პროტეომიკა
მახასიათებლები
● თვისებრივი პროტეომიკა: იყენებს LC-MS/MS-ს კომპლექსურ ნიმუშებში ცილის შემადგენლობის დასადგენად (SDS-PAGE გელის ზოლები, IP, Co-IP, Pull-down). უპირატესობები: ნიმუშების რაოდენობის შეზღუდვა არ არსებობს, სწრაფი აღმოჩენა, ნიმუშის მარტივი დამუშავება, მაღალი გამტარუნარიანობა და დაბალი სიმრავლის ცილების აღმოჩენის შესაძლებლობა.
● ეტიკეტის გარეშე რაოდენობრივი პროტეომიკა: არაეტიკეტირებული ტექნოლოგია ინდივიდუალური ნიმუშების დეტექტირებით. ადგენს ცილების რაოდენობრივ განსაზღვრას მას-სპექტრომეტრიის მონაცემებში პეპტიდური სიგნალის ინტენსივობის შედარებით. უპირატესობები: მარტივი ოპერაცია, მაღალი გამტარუნარიანობა (ნიმუშების რაოდენობის შეზღუდვის გარეშე) და ფართო გამოყენებადობა (შესაფერისი სახეობებს შორის ცილების დიფერენციალური შედარებისთვის).
● DIA რაოდენობრივი პროტეომიკა: იყენებს მონაცემებზე დამოუკიდებელი შეგროვების (DIA) რეჟიმს, სკანირებას უკეთებს ყველა იონს სეგმენტირებულ ფანჯრებში, რათა შეინახოს იონების შესახებ სრული ინფორმაცია. უპირატესობები: უკეთესი განმეორებადობა, ცილის უფრო მაღალი დაფარვა და უფრო ზუსტი რაოდენობრივი განსაზღვრა, ვიდრე DDA რეჟიმი (TMT/Label Free), იდეალურია დიდი ნიმუშის კვლევებისთვის.
● 4D-Label Free რაოდენობრივი პროტეომიკა/4D-DIA რაოდენობრივი პროტეომიკა: დაფუძნებულია Bruker timsTOF მას-სპექტრომეტრზე, რომელიც ტრადიციულ 3D გამოყოფას ემატება იონების მობილურობა (შეჯახების განივი კვეთა). უპირატესობები: გაუმჯობესებული იონების გამოყენება და სიზუსტე, დაფარვის სიღრმის, მგრძნობელობის და გამტარუნარიანობის ყოვლისმომცველი გაუმჯობესება; უფრო მაღალი იდენტიფიკაციის სიღრმე ტრადიციულ 3D მეთოდთან შედარებით.
● Astral Label Free რაოდენობრივი პროტეომიკა/Astral DIA რაოდენობრივი პროტეომიკა: დაფუძნებულია Orbitrap™ Astral™ მაღალი გარჩევადობის მას-სპექტრომეტრზე. უპირატესობები: უფრო მაღალი გამტარუნარიანობა (100+ ნიმუში/დღეში 8-წუთიანი გრადიენტით), უფრო ღრმა დაფარვა (8,000+ ცილა აღმოჩენილია Hela უჯრედებში 8 წუთში) და უფრო მაღალი მგრძნობელობა (საჭიროა ნაკლები ნიმუში).
● TMT რაოდენობრივი პროტეომიკა: იყენებს 18 იზოტოპურ ტეგს პეპტიდების მონიშვნისთვის 18 ნიმუშის ერთდროული აღმოჩენისთვის. უპირატესობები: მაღალი სტაბილურობა (ინსტრუმენტის სტაბილურობის მინიმალური ჩარევა, სისტემის მცირე შეცდომა) და მაღალი მგრძნობელობა (ფრაქციონაცია ამცირებს ნიმუშის სირთულეს, აუმჯობესებს ცილის მცირე რაოდენობით აღმოჩენას).
