Illumina-ს წინასწარ დამზადებული ბიბლიოთეკები
მახასიათებლები
●პლატფორმები:Illumina NovaSeq 6000 და NovaSeq X Plus
●თანმიმდევრობის რეჟიმები:PE150 და PE250
●ბიბლიოთეკების ხარისხის კონტროლი სეკვენირებამდე
●მონაცემების ხარისხის კონტროლი და მიწოდება:Q30 წაკითხვის დემულტიპლექსირებისა და ფილტრაციის შემდეგ QC ანგარიშისა და ნედლი მონაცემების მიწოდება fastq ფორმატში
მომსახურების უპირატესობები
●სეკვენირების სერვისების მრავალფეროვნება:მომხმარებელს შეუძლია აირჩიოს თანმიმდევრობა ზოლის, ნაკადის უჯრედის ან საჭირო მონაცემების რაოდენობის მიხედვით (ზოლის ნაწილობრივი თანმიმდევრობა).
●Illumina-ს სეკვენირების პლატფორმაზე ფართო გამოცდილება:ათასობით დახურული პროექტით სხვადასხვა სახეობით.
●სეკვენირების ხარისხის კონტროლის ანგარიშის მიწოდება:ხარისხის მეტრიკებით, მონაცემთა სიზუსტით და სეკვენირების პროექტის საერთო შესრულებით.
●ზრდასრული სეკვენირების პროცესი:მოკლე შემობრუნების დროით.
●მკაცრი ხარისხის კონტროლიჩვენ ვიცავთ მკაცრ ხარისხის კონტროლის მოთხოვნებს, რათა უზრუნველვყოთ მუდმივად მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდება.
ნიმუშის პლატფორმები
| პლატფორმა | ნაკადის უჯრედი | თანმიმდევრობის რეჟიმი | ერთეული | სავარაუდო გამომავალი |
| ნოვასექ X | 10B (8 ზოლი) | PE150 | ერთზოლიანი ნაწილობრივი ზოლი | 375 გბ / ზოლი |
| 25B (8 ზოლი) | PE150 | ერთზოლიანი ნაწილობრივი ზოლი | 1000 გბ/ხაზი | |
| ნოვასექ 6000 | SP ნაკადის უჯრედი (2 ზოლი) | PE250 | ნაკადის უჯრედი ერთზოლიანი ნაწილობრივი ზოლი | 325-400 მ წაკითხვა / ზოლი |
| S4 ნაკადის უჯრედი (4 ზოლი) | PE150 | ნაკადის უჯრედი ერთზოლიანი ნაწილობრივი ზოლი | ~800 გბ / ზოლი |
ნიმუშის მოთხოვნები
| მონაცემთა რაოდენობა (X) | კონცენტრაცია (qPCR/nM) | მოცულობა | |
| ნაწილობრივი ზოლის თანმიმდევრობა
| X ≤ 10 გბ | ≥ 1 ნმ | ≥ 25 μl |
| 10 გბ < X ≤ 50 გბ | ≥ 2 ნმ | ≥ 25 μl | |
| 50 გბ < X ≤ 100 გბ | ≥ 3 ნმ | ≥ 25 μl | |
| X > 100 გბ | ≥ 4 ნმ | ≥ 25 μl | |
| ზოლის თანმიმდევრობა | თითო ზოლზე | ≥ 1.5 ნმ / ბიბლიოთეკის პული | ≥ 25 μl / ბიბლიოთეკის პული |
კონცენტრაციისა და საერთო რაოდენობის გარდა, საჭიროა პიკის შესაფერისი სურათიც.
შენიშვნა: დაბალი მრავალფეროვნების ბიბლიოთეკების ზოლების თანმიმდევრობისთვის საჭიროა PhiX spike-in, რათა უზრუნველყოფილი იყოს ბაზისური გამოძახების საიმედოობა.
ჩვენ გირჩევთ, წინასწარ გაერთიანებული ბიბლიოთეკები ნიმუშებად წარმოადგინოთ. თუ ბიბლიოთეკების გაერთიანება BMKGENE-ს სჭირდება, გთხოვთ, იხილოთ
ბიბლიოთეკის მოთხოვნები ზოლების ნაწილობრივი თანმიმდევრობისთვის.
ბიბლიოთეკის ზომა (პიკის რუკა)
მთავარი პიკი უნდა იყოს 300-450 bp-ის ფარგლებში.
ბიბლიოთეკებს უნდა ჰქონდეთ ერთი მთავარი პიკი, ადაპტერის დაბინძურების და პრაიმერის დიმერების გარეშე.
გთხოვთ, დაგვიკავშირდეთ, თუ თქვენი ნიმუშები არ აკმაყოფილებს საწყისი მასალის მოთხოვნებს.
სერვისის სამუშაო პროცესი
ბიბლიოთეკის ხარისხის კონტროლი
სეკვენირება
მონაცემთა ხარისხის კონტროლი
პროექტის მიწოდება
ბიბლიოთეკის ხარისხის კონტროლის ანგარიში
ბიბლიოთეკის ხარისხის შესახებ ანგარიში მოწოდებულია სეკვენირებამდე, ბიბლიოთეკის რაოდენობის შეფასებამდე და ფრაგმენტაციამდე.
სეკვენირების ხარისხის კონტროლის ანგარიში
ცხრილი 1. სეკვენირების მონაცემების სტატისტიკა.
| ნიმუშის ID | BMKID | ნედლი წაკითხული | ნედლი მონაცემები (bp) | სუფთა წაკითხვები (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | გაზის შემცველობა (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
სურათი 1. ხარისხის განაწილება თითოეულ ნიმუშში წაკითხვის მიხედვით
სურათი 2. ბაზისური კონტენტის განაწილება
სურათი 3. წაკითხული შინაარსის განაწილება თანმიმდევრობის მონაცემებში
