BMKCloud Log in
ბანერი-03

პროდუქტები

10x Genomics Visium სივრცითი ტრანსკრიპტომა

სივრცითი ტრანსკრიპტომიკა არის უახლესი ტექნოლოგია, რომელიც მკვლევარებს საშუალებას აძლევს გამოიკვლიონ გენის ექსპრესიის შაბლონები ქსოვილებში, მათი სივრცითი კონტექსტის შენარჩუნებით.ამ დომენის ერთ-ერთი ძლიერი პლატფორმა არის 10x Genomics Visium ერთად Illumina თანმიმდევრობით.10X Visium-ის პრინციპი დევს სპეციალიზირებულ ჩიპზე დანიშნულ ადგილას, სადაც ქსოვილის სექციებია განთავსებული.დაჭერის ეს ზონა შეიცავს შტრიხკოდირებულ ლაქებს, თითოეული შეესაბამება უნიკალურ სივრცულ მდებარეობას ქსოვილში.ქსოვილიდან დატყვევებული რნმ-ის მოლეკულები შებრუნებული ტრანსკრიფციის პროცესის დროს იარლიყება უნიკალური მოლეკულური იდენტიფიკატორებით (UMIs).ეს შტრიხკოდირებული ლაქები და UMI-ები საშუალებას იძლევა ზუსტი სივრცითი რუქა და გენის ექსპრესიის რაოდენობრივი განსაზღვრა ერთი უჯრედის გარჩევადობით.სივრცითი შტრიხკოდირებული ნიმუშებისა და UMI-ების კომბინაცია უზრუნველყოფს გენერირებული მონაცემების სიზუსტესა და სპეციფიკას.სივრცითი ტრანსკრიპტომიკის ამ ტექნოლოგიის გამოყენებით მკვლევარებს შეუძლიათ მიიღონ უფრო ღრმა გაგება უჯრედების სივრცითი ორგანიზაციისა და ქსოვილებში არსებული რთული მოლეკულური ურთიერთქმედების შესახებ. და ბოტანიკური კვლევები.

პლატფორმა: 10X Genomics Visium და Illumina NovaSeq


  • FOB ფასი:0,5 აშშ დოლარი - 9,999 აშშ დოლარი / ცალი
  • მინ.შეკვეთის რაოდენობა:100 ცალი/ცალი
  • მიწოდების უნარი:10000 ცალი/ცალი თვეში
  • სერვისის დეტალები

    ბიოინფორმატიკა

    დემო შედეგები

    გამორჩეული პუბლიკაციები

    მახასიათებლები

    ● გარჩევადობა: 100 μM

    ● ლაქის დიამეტრი: 55 μM

    ● ლაქების რაოდენობა: 4992

    ● გადაღების არე: 6,5 x 6,5 მმ

    ● თითოეული შტრიხკოდირებული ადგილი დატვირთულია 4 განყოფილებისგან შემდგარი პრაიმერებით:

    - პოლი(dT) კუდი mRNA პრაიმინგისა და cDNA სინთეზისთვის

    - უნიკალური მოლეკულური იდენტიფიკატორი (UMI) გამაძლიერებელი მიკერძოების გამოსასწორებლად

    - სივრცითი შტრიხკოდი

    - ნაწილობრივი წაკითხული 1 თანმიმდევრობის პრაიმერის დამაკავშირებელი თანმიმდევრობა

    ● სექციების H&E შეღებვა

    უპირატესობები

    ერთჯერადი სერვისი: აერთიანებს ყველა გამოცდილებას და უნარებზე დაფუძნებულ ნაბიჯებს, მათ შორის კრიო-სექციურობას, შეღებვას, ქსოვილის ოპტიმიზაციას, სივრცითი შტრიხკოდირებას, ბიბლიოთეკის მომზადებას, თანმიმდევრობას და ბიოინფორმატიკას.

    ● მაღალკვალიფიციური ტექნიკური გუნდი: გამოცდილება ქსოვილის 250-ზე მეტ ტიპსა და 100+ სახეობაში, მათ შორის ადამიანები, თაგვი, ძუძუმწოვარი, თევზი და მცენარეები.

    რეალურ დროში განახლება მთელ პროექტზე: ექსპერიმენტული პროგრესის სრული კონტროლით.

    ყოვლისმომცველი სტანდარტული ბიოინფორმატიკა:პაკეტი მოიცავს 29 ანალიზს და 100+ მაღალი ხარისხის ფიგურას.

    მორგებული მონაცემთა ანალიზი და ვიზუალიზაცია: ხელმისაწვდომია სხვადასხვა კვლევის მოთხოვნისთვის.