● PRM მიზნობრივი პროტეომიკა: მაღალი გარჩევადობის მიზნობრივი ტექნოლოგია სამიზნე ცილებ/პეპტიდების შერჩევითი აღმოსაჩენად. უპირატესობები: იძლევა რაოდენობრივი პროტეომიკის შედეგების ფარდობითი/აბსოლუტური რაოდენობრივი განსაზღვრისა და ვერიფიკაციის საშუალებას; ანტისხეულების შეზღუდვის არარსებობა, უფრო ფართო გამოყენებადობა, ვიდრე Western Blot-ი და ELISA.
უპირატესობები
● მოწინავე აღჭურვილობა: აღჭურვა როგორც ჩვეულებრივი პროტეომიკის პლატფორმებით, ასევე მოწინავე მაღალი სიღრმის მას-სპექტრომეტრებით (მაგ., 4D, Astral).
● სტაბილური აღმოჩენა: მკაცრი ხარისხის კონტროლის სისტემები უზრუნველყოფენ თანმიმდევრულ და სტაბილურ ტესტირების პროცესებს.
● სანდო შედეგები: ერთდროული თვისებრივი და რაოდენობრივი ანალიზი იძლევა ფარდობით ექსპრესიას, მოლეკულურ წონას, რაოდენობას და სხვა მნიშვნელოვან მონაცემებს თითოეული ჯგუფისთვის.
● მაღალი ავტომატიზაცია: ავტომატიზირებული LC-MS სისტემები უზრუნველყოფს სწრაფ ანალიზს და შესანიშნავ გამოყოფის შესრულებას.
სერვისის სპეციფიკაციები
| არამიზნობრივი პროტეომიკის ტექნიკის შედარება | ||||
| ეტიკეტის გარეშე | დია | TMT | ||
| ეტიკეტირება | NO | NO | კი | |
| მონაცემთა სკანირების რეჟიმი | დღიური ნორმა | დღიური ნორმა | დია | დღიური ნორმა |
| რეპროდუცირებადობა | ქვედა | მაღალი | მაღალი | |
| მგრძნობელობა | ქვედა | მაღალი | მაღალი | |
| მულტიპლექსირება | NO | კი | NO | კი |
| აპლიკაცია | ცილის არსებობის/არარსებობის შედარება | მასშტაბური ნიმუშები | ნიმუშების სხვადასხვა პარტიის ანალიზი | დიფერენციალური ცილის ექსპრესიის შედარება იმავე სახეობასა და ქსოვილში |
| სიზუსტე | ★ | ★★(4D/Astral DlA ★★★) | ★★ | |
| აღმოჩენის რაოდენობა | ★ | ★★(4D/Astral D|A★★★) | ★★ | |
ნიმუშის მოთხოვნები
გაინტერესებთ, აკმაყოფილებს თუ არა თქვენი ნიმუშები ჩვენს კრიტერიუმებს? დააჭირეთ აქ ჩვენი...უახლესი ნიმუშის მოთხოვნები.
მომსახურების სამუშაო ნაკადი
ნიმუშების კოლექცია
ცილის ექსტრაქცია
ფერმენტული მონელება
გამოყოფა
მონაცემთა შეგროვება
მონაცემთა ანალიზი
მონაცემთა მიწოდება
თვისებრივი პროტეომიკა
1. ცილის ხსნარი/გელი: ხარისხობრივი შედეგების ცხრილი
2. მონაცემთა ბაზის ძიების შედეგები
2.1 მონაცემთა ბაზის ძიებაში შესაბამისი პეპტიდური სეგმენტების სია
2.2 მონაცემთა ბაზაში ძიებაში შესაბამისი ცილების სია
2.3 მონაცემთა ბაზის ძიებაში დაემთხვა მოდიფიკაციების სია (ფოსფორილირება, უბიკვიტინაცია და ა.შ.)
