● რიბოსომული cDNA-ს გასანეიტრალებლად სპეციალური ზონდები გამოიყენება.
● სტრენდის სპეციფიკური ბიბლიოთეკის კონსტრუქცია.
● ერთი სამუშაო პროცესი mRNA, lncRNA და circRNA მონაცემების ერთდროულად მისაღებად.
● მკაცრი ხარისხის კონტროლი: ჩვენ ვახორციელებთ ძირითად საკონტროლო პუნქტებს ყველა ეტაპზე, ნიმუშისა და ბიბლიოთეკის მომზადებიდან დაწყებული, სეკვენირებითა და ბიოინფორმატიკით დამთავრებული. ეს საგულდაგულო მონიტორინგი უზრუნველყოფს მუდმივად მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდებას.
● გაყიდვების შემდგომი მხარდაჭერა: ჩვენი ვალდებულება პროექტის დასრულების შემდეგაც ვრცელდება 3-თვიანი გაყიდვების შემდგომი მომსახურების პერიოდით. ამ პერიოდის განმავლობაში ჩვენ გთავაზობთ პროექტის შემდგომ შემოწმებას, პრობლემების მოგვარებაში დახმარებას და კითხვა-პასუხის სესიებს შედეგებთან დაკავშირებული ნებისმიერი შეკითხვის გასაცემად.
| ბიბლიოთეკა | პლატფორმა | რეკომენდებული მონაცემები | მონაცემთა ხარისხის კონტროლი |
| rRNA-ს ამოწურვის მიმართულებითი ბიბლიოთეკა | ილუმინა PE150 | 10-16 გბ | Q30≥85% |
ნუკლეოტიდები:
| რაოდენობა (ნგ) | მოცულობა (μლ) |
| 40 | 20 |
ქსოვილი:
ეგზოსომა: 100 μL; 40 μg; >10^9 ნაწილაკი/მლ
შრატი/პლაზმა: 5 მლ
უჯრედული კულტურის სუპერნატანტი: 100 მლ
შარდი: 100 მლ
ნერწყვი: 15 მლ
ცხვირიდან გამონადენი: 15 მლ
ცერებროსპინალური სითხე: 15 მლ
ამნიონური სითხე: 50 მლ
სპერმა: 5 მლ
ნაღველი: 5 მლ
ასციტი: 50 მლ
რძე: 15 მლ
ფოლიკულური სითხე: 15 მლ
განავლის ზედაპირული სითხე: 50 მლ
მიკრობული კულტურის სუპერნატანტი: 100 მლ
ცხოველური ქსოვილი: 3 გ
მცენარეული ქსოვილი: 1 გ
კონტეინერი: 2 მლ ცენტრიფუგის მილი (თუთის ფოლგა არ არის რეკომენდებული)
ნიმუშის მარკირება: დაჯგუფება+გამეორება მაგ. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
გადაზიდვა:
1. მშრალი ყინული: ნიმუშები უნდა შეიფუთოს პარკებში და ჩამარხოს მშრალ ყინულში.
2. რნმ-სტაბილური მილები: რნმ-ის ნიმუშების გაშრობა შესაძლებელია რნმ-ის სტაბილიზაციის მილში (მაგ. RNAstable®) და ოთახის ტემპერატურაზე გადაზიდვა.
ბიოინფორმატიკა
circRNA-ს პროგნოზირება: ქრომოსომული განაწილება
დიფერენცირებულად გამოხატული circRNAs – ვულკანის დიაგრამა
დიფერენცირებულად გამოხატული circRNAs – იერარქიული კლასტერიზაცია
circRNA-ს მასპინძელი გენების ფუნქციური გამდიდრება
დიფერენციალური გენის ექსპრესიის (DEGs) ანალიზი
lncRNA ექსპრესიის რაოდენობრივი განსაზღვრა - კლასტერიზაცია
lncRNA სამიზნე გენების გამდიდრება
mRNA-სა და lncRNA-ს ერთობლივი პოზიციის ანალიზი – ცირკოს დიაგრამა (შუა წრე არის mRNA, ხოლო შიდა წრე არის lncRNA)