● ზონდებით სამიზნის გამდიდრების საფუძველზე ხელმისაწვდომია ორი ეგზომის პანელი: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) და xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).
● სეკვენირება Illumina NovaSeq-ზე.
● ბიოინფორმატიული მილსადენი, რომელიც მიმართულია დაავადების ან სიმსივნის ანალიზისკენ.
●ცილის კოდირების რეგიონის სამიზნეებიცილის კოდირების რეგიონების აღებითა და სეკვენირებით, hWES გამოიყენება ცილის სტრუქტურასთან დაკავშირებული ვარიანტების გამოსავლენად.
●ეკონომიური:hWES ადამიანის გენომის 1%-დან ადამიანის დაავადებებთან ასოცირებული მუტაციების დაახლოებით 85%-ს იძლევა.
●მაღალი სიზუსტემაღალი სეკვენირების სიღრმის წყალობით, hWES ხელს უწყობს როგორც გავრცელებული, ასევე 1%-ზე დაბალი სიხშირის მქონე იშვიათი ვარიანტების აღმოჩენას.
●მკაცრი ხარისხის კონტროლიჩვენ ვახორციელებთ ხუთ ძირითად საკონტროლო პუნქტს ყველა ეტაპზე, ნიმუშისა და ბიბლიოთეკის მომზადებიდან დაწყებული სეკვენირებითა და ბიოინფორმატიკით დამთავრებული. ეს საგულდაგულო მონიტორინგი უზრუნველყოფს მუდმივად მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდებას.
●ყოვლისმომცველი ბიოინფორმატიკული ანალიზიჩვენი პროექტი სცილდება მხოლოდ საცნობარო გენომის ვარიაციების იდენტიფიცირებას და მოიცავს მოწინავე ანალიზს, რომელიც სპეციალურად დაავადებების გენეტიკურ ასპექტებთან ან სიმსივნის ანალიზთან დაკავშირებული კვლევითი კითხვების გადასაჭრელად არის შექმნილი.
●გაყიდვების შემდგომი მხარდაჭერა:ჩვენი ვალდებულება პროექტის დასრულების შემდეგაც ვრცელდება და 3-თვიან გაყიდვის შემდგომ მომსახურებას გთავაზობთ. ამ პერიოდის განმავლობაში, ჩვენ გთავაზობთ პროექტის შემდგომ შემოწმებას, პრობლემების მოგვარებაში დახმარებას და კითხვა-პასუხის სესიებს შედეგებთან დაკავშირებული ნებისმიერი შეკითხვის გასაცემად.
| ეგზონის დაჭერის სტრატეგია | სეკვენირების სტრატეგია | რეკომენდებული მონაცემების გამომავალი |
| Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) ან xGen ეგზომის ჰიბრიდიზაციის პანელი v2 (IDT)
| Illumina NovaSeq PE150 | 5-10 გბ მენდელის დარღვევების/იშვიათი დაავადებების შემთხვევაში: > 50x სიმსივნის ნიმუშებისთვის: ≥ 100x |
| ნიმუშის ტიპი
| თანხა(Qubit®)
| კონცენტრაცია | მოცულობა
| სისუფთავე (NanoDrop™) |
|
გენომური დნმ
| ≥ 50 ნგ | ≥ 6 ნგ/მკლ | ≥ 15 μL | OD260/280=1.8-2.0 არანაირი დეგრადაცია, არანაირი დაბინძურება
|
hWES-დაავადების ნიმუშების ბიოინფორმატიული ანალიზი მოიცავს:
● მონაცემების სეკვენირება QC
● გენომის საცნობარო გასწორება
● SNP-ებისა და InDels-ების იდენტიფიკაცია
● SNP-ებისა და InDels-ების ფუნქციური ანოტაცია
სიმსივნის ნიმუშების ბიოინფორმატიული ანალიზი მოიცავს:
● მონაცემების სეკვენირება QC
● გენომის საცნობარო გასწორება
● SNP-ების, InDels-ების და სომატური ვარიაციების იდენტიფიკაცია
● ჩანასახოვანი ვარიანტების იდენტიფიცირება
● მუტაციის ხელმოწერების ანალიზი
● ფუნქციის მომატების მუტაციების საფუძველზე წამყვანი გენების იდენტიფიკაცია
● მუტაციის ანოტაცია წამლისმიერი მგრძნობელობის დონეზე
● ჰეტეროგენულობის ანალიზი – სისუფთავისა და პლოიდურობის გაანგარიშება
მონაცემთა ხარისხის კონტროლი – ეგზომის დაჭერის სტატისტიკა
ვარიანტის იდენტიფიკაცია – InDels
გაფართოებული ანალიზი: მავნე SNP-ების/InDels-ების იდენტიფიკაცია და განაწილება – Circos დიაგრამა
სიმსივნის ანალიზი: სომატური მუტაციების იდენტიფიცირება და გავრცელება – ცირკოს დიაგრამა
სიმსივნის ანალიზი: კლონური შტოები