    არჩევითი ერთობლივი ანალიზი ერთუჯრედიანი mRNA თანმიმდევრობით

    სპეციფიკაციები

    ნიმუშის მოთხოვნები

    ბიბლიოთეკა

    თანმიმდევრობის სტრატეგია

    რეკომენდირებულია მონაცემები

    Ხარისხის კონტროლი

    OCT-ში ჩაშენებული კრიოს ნიმუშები, FFPE ნიმუშები

    (ოპტიმალური დიამეტრი: დაახლოებით 6x6x6 მმ3)

    3 ბლოკი თითო ნიმუშზე

    10X Visium cDNA ბიბლიოთეკა

    ილუმინა PE150

    50K PE იკითხება თითო ადგილზე

    (60 გბ)

    RIN> 7

    ნიმუშის მომზადების ინსტრუქციისა და მომსახურების სამუშაო პროცესის შესახებ დამატებითი ინფორმაციისთვის, გთხოვთ, თავისუფლად ესაუბროთ ა

    სერვისის სამუშაო პროცესი

    ნიმუშის მომზადების ფაზაში ტარდება რნმ-ის მოპოვების საწყისი ტესტირება მაღალი ხარისხის რნმ-ის მიღების უზრუნველსაყოფად.ქსოვილის ოპტიმიზაციის ეტაპზე სექციები შეღებილია და ვიზუალიზაცია ხდება და ქსოვილიდან mRNA განთავისუფლების გამტარიანობის პირობები ოპტიმიზებულია.შემდეგ ოპტიმიზებული პროტოკოლი გამოიყენება ბიბლიოთეკის მშენებლობის დროს, რასაც მოჰყვება თანმიმდევრობა და მონაცემთა ანალიზი.

    მომსახურების სრული პროცესი მოიცავს რეალურ დროში განახლებებს და კლიენტის დადასტურებას, რათა შეინარჩუნოს საპასუხო გამოხმაურება, რაც უზრუნველყოფს პროექტის შეუფერხებელ შესრულებას.

    图片4

  • წინა:
  • შემდეგი:

  • 10x (9)

     

    მოიცავს შემდეგ ანალიზს:

     მონაცემთა ხარისხის კონტროლი:

    o მონაცემთა გამომავალი და ხარისხის ქულების განაწილება

    o გენის გამოვლენა თითო ადგილზე

    o ქსოვილის დაფარვა

     შიდა ნიმუშის ანალიზი:

    o გენის სიმდიდრე

    o წერტილოვანი კლასტერირება, შემცირებული განზომილების ანალიზის ჩათვლით

    o დიფერენციალური გამოხატვის ანალიზი კლასტერებს შორის: მარკერის გენების იდენტიფიკაცია

    o მარკერის გენების ფუნქციური ანოტაცია და გამდიდრება

     ჯგუფთაშორისი ანალიზი

    o ლაქების ხელახალი კომბინაცია ორივე ნიმუშიდან (მაგ. დაავადებული და კონტროლი) და ხელახალი კლასტერიდან

    o თითოეული კლასტერისთვის მარკერის გენების იდენტიფიცირება

    o მარკერის გენების ფუნქციური ანოტაცია და გამდიდრება

    o ერთი და იგივე კლასტერის დიფერენციალური გამოხატვა ჯგუფებს შორის

    შიდა ნიმუშის ანალიზი

    ლაქების დაჯგუფება

    10x (10)

     

    მარკერის გენების იდენტიფიკაცია და სივრცითი განაწილება

     

    10x (12)

    10x (11)

     

    ჯგუფთაშორისი ანალიზი

    მონაცემთა კომბინაცია ორივე ჯგუფიდან და ხელახალი კლასტერი

    10x (13)

     

     

    ახალი კლასტერების მარკერის გენები

    图片5

    გამოიკვლიეთ მიღწევები, რომლებიც ხელს უწყობს BMKGene-ის სივრცითი ტრანსკრიპტომიკის სერვისს 10X Visium ამ გამორჩეულ პუბლიკაციებში:

    ჩენი, დ. და სხვ.(2023) 'mthl1, ძუძუმწოვრების ადჰეზიური GPCR-ების დროზოფილის პოტენციური ჰომოლოგი, ჩართულია ანტისიმსივნურ რეაქციებში ბუზებში ინექციურ ონკოგენურ უჯრედებზე', ამერიკის შეერთებული შტატების მეცნიერებათა ეროვნული აკადემიის Proceedings, 120(30), გვ.e2303462120.doi: /10.1073/pnas.2303462120

    ჩენი, ი. და სხვ.(2023) 'STEEL საშუალებას იძლევა მაღალი გარჩევადობით განვსაზღვროთ სივრცითი-დროითი ტრანსკრიპტომიური მონაცემები', ბრიფინგები ბიოინფორმატიკაში, 24(2), გვ. 1–10.doi: 10.1093/BIB/BBAD068.

    Liu, C. და სხვ.(2022) "ორგანოგენეზის სივრცითი დროითი ატლასი ორქიდეის ყვავილების განვითარებაში", ნუკლეინის მჟავების კვლევა, 50(17), გვ. 9724–9737.doi: 10.1093/NAR/GKAC773.

    Wang, J. et al.(2023) 'სივრცითი ტრანსკრიპტომიკის ინტეგრირება და ერთბირთვიანი რნმ-ის თანმიმდევრობა ავლენს პოტენციურ თერაპიულ სტრატეგიებს საშვილოსნოს ლეიომიომისთვის', ბიოლოგიური მეცნიერებების საერთაშორისო ჟურნალი, 19(8), გვ. 2515-2530.doi: 10.7150/IJBS.83510.

    მიიღეთ ციტატა

    დაწერეთ თქვენი მესიჯი აქ და გამოგვიგზავნეთ

    გამოგვიგზავნეთ თქვენი შეტყობინება: