-
PacBio-სრული სიგრძის ტრანსკრიპტომა (არარეფერენციული)
Amplicon (16S/18S/ITS) პლატფორმა შემუშავებულია მიკრობული მრავალფეროვნების პროექტის ანალიზის მრავალწლიანი გამოცდილებით, რომელიც შეიცავს სტანდარტიზებულ საბაზისო ანალიზს და პერსონალიზებულ ანალიზს: ძირითადი ანალიზი მოიცავს მიმდინარე მიკრობული კვლევის ძირითადი ანალიზის შინაარსს, ანალიზის შინაარსი მდიდარი და ყოვლისმომცველია. და ანალიზის შედეგები წარმოდგენილია პროექტის ანგარიშების სახით;პერსონალიზებული ანალიზის შინაარსი მრავალფეროვანია.შესაძლებელია ნიმუშების შერჩევა და პარამეტრების მოქნილად დაყენება ძირითადი ანალიზის მოხსენებისა და კვლევის მიზნის მიხედვით, პერსონალიზებული მოთხოვნების რეალიზაციისთვის.Windows ოპერაციული სისტემა, მარტივი და სწრაფი.
-
PacBio-სრული სიგრძის ტრანსკრიპტომა (არარეფერენციული)
Pacific Biosciences (PacBio) იზოფორმული თანმიმდევრობის მონაცემების შეყვანის სახით, ამ აპს შეუძლია სრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპტის თანმიმდევრობების იდენტიფიცირება (შეკრების გარეშე).საცნობარო გენომის მიმართ სრულმეტრაჟიანი თანმიმდევრობების რუკებით, ტრანსკრიპტების ოპტიმიზაცია შესაძლებელია ცნობილი გენების, ტრანსკრიპტების, კოდირების რეგიონების და ა.შ.ერთობლივი ანალიზი NGS ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობის მონაცემებთან ერთად იძლევა უფრო ყოვლისმომცველ ანოტაციას და გამოხატვის უფრო ზუსტ რაოდენობრივ განსაზღვრას ტრანსკრიპტის დონეზე, რაც დიდწილად სარგებლობს ქვედა დიფერენციალური გამოხატვისა და ფუნქციური ანალიზით.
-
ინსტრუმენტების ნაკრები
BMKCloud არის წამყვანი ბიოინფორმატიული პლატფორმა, რომელიც უზრუნველყოფს ერთჯერადი გადაწყვეტილებებს გენომიური პროგრამებისთვის, რომელსაც ფართოდ ენდობა მკვლევარები სხვადასხვა სფეროში, მათ შორის სამედიცინო, სასოფლო-სამეურნეო, გარემოსდაცვითი და ა.შ. , გამოთვლითი რესურსები, საჯარო მონაცემთა ბაზა, ბიოინფორმაციული ონლაინ კურსები და ა.შ. BMKCloud-ს აქვს სხვადასხვა ხშირად გამოყენებული ბიოინფორმატიული ხელსაწყოები, მათ შორის გენის ანოტაცია, ევოლუციური გენეტიკური ხელსაწყოები, ncRNA, მონაცემთა ხარისხის კონტროლი, შეკრება, გასწორება, მონაცემთა ამოღება, მუტაციები, სტატისტიკა, ფიგურების გენერატორი, თანმიმდევრობა. ანალიზი და ა.შ.
