ევკარიოტული mRNA თანმიმდევრობა-Illumina
უპირატესობები
Øმაღალი გამოცდილება: 200000-ზე მეტი ნიმუში დამუშავდა BMK-ში, რომელიც მოიცავს სხვადასხვა ტიპის ნიმუშებს, მათ შორის უჯრედის კულტურას, ქსოვილს, სხეულის სითხეს და ა.შ. და 7000-ზე მეტი mRNA-Seq პროექტი დახურულია, რომელიც მოიცავს სხვადასხვა კვლევის არეალს.
Øხარისხის კონტროლის მკაცრი სისტემა: ხარისხის კონტროლის ძირითადი წერტილები ყველა საფეხურზე, მათ შორის ნიმუშის მომზადების, ბიბლიოთეკის მომზადების, თანმიმდევრობისა და ბიოინფორმატიკის ჩათვლით, მჭიდრო მონიტორინგის ქვეშ იმყოფება მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდების მიზნით.
Øმრავალი მონაცემთა ბაზა ხელმისაწვდომია ფუნქციების ანოტაციისა და გამდიდრების კვლევებისთვის, რათა შეასრულოს სხვადასხვა კვლევის მიზნები.
Øგაყიდვის შემდგომი მომსახურება: გაყიდვის შემდგომი მომსახურება მოქმედებს 3 თვის განმავლობაში პროექტის დასრულებიდან, მათ შორის პროექტების შემდგომი დაკვირვება, პრობლემების აღმოფხვრა, შედეგების კითხვა-პასუხი და ა.შ.
ნიმუშის მოთხოვნები და მიწოდება
| ბიბლიოთეკა | თანმიმდევრობის სტრატეგია | რეკომენდირებულია მონაცემები | Ხარისხის კონტროლი |
| პოლი A გამდიდრებული | ილუმინა PE150 | 6 გბ | Q30≥85% |
ნიმუშის მოთხოვნები:
ნუკლეოტიდები:
| სიწმინდე | მთლიანობა | თანხა |
| OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5გელზე ნაჩვენებია შეზღუდული ცილის ან დნმ-ის დაბინძურება ან არა. | მცენარეებისთვის: RIN≥6.5; ცხოველებისთვის: RIN≥7;28S/18S≥1.0;შეზღუდული ან საბაზისო სიმაღლეების გარეშე | კონც.≥30 ნგ/მკლ;მოცულობა ≥ 10 μl;სულ ≥ 1,5 მკგ |
ქსოვილი: წონა (მშრალი):≥1 გ
*5 მგ-ზე ნაკლები ქსოვილისთვის, ჩვენ გირჩევთ გააგზავნოთ გაყინული (თხევადი აზოტით) ქსოვილის ნიმუში.
უჯრედის სუსპენზია:უჯრედების რაოდენობა = 3×106- 1×107
*ჩვენ გირჩევთ გაგზავნოთ გაყინული უჯრედის ლიზატი.იმ შემთხვევაში, თუ უჯრედის რაოდენობა 5×105-ზე ნაკლებია, რეკომენდებულია თხევადი აზოტის გაყინვა, რაც სასურველია მიკრო ექსტრაქციისთვის.
სისხლის ნიმუშები:მოცულობა≥1 მლ
მიკროორგანიზმი:მასა ≥ 1 გ
რეკომენდებული ნიმუშის მიწოდება
კონტეინერი: 2 მლ ცენტრიფუგის ტუბი (თუნუქის ფოლგა არ არის რეკომენდებული)
ნიმუშის მარკირება: ჯგუფი+რეპლიკა, მაგ. A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
გადაზიდვა:
- მშრალი ყინული: ნიმუშები უნდა იყოს შეფუთული ჩანთებში და დამარხული მშრალ ყინულში.
- რნმ სტაბილური მილები: რნმ-ის ნიმუშები შეიძლება გაშრეს რნმ-ის სტაბილიზაციის მილში (მაგ. RNAstable®) და გაიგზავნოს ოთახის ტემპერატურაზე.
სერვისის სამუშაო ნაკადი
ექსპერიმენტის დიზაინი
ნიმუშის მიწოდება
რნმ-ის ექსტრაქცია
ბიბლიოთეკის მშენებლობა
თანმიმდევრობა
Მონაცემთა ანალიზი
გაყიდვის შემდგომი მომსახურება
ბიოინფორმატიკა
ევკარიოტული mRNA თანმიმდევრობის ანალიზის სამუშაო პროცესი
ბიოინფორმატიკა
Øნედლეული მონაცემთა ხარისხის კონტროლი
Øსაცნობარო გენომის გასწორება
Øტრანსკრიპტის სტრუქტურის ანალიზი
Øგამოხატვის რაოდენობრივი განსაზღვრა
Øდიფერენციალური გამოხატვის ანალიზი
Øფუნქციის ანოტაცია და გამდიდრება
1.mRNA მონაცემთა გაჯერების მრუდი
2.დიფერენციალური გამოხატვის ანალიზი-ვულკანის ნაკვეთი
3.KEGG ანოტაცია DEG-ებზე
4.GO კლასიფიკაცია DEG-ებზე
