-
მეტაგენომიური თანმიმდევრობა (NGS)
მეტაგენომი გულისხმობს ორგანიზმების შერეული საზოგადოების მთლიანი გენეტიკური მასალის კრებულს, როგორიცაა გარემოს მეტაგენომი, ადამიანის მეტაგენომი და ა.შ. იგი შეიცავს როგორც კულტივირებადი, ასევე დაუმუშავებელი მიკროორგანიზმების გენომებს.მეტაგენომიური თანმიმდევრობა არის მოლეკულური ინსტრუმენტი, რომელიც გამოიყენება გარემოს ნიმუშებიდან ამოღებული შერეული გენომის მასალების გასაანალიზებლად, რომელიც იძლევა დეტალურ ინფორმაციას სახეობების მრავალფეროვნებისა და სიმრავლის, პოპულაციის სტრუქტურის, ფილოგენეტიკური ურთიერთობის, ფუნქციური გენების და გარემო ფაქტორებთან კორელაციის ქსელის შესახებ.
Პლატფორმა:Illumina NovaSeq6000
-
მეტაგენომიური თანმიმდევრობა-ნანოპორი
მეტაგენომიკა არის მოლეკულური ინსტრუმენტი, რომელიც გამოიყენება გარემოს ნიმუშებიდან ამოღებული შერეული გენომის მასალების გასაანალიზებლად, რომელიც გვაწვდის დეტალურ ინფორმაციას სახეობების მრავალფეროვნებისა და სიმრავლის, პოპულაციის სტრუქტურის, ფილოგენეტიკური კავშირის, ფუნქციური გენების და გარემო ფაქტორებთან კორელაციის ქსელში და ა.შ. მეტაგენომიური კვლევებისთვის.მისი შესანიშნავი შესრულება წაკითხვის სიგრძეში მნიშვნელოვნად აძლიერებს ქვედა ნაკადის მეტაგენომიურ ანალიზს, განსაკუთრებით მეტაგენომის შეკრებას.წაკითხვის სიგრძის უპირატესობების გათვალისწინებით, ნანოპორზე დაფუძნებული მეტაგენომიური კვლევა შეუძლია მიაღწიოს უფრო უწყვეტ აწყობას თოფის მეტაგენომიკასთან შედარებით.გამოქვეყნდა, რომ ნანოპორზე დაფუძნებული მეტაგენომიკა წარმატებით წარმოქმნის სრულ და დახურულ ბაქტერიულ გენომებს მიკრობიომებიდან (Moss, EL, et. al.,Nature Biotech, 2020)
Პლატფორმა:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S და 18S rRNA ქვეგანყოფილება, რომელიც შეიცავს როგორც მაღალკონსერვაციულ, ისე ჰიპერცვლადი რეგიონებს, არის სრულყოფილი მოლეკულური თითის ანაბეჭდი პროკარიოტული და ევკარიოტული ორგანიზმების იდენტიფიკაციისთვის.თანმიმდევრობის უპირატესობით, ამ ამპლიკონების დამიზნება შესაძლებელია კონსერვაციულ ნაწილებზე დაყრდნობით და ჰიპერცვლადი რეგიონები შეიძლება სრულად დახასიათდეს მიკრობული იდენტიფიკაციისთვის, რაც ხელს უწყობს კვლევებს, რომლებიც მოიცავს მიკრობული მრავალფეროვნების ანალიზს, ტაქსონომიას, ფილოგენიას და ა.შ. ერთმოლეკულური რეალურ დროში (SMRT ) PacBio პლატფორმის თანმიმდევრობა საშუალებას გაძლევთ მიიღოთ მაღალი სიზუსტით გრძელი წაკითხვები, რომლებიც შეიძლება დაფარონ სრულმეტრაჟიანი ამპლიკონები (დაახლოებით 1,5 კბ).გენეტიკური ველის გაფართოებულმა ხედვამ მნიშვნელოვნად გაზარდა ბაქტერიების ან სოკოების საზოგადოებაში სახეობების ანოტაციის გარჩევადობა.