-
მცირე რნმ
მცირე რნმ არის მოკლე, არაკოდიციური რნმ-ის ტიპი, საშუალო სიგრძით 18-30 ნტ, მათ შორის miRNA, siRNA და piRNA.ეს მცირე რნმ-ები მასიურად მონაწილეობენ სხვადასხვა ბიოლოგიურ პროცესებში, როგორიცაა mRNA დეგრადაცია, ტრანსლაციის ინჰიბიცია, ჰეტეროქრომატინის წარმოქმნა და ა.შ. თანმიმდევრობის ანალიზის პლატფორმა შედგება სტანდარტული ანალიზისა და მოწინავე მონაცემთა მოპოვებისგან.RNA-seq მონაცემების საფუძველზე, სტანდარტულ ანალიზს შეუძლია მიაღწიოს miRNA იდენტიფიკაციას და პროგნოზირებას, miRNA-ს სამიზნე გენის პროგნოზირებას, ანოტაციას და გამოხატვის ანალიზს.გაფართოებული ანალიზი საშუალებას იძლევა მორგებული miRNA ძიება და მოპოვება, ვენის დიაგრამის გენერირება, miRNA და სამიზნე გენის ქსელის შექმნა.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS არის მთელი გენომის ხელახალი თანმიმდევრობის ანალიზის პლატფორმა, რომელიც შემუშავებულია ბიომარკერის ტექნოლოგიებში მდიდარი გამოცდილების საფუძველზე.ეს მარტივი გამოსაყენებელი პლატფორმა საშუალებას გაძლევთ სწრაფად წარადგინოთ ინტეგრირებული ანალიზის სამუშაო ნაკადი რამდენიმე ძირითადი პარამეტრის დაყენებით, რომელიც შეესაბამება დნმ-ის თანმიმდევრობის მონაცემებს, რომლებიც გენერირებულია როგორც Illumina პლატფორმიდან, ასევე BGI თანმიმდევრობის პლატფორმიდან.ეს პლატფორმა განლაგებულია მაღალი წარმადობის გამოთვლით სერვერზე, რომელიც უზრუნველყოფს მონაცემთა მაღალეფექტურ ანალიზს ძალიან შეზღუდულ დროში.პერსონალიზებული მონაცემთა მოპოვება ხელმისაწვდომია სტანდარტული ანალიზის საფუძველზე, მათ შორის მუტაციური გენის მოთხოვნა, PCR პრაიმერის დიზაინი და ა.შ.
-
mRNA (მინიშნება)
ტრანსკრიპტომი არის კავშირი გენომიურ გენეტიკურ ინფორმაციასა და ბიოლოგიური ფუნქციის პროტეომს შორის.ტრანსკრიპციული დონის რეგულირება არის ორგანიზმების ყველაზე მნიშვნელოვანი და ყველაზე ფართოდ შესწავლილი რეგულირების რეჟიმი.ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობას შეუძლია ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა დროის ნებისმიერ მომენტში ან ნებისმიერ პირობებში, ერთი ნუკლეოტიდის ზუსტი გარჩევადობით. მას შეუძლია დინამიურად ასახოს გენის ტრანსკრიპციის დონე, ერთდროულად იდენტიფიცირება და რაოდენობრივად განსაზღვროს იშვიათი და ნორმალური ტრანსკრიპტები და მიაწოდოს სტრუქტურული ინფორმაცია. კონკრეტული ტრანსკრიპტების ნიმუში.
ამჟამად, ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობის ტექნოლოგია ფართოდ გამოიყენება აგრონომიაში, მედიცინაში და სხვა კვლევით სფეროებში, მათ შორის ცხოველთა და მცენარეთა განვითარების რეგულაცია, გარემო ადაპტაცია, იმუნური ურთიერთქმედება, გენის ლოკალიზაცია, სახეობების გენეტიკური ევოლუცია და სიმსივნისა და გენეტიკური დაავადებების გამოვლენა.
-
მეტაგენომიკა (NGS)
ეს ანალიზის პლატფორმა შექმნილია თოფის მეტაგენომიური მონაცემების ანალიზისთვის მრავალწლიანი გამოცდილების საფუძველზე.იგი მოიცავს ინტეგრირებულ სამუშაო პროცესს, რომელიც შეიცავს სხვადასხვა ხშირად საჭირო მეტაგენომიკურ ანალიზს, მათ შორის მონაცემთა დამუშავებას, სახეობების დონის კვლევებს, გენის ფუნქციის დონის კვლევებს, მეტაგენომის ბინირებას და ა.შ. , პარამეტრის დაყენება, პერსონალიზებული ფიგურების გენერირება და ა.შ.
