BMKCloud Log in
ბანერი-03

პროდუქტები

პროკარიოტული რნმ-ის თანმიმდევრობა

პროკარიოტული რნმ-ის თანმიმდევრობა იყენებს შემდეგი თაობის თანმიმდევრობას (NGS), რათა გამოავლინოს რნმ-ის არსებობა და რაოდენობა მოცემულ მომენტში, ცვალებადი უჯრედული ტრანსკრიპტომის ანალიზით.ჩვენი კომპანიის პროკარიოტული რნმ-ის თანმიმდევრობა, კონკრეტულად მიზნად ისახავს პროკარიოტებს საცნობარო გენომებით, გთავაზობთ ტრანსკრიპტომის პროფილირებას, გენის სტრუქტურის ანალიზს და ა.შ. ის ფართოდ გამოიყენება საბაზისო მეცნიერების კვლევაში, წამლების კვლევასა და განვითარებაში და სხვა.

პლატფორმა: Illumina NovaSeq პლატფორმა


სერვისის დეტალები

სერვისის სპეციფიკაციები

პლატფორმა: Illumina NovaSeq პლატფორმა, PE150

ბიბლიოთეკის ტიპი: 350bp ჩასმული cDNA ბიბლიოთეკა (დამოკიდებულია პიკის განაწილებაზე)

თანმიმდევრობის სტრატეგია: Paired-End 150 bp

რეკომენდირებული მონაცემთა მოცულობა: 2 გბ ნედლეული მონაცემები/ნიმუში

ბიოინფორმატიკა

(1) თანმიმდევრობის მონაცემების ხარისხის კონტროლი: ნუკლეოტიდის განაწილება, ბაზის ხარისხის განაწილება, rRNA თანაფარდობის შეფასება;

(2) თანმიმდევრობის გასწორების ანალიზი: გასწორების შედეგების სტატისტიკა, თანმიმდევრობის გაჯერება, თანმიმდევრობის დაფარვა;

(3) საცნობარო გენომის ანოტაცია (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) გამოხატვის ანალიზი: გამოხატვის განაწილება (ორი ან მეტი ნიმუშით), ექსპრესიის ანალიზი ნიმუშებს შორის (ვენის ანალიზი, კორელაციური ანალიზი, PCA ანალიზი);

(5) დიფერენციალური გამოხატვის ანალიზი (ორი ან მეტი ნიმუშით);

(6) გენების ნაკრების ანალიზი: ვენის ანალიზი, კლასტერული ანალიზი, ფუნქციის ანოტაციის ანალიზი (COG, GO, KEGG), ფუნქციის გამდიდრების ანალიზი (GO, KEGG), ფუნქციის გამდიდრების აკორდალური გრაფიკი, Ipath ანალიზი;

(7) sRNA ანალიზი: sRNA პროგნოზირება, sRNA ანოტაცია (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA მეორადი სტრუქტურის პროგნოზირება, sRNA სამიზნე გენის პროგნოზირება;

(8) ტრანსკრიპტის სტრუქტურის ანალიზი: ოპერონის ანალიზი, ტრანსკრიფციის დაწყების და დასრულების ადგილების პროგნოზირება, UTR ანოტაცია და ანალიზი, პრომოტერის თანმიმდევრობის პროგნოზირება, SNP/InDel ანალიზი (SNP/InDel ანოტაცია, SNP/InDel რეგიონული განაწილება, SNP სტატისტიკა).

სერვისის სამუშაო ნაკადი

ნიმუშის მიწოდება

ნიმუშის მიწოდება

ბიბლიოთეკის მომზადება

ბიბლიოთეკის მშენებლობა

თანმიმდევრობა

თანმიმდევრობა

Მონაცემთა ანალიზი

Მონაცემთა ანალიზი

გაყიდვის შემდგომი მომსახურება

გაყიდვის შემდგომი მომსახურება


  • წინა:
  • შემდეგი:

  • მიიღეთ ციტატა

    დაწერეთ თქვენი მესიჯი აქ და გამოგვიგზავნეთ

    გამოგვიგზავნეთ თქვენი შეტყობინება: