პაკბიო სრული სიგრძის ტრანსკრიპტომი

PacBio-ს სრული სიგრძის ტრანსკრიპტომის სეკვენირება, Isoseq, საშუალებას იძლევა ტრანსკრიპტის იზოფორმების ზუსტი იდენტიფიცირების, ალტერნატიული პოლიადენილაციისა და სპლაისინგის შესახებ ინფორმაციის მოწოდების და გენის ექსპრესიის უფრო ზუსტი ანალიზის ჩატარების. BMKCloud PacBio-ს სრული სიგრძის ტრანსკრიპტომის პროექტი შექმნილია ცირკულარული კონსენსუსური სეკვენირების (CCS) რეჟიმში სეკვენირებული cDNA ბიბლიოთეკების ანალიზისთვის და სრული სიგრძის არაქიმერული (FLNC) თანმიმდევრობების იდენტიფიცირებისთვის, რომლებიც შემდეგ არაზედმეტ ტრანსკრიპტებად ჯგუფდება. შემდგომი BUSCO ანალიზი აფასებს ტრანსკრიპტომის აწყობის სისრულეს. აწყობილი ტრანსკრიპტომიდან ტარდება მრავალი ანალიზი: ალტერნატიული სპლაისინგი, მარტივი თანმიმდევრობის გამეორება (SSR), lncRNA-ს და შესაბამისი სამიზნე გენების პროგნოზირება, ახალი გენების პროგნოზირება, გენის ოჯახის ანალიზი, ტრანსკრიფციის ფაქტორების ანალიზი და ტრანსკრიპტების ფუნქციური ანოტაცია.