-
LncRNA
გრძელი არაკოდიციური რნმ (lncRNA) არის 200 ნტ-ზე მეტი სიგრძის ტრანსკრიპტების ტიპი, რომლებსაც არ შეუძლიათ ცილების კოდირება.აკუმულაციური მტკიცებულებები ვარაუდობენ, რომ lncRNA-ების უმეტესობა ფუნქციონალურია.მაღალი გამტარუნარიანობის თანმიმდევრობის ტექნოლოგიები და ბიოინფორმატიული ანალიზის ხელსაწყოები გვაძლევს საშუალებას გამოვავლინოთ lncRNA თანმიმდევრობები და პოზიციონირების ინფორმაცია უფრო ეფექტურად და მიგვიყვანს აღმოვაჩინოთ lncRNA გადამწყვეტი მარეგულირებელი ფუნქციებით.BMKCloud ამაყობს, რომ ჩვენს მომხმარებლებს სთავაზობს lncRNA თანმიმდევრობის ანალიზის პლატფორმას სწრაფი, საიმედო და მოქნილი lncRNA ანალიზის მისაღწევად.
-
GWAS
გენომის მასშტაბური ასოციაციის კვლევა (GWAS) მიზნად ისახავს გენეტიკური ვარიანტების (გენოტიპის) იდენტიფიცირებას, რომლებიც დაკავშირებულია სპეციფიკურ მახასიათებლებთან (ფენოტიპთან).GWA კვლევები იკვლევს გენეტიკურ მარკერებს დიდი რაოდენობის ინდივიდების მთლიან გენომზე და პროგნოზირებს გენოტიპ-ფენოტიპის ასოციაციებს სტატისტიკური ანალიზით პოპულაციის დონეზე.მთლიანი გენომის ხელახალი თანმიმდევრობა პოტენციურად შეუძლია აღმოაჩინოს ყველა გენეტიკური ვარიანტი.ფენოტიპურ მონაცემებთან ერთად, GWAS შეიძლება დამუშავდეს ფენოტიპთან დაკავშირებული SNP-ების, QTL-ების და კანდიდატი გენების იდენტიფიცირებისთვის, რაც ძლიერ მხარს უჭერს თანამედროვე ცხოველების/მცენარეების მოშენებას.SLAF არის საკუთარი ხელით შემუშავებული გამარტივებული გენომის თანმიმდევრობის სტრატეგია, რომელიც აღმოაჩენს გენომის მასშტაბით განაწილებულ მარკერებს, SNP.ეს SNP-ები, როგორც მოლეკულური გენეტიკური მარკერები, შეიძლება დამუშავდეს მიზნობრივი მახასიათებლების ასოციაციის კვლევებისთვის.ეს არის ხარჯთეფექტური სტრატეგია გენეტიკური ვარიაციების კომპლექსური მახასიათებლების იდენტიფიცირებისთვის.
-
Nanopore სრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპტომიკა
ორგანიზმებში რთული და ცვალებადი ალტერნატიული იზოფორმები მნიშვნელოვანი გენეტიკური მექანიზმებია გენის ექსპრესიისა და ცილების მრავალფეროვნების რეგულირებისთვის.ტრანსკრიპტის სტრუქტურების ზუსტი იდენტიფიკაცია არის გენის ექსპრესიის რეგულირების შაბლონების სიღრმისეული შესწავლის საფუძველი.Nanopore თანმიმდევრობის პლატფორმამ წარმატებით მიიყვანა ტრანსკრიპტომიური კვლევა იზოფორმის დონეზე.ეს ანალიზის პლატფორმა შექმნილია Nanopore-ის პლატფორმაზე გენერირებული RNA-Seq მონაცემების გასაანალიზებლად საცნობარო გენომის საფუძველზე, რომელიც აღწევს ხარისხობრივ და რაოდენობრივ ანალიზებს როგორც გენის დონეზე, ასევე ტრანსკრიპტების დონეზე.
