DNBSEQ წინასწარ დამზადებული ბიბლიოთეკები
მახასიათებლები
●პლატფორმა:MGI-DNBSEQ-T7
●თანმიმდევრობის რეჟიმები:PE150
●Illumina-ს ბიბლიოთეკების გადატანამგი:რაც დაბალი ფასით დიდი მოცულობის მონაცემების თანმიმდევრობის საშუალებას იძლევა.
●ბიბლიოთეკების ხარისხის კონტროლი სეკვენირებამდე.
●მონაცემების ხარისხის კონტროლი და მიწოდება:Q30 წაკითხვის დემულტიპლექსირებისა და ფილტრაციის შემდეგ, ხარისხის კონტროლის ანგარიშისა და ნედლი მონაცემების მიწოდება fastq ფორმატში.
უპირატესობები
●სეკვენირების სერვისების მრავალფეროვნება:მომხმარებელს შეუძლია აირჩიოს თანმიმდევრობა ზოლის ან მონაცემთა რაოდენობის მიხედვით.
●მაღალი მონაცემების გამომავალი:1500 გბ/ხაზი
●სეკვენირების ხარისხის კონტროლის ანგარიშის მიწოდება:ხარისხის მეტრიკებით, მონაცემთა სიზუსტით და სეკვენირების პროექტის საერთო შესრულებით.
●ზრდასრული სეკვენირების პროცესი:მოკლე შემობრუნების დროით.
●მკაცრი ხარისხის კონტროლიჩვენ ვიცავთ მკაცრ ხარისხის კონტროლის მოთხოვნებს, რათა უზრუნველვყოთ მუდმივად მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდება.
ნიმუშის მოთხოვნები
| მონაცემთა რაოდენობა (X) | კონცენტრაცია (qPCR/nM) | მოცულობა | |
| ნაწილობრივი ზოლი
| X ≤ 10 გბ | ≥ 1 ნმ | ≥ 25 μl |
| 10 გბ < X ≤ 50 გბ | ≥ 2 ნმ | ≥ 25 μl | |
| 50 გბ < X ≤ 100 გბ | ≥ 3 ნმ | ≥ 25 μl | |
| X > 100 გბ | ≥ 4 ნმ | ||
| ერთზოლიანი | თითო ზოლზე | ≥ 1.5 ნმ / ბიბლიოთეკის პული | ≥ 25 μl / ბიბლიოთეკის პული |
კონცენტრაციისა და საერთო რაოდენობის გარდა, საჭიროა პიკის შესაფერისი სურათიც.
შენიშვნა: დაბალი მრავალფეროვნების ბიბლიოთეკების ზოლების თანმიმდევრობისთვის საჭიროა PhiX spike-in, რათა უზრუნველყოფილი იყოს ბაზისური გამოძახების საიმედოობა.
ჩვენ გირჩევთ, წინასწარ გაერთიანებული ბიბლიოთეკები ნიმუშებად წარმოადგინოთ. თუ BMKGENE-ს ბიბლიოთეკების გაერთიანება სჭირდება, გთხოვთ, იხილოთ
ბიბლიოთეკის მოთხოვნები ზოლების ნაწილობრივი თანმიმდევრობისთვის.
ბიბლიოთეკის ზომა (პიკის რუკა)
მთავარი პიკი უნდა იყოს 300-450 bp-ის ფარგლებში.
ბიბლიოთეკებს უნდა ჰქონდეთ ერთი მთავარი პიკი, ადაპტერის დაბინძურების და პრაიმერის დიმერების გარეშე.
სერვისის სამუშაო პროცესი
ბიბლიოთეკის ხარისხის კონტროლის ანგარიში
ბიბლიოთეკის ხარისხის შესახებ ანგარიში მოწოდებულია სეკვენირებამდე, ბიბლიოთეკის რაოდენობის შეფასებამდე და ფრაგმენტაციამდე.
სეკვენირების ხარისხის კონტროლის ანგარიში
ცხრილი 1. სეკვენირების მონაცემების სტატისტიკა.
| ნიმუშის ID | BMKID | ნედლი წაკითხული | ნედლი მონაცემები (bp) | სუფთა წაკითხვები (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | გაზის შემცველობა (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
სურათი 1. ხარისხის განაწილება თითოეულ ნიმუშში წაკითხვის მიხედვით
სურათი 2. ბაზისური კონტენტის განაწილება
სურათი 3. წაკითხული შინაარსის განაწილება თანმიმდევრობის მონაცემებში
