ბაქტერიული და სოკოვანი მთლიანი გენომის ხელახალი სეკვენირება
ბაქტერიული და სოკოვანი მთლიანი გენომის ხელახალი სეკვენირების პროექტები გადამწყვეტია მიკრობული გენომიკის წინსვლისთვის, რადგან ისინი შესაძლებელს ხდის მიკრობული გენომების დასრულებას და შედარებას. ეს ხელს უწყობს ფერმენტაციის ინჟინერიას, სამრეწველო პროცესების ოპტიმიზაციას და მეორადი მეტაბოლიზმის გზების შესწავლას. გარდა ამისა, სოკოვანი და ბაქტერიული ხელახალი სეკვენირება გადამწყვეტია გარემოსთან ადაპტაციის გასაგებად, შტამების ოპტიმიზაციისა და გენეტიკური ევოლუციის დინამიკის გამოსავლენად, რაც ფართო გავლენას ახდენს მედიცინაზე, სოფლის მეურნეობასა და გარემოსდაცვით მეცნიერებაზე.
მომსახურების უპირატესობები
●ბიოინფორმატიკური ანალიზი მოიცავს ვარიანტების გამოძახებას:ხელახლა სეკვენირებული გენომების ფუნქციური ანალიზის უზრუნველყოფა.
● ფართო ექსპერტიზაყოველწლიურად ათასობით მიკრობული რესექვენირების პროექტით, ჩვენ გთავაზობთ ათწლეულზე მეტ გამოცდილებას, მაღალკვალიფიციურ ანალიტიკურ გუნდს, ყოვლისმომცველ კონტენტს და შესანიშნავ გაყიდვების შემდგომ მხარდაჭერას.
●გაყიდვების შემდგომი მხარდაჭერა:ჩვენი ვალდებულება პროექტის დასრულების შემდეგაც ვრცელდება და 3-თვიან გაყიდვის შემდგომ მომსახურებას გთავაზობთ. ამ პერიოდის განმავლობაში, ჩვენ გთავაზობთ პროექტის შემდგომ შემოწმებას, პრობლემების მოგვარებაში დახმარებას და კითხვა-პასუხის სესიებს შედეგებთან დაკავშირებული ნებისმიერი შეკითხვის გასაცემად.
სერვისის სპეციფიკაციები
| სეკვენირების პლატფორმა | სეკვენირების სტრატეგია | რეკომენდებული მონაცემები | ხარისხის კონტროლი |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 100x სიღრმე | Q30≥85% |
ნიმუშის მოთხოვნები
| კონცენტრაცია (ნგ/µლ) | საერთო რაოდენობა (ნგ) | მოცულობა (µლ) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
ბაქტერიები: ≥1x107 უჯრედები
ერთუჯრედიანი სოკოები: ≥5x106-1x107 უჯრედები
მაკრო სოკოები: ≥4 გ
მომსახურების სამუშაო ნაკადი
ნიმუშის მიწოდება
ბიბლიოთეკის მშენებლობა
სეკვენირება
მონაცემთა ანალიზი
გაყიდვის შემდგომი მომსახურება
მოიცავს შემდეგ ანალიზს:
- მონაცემთა ხარისხის კონტროლი
- რეფერენს გენომთან შესაბამისობა
- ვარიანტის გამოძახება: SNP და InDel
- ვარიანტის ანოტაცია
ვარიანტის გამოძახება: SNP ტიპები
ვარიანტის გამოძახება: InDel სიგრძის განაწილება
გაეცანით BMKGene-ის მიკრობული გენომის ხელახალი სეკვენირების სერვისების მიერ ხელშეწყობულ მიღწევებს პუბლიკაციების შერჩეული კოლექციის მეშვეობით.
ჯია, ი. და სხვ. (2023) „ტრანსკრიპტომისა და მთელი გენომის ხელახალი სეკვენირების შერწყმა ხორბლის ჯუჯა ბანტის დაავადებისადმი რეზისტენტობის გენების სკრინინგისთვის“,მოლეკულური მეცნიერებების საერთაშორისო ჟურნალი, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
ჯიანგი, მ. და სხვ. (2023) „ამპიცილინით კონტროლირებადი გლუკოზის მეტაბოლიზმი მანიპულირებს ბაქტერიებში ტოლერანტობიდან რეზისტენტობაზე გადასვლაზე“,მეცნიერების მიღწევები, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
იანგი, მ. და სხვ. (2022) „Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., ჰალოალკალიფილური ბაქტერია, რომელიც გამოყოფილია სოდის ტბიდან შიდა მონღოლეთის ავტონომიურ რეგიონში, ჩინეთი“, Int. J. Syst. Evol.მიკრობიოლი, 72, გვ. 5263. დოი: 10.1099/იჯსემ.0.005263.
ჟუ, ზ., ვუ, რ. და ვანგი, გ.-ჰ. (2024) „Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a-ს გენომის თანმიმდევრობა, გამოყოფილი Nasonia vitripennis-დან“,მიკრობიოლოგიის რესურსების განცხადებები. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
