illumina
Urutan mRNA nggunakake teknik urutan generasi sabanjure (NGS) kanggo njupuk RNA (mRNA) utusan saka Eukariota ing wektu tartamtu sing sawetara fungsi khusus diaktifake.Transkrip paling dawa sing disambung diarani 'Unigene' lan digunakake minangka urutan referensi kanggo analisis sakteruse, sing minangka sarana efektif kanggo nyinaoni mekanisme molekuler lan jaringan pangaturan spesies tanpa referensi.
Sawise perakitan data transkriptom lan anotasi fungsional unigene
(1)Analisis SNP, analisis SSR, prediksi CDS lan struktur gen bakal dibentuk.
(2) Kuantifikasi ekspresi unigene ing saben sampel bakal ditindakake.
(3) Unigenes sing dibedakake antarane conto (utawa klompok) bakal ditemokake adhedhasar ekspresi unigene
(4) Kluster, anotasi fungsional lan analisis pengayaan saka unigenes sing diungkapake kanthi beda bakal ditindakake
-
Long non-coding sequencing-Illumina
Long non-coding RNAs (lncRNAs) minangka jinis molekul RNA sing dawane ngluwihi 200 nt, sing diciriake kanthi potensial pengkodean sing sithik banget.LncRNA, minangka anggota kunci ing RNA non-coding, utamane ditemokake ing nukleus lan plasma.Pangembangan teknologi urutan lan bioinformatika ngidini identifikasi pirang-pirang lncRNA novel lan nggandhengake fungsi biologis.Bukti akumulatif nuduhake manawa lncRNA akeh melu ing regulasi epigenetik, regulasi transkripsi lan regulasi pasca transkripsi.
-
Urutan RNA cilik-Illumina
RNA cilik nuduhake kelas molekul RNA non-coding sing dawane kurang saka 200nt, kalebu RNA mikro (miRNA), RNA interferensi cilik (siRNA), lan RNA interaksi piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) minangka kelas RNA cilik endogen kanthi dawa kira-kira 20-24nt, sing nduwe macem-macem peran pangaturan penting ing sel.miRNA melu akeh proses urip sing ngungkapake jaringan - spesifik lan panggung - ekspresi spesifik lan dijaga banget ing macem-macem spesies.
-
circRNA sequencing-Illumina
Urutan transkriptome kabeh dirancang kanggo nggawe profil kabeh jinis molekul RNA, kalebu coding (mRNA) lan RNA non-coding (kalebu lncRNA, circRNA lan miRNA) sing ditranskripsi dening sel tartamtu ing wektu tartamtu.Urutan transkriptome sakabehe, uga dikenal minangka "urutan RNA total" nduweni tujuan kanggo mbukak jaringan pangaturan sing komprehensif ing tingkat transkriptom.Mupangate teknologi NGS, urutan kabeh produk transkriptom kasedhiya kanggo analisis ceRNA lan analisis RNA gabungan, sing menehi langkah pisanan kanggo karakterisasi fungsional.Ngumumake jaringan pangaturan saka ceRNA adhedhasar circRNA-miRNA-mRNA.
-
Urutan transkriptome kabeh - Illumina
Urutan transkriptome kabeh dirancang kanggo nggawe profil kabeh jinis molekul RNA, kalebu coding (mRNA) lan RNA non-coding (kalebu lncRNA, circRNA lan miRNA) sing ditranskripsi dening sel tartamtu ing wektu tartamtu.Urutan transkriptome sakabehe, uga dikenal minangka "urutan RNA total" nduweni tujuan kanggo mbukak jaringan pangaturan sing komprehensif ing tingkat transkriptom.Mupangate teknologi NGS, urutan kabeh produk transkriptom kasedhiya kanggo analisis ceRNA lan analisis RNA gabungan, sing menehi langkah pisanan kanggo karakterisasi fungsional.Ngumumake jaringan pangaturan saka ceRNA adhedhasar circRNA-miRNA-mRNA.
-
Urutan RNA prokariotik
Urutan RNA prokariotik nggunakake urutan generasi sabanjure (NGS) kanggo nuduhake anané lan jumlah RNA ing wektu tartamtu, kanthi nganalisa transkriptom seluler sing owah.Urutan RNA prokariotik perusahaan kita, khusus ngarahake prokariota kanthi genom referensi, nyedhiyakake profil transkriptom, analisis struktur gen, lsp. Iki wis akeh ditrapake kanggo riset ilmu dhasar, riset lan pangembangan obat, lan liya-liyane.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Urutan Metatranscriptome
Urutan metatranskriptom ngenali ekspresi gen mikroba (loro eukariota lan prokariota) ing lingkungan alam (yaiku lemah, banyu, segara, feces, lan usus.) Khusus, layanan iki ngidini sampeyan entuk profil ekspresi gen kabeh komunitas mikroba kompleks, analisis taksonomi. spesies, analisis pengayaan fungsional saka gen sing ditulis kanthi beda, lan liya-liyane.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