Პლატფორმა:PacBio გაგრძელება II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS ამპლიკონების თანმიმდევრობა მიზნად ისახავს ფილოგენიის, ტაქსონომიისა და სახეობების სიმრავლის გამოვლენას მიკრობულ საზოგადოებაში, დიასახლისობის გენეტიკური მარკერების PCR პროდუქტების გამოკვლევით, რომლებიც შეიცავს როგორც მაღალცვალებად, ისე ჰიპერცვლადი ნაწილებს.Woeses et al-ის მიერ (1977) ამ სრულყოფილი მოლეკულური თითის ანაბეჭდის დანერგვა აძლიერებს იზოლაციისგან თავისუფალი მიკრობიომის პროფილირებას.16S (ბაქტერიები), 18S (სოკოები) და შიდა ტრანსკრიბირებული სპაზერის (ITS, სოკოების) თანმიმდევრობა იძლევა როგორც უხვი, ასევე იშვიათი და ამოუცნობი სახეობების იდენტიფიცირების საშუალებას.ეს ტექნოლოგია გახდა ფართოდ გამოყენებული და ძირითადი ინსტრუმენტი სხვადასხვა გარემოში დიფერენციალური მიკრობული შემადგენლობის იდენტიფიცირებისთვის, როგორიცაა ადამიანის პირი, ნაწლავები, განავალი და ა.შ.
Პლატფორმა:Illumina NovaSeq6000
-
ბაქტერიული და სოკოვანი მთლიანი გენომის ხელახალი თანმიმდევრობა
ბაქტერიული და სოკოვანი მთლიანი გენომის ხელახალი თანმიმდევრობა არის კრიტიკული ინსტრუმენტი ცნობილი ბაქტერიისა და სოკოების გენომის დასასრულებლად, ასევე მრავალი გენომის შესადარებლად ან ახალი ორგანიზმების გენომის გამოსათვლელად.დიდი მნიშვნელობა აქვს ბაქტერიებისა და სოკოების მთელი გენომის თანმიმდევრობას, რათა შეიქმნას ზუსტი საცნობარო გენომები, ჩატარდეს მიკრობული იდენტიფიკაცია და გენომის სხვა შედარებითი კვლევები.
პლატფორმა: Illumina NovaSeq 6000
-
სოკოს გენომი
Biomarker Technologies უზრუნველყოფს გენომის კვლევას, წვრილ გენომს და სოკოს სრულ გენომს, რაც დამოკიდებულია კვლევის კონკრეტულ მიზანზე.გენომის თანმიმდევრობა, აწყობა და ფუნქციური ანოტაცია მიიღწევა შემდეგი თაობის თანმიმდევრობის + მესამე თაობის თანმიმდევრობის კომბინაციით, მაღალი დონის გენომის შეკრების მისაღწევად.Hi-C ტექნოლოგია ასევე შეიძლება გამოყენებულ იქნას გენომის შეკრების გასაადვილებლად ქრომოსომის დონეზე.
Პლატფორმა:PacBio გაგრძელება II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
ბაქტერიების სრული გენომი
Biomarker Technologies უზრუნველყოფს თანმიმდევრობის სერვისს ბაქტერიების სრული გენომის კონსტრუქციაზე ნულოვანი უფსკრულით.ბაქტერიების სრული გენომის კონსტრუქციის ძირითადი სამუშაო ნაკადი მოიცავს მესამე თაობის თანმიმდევრობას, აწყობას, ფუნქციურ ანოტაციას და მოწინავე ბიოინფორმატიულ ანალიზს, რომელიც ასრულებს კონკრეტულ კვლევის მიზნებს.ბაქტერიების გენომის უფრო ყოვლისმომცველი პროფილირება საშუალებას აძლევს გამოავლინოს ფუნდამენტური მექანიზმები, რომლებიც ემყარება მათ ბიოლოგიურ პროცესებს, რაც ასევე შეიძლება იყოს ღირებული მითითება გენომიური კვლევებისთვის უფრო მაღალ ევკარიოტულ სახეობებში.
Პლატფორმა:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio გაგრძელება II