3. ნედლი მონაცემები
რაოდენობრივი პროტეომიკა(ეტიკეტის გარეშე/DIA/TMT)
1. მონაცემთა წინასწარი დამუშავება
1.1 ცილების მონაცემთა ბაზაში ძიება
2. ცილის ექსპრესიის ანალიზი
2.1 ძირითადი კომპონენტების ანალიზი (PCA)
2.2 ფარდობითი სტანდარტული გადახრა (RSD)
2.3 K-საშუალო ტენდენციის განაწილება
2.4 რეპროდუცირების შეფასება
2.5 ცილის ექსპრესიის სითბური რუკა
3. ფუნქციური ანოტაცია
3.1 ფუნქციური ანოტაციის გადატანა
3.2 KEGG ფუნქციური ანოტაცია
3.3 COG ფუნქციური ანოტაცია
3.4 GOslim-ის ფუნქციური ანოტაცია
3.5 Pfam ცილის სტრუქტურის დომენის ანოტაცია
4. ცილის დიფერენციალური ანალიზი (ბიოლოგიური რეპლიკაციები ≥ 3)
4.1 ცილის დიფერენციალური ანალიზის შედეგები
4.2 ცილის დიფერენციალური დაკეცვის ცვლილებების (FC) განაწილება
4.3 ცილის დიფერენციალური რაოდენობის სტატისტიკური ანალიზი
4.4 დიფერენციალური ცილოვანი ვულკანის დიაგრამა
4.5 დიფერენციალური ცილების კლასტერიზაციის სითბური რუკა
4.6 დიფერენციალური ცილის GO ფუნქციური ანოტაცია და გამდიდრების ანალიზი
4.7 დიფერენციალური ცილის KEGG ფუნქციური ანოტაცია და გამდიდრების ანალიზი
4.8 დიფერენციალური ცილის COG ფუნქციური ანოტაცია
4.9 დიფერენციალური ცილის GOslim ანოტაცია და გამდიდრების ანალიზი
4.10 დიფერენციალური ცილის სტრუქტურის დომენის ანოტაცია და გამდიდრების ანალიზი
5. ცილოვანი ქსელის ურთიერთქმედების ანალიზი
6. ცილოვანი რეაქტომის გზის ანოტაცია
7. სიგნალის პეპტიდის პროგნოზირება
8. ცილების უჯრედქვეშა ლოკალიზაცია
რაოდენობრივი პროტეომიკა(PRM)
1. PRM ცილის რაოდენობრივი განსაზღვრის შედეგები
1.1 რაოდენობრივი შეფასების შედეგების მიმოხილვა
1.2 პეპტიდური სეგმენტების ფრაგმენტის იონური პიკის ფართობების განაწილება
რაოდენობრივი პროტეომიკა
1.ცილის ექსპრესიის ანალიზი
↑ძირითადი კომპონენტების ანალიზი (PCA)↑ფარდობითი სტანდარტული გადახრა (RSD)
↑K-საშუალო ტენდენციის განაწილება ↑კორელაციაAანალიზიPცილაEგამოხატვაLდონეები
↑ ცილის ექსპრესიის სითბური რუკა
2. ფუნქციური ანოტაცია
↑GO ფუნქციური ანოტაცია↑KEGG ფუნქციური ანოტაცია
↑ COG ფუნქციური ანოტაცია ↑ GOslim ფუნქციური ანოტაცია
↑ Pfam ცილის სტრუქტურის დომენის ანოტაცია
3.ცილოვანი ქსელის ურთიერთქმედების ანალიზი
↑ ცილოვანი ქსელის ურთიერთქმედების ანალიზი
4.სიგნალის პეპტიდის პროგნოზირება
↑ სიგნალის პეპტიდის პროგნოზირება
5. ცილების უჯრედქვეშა ლოკალიზაცია
↑ცილების უჯრედქვეშა ლოკალიზაცია
| 2025 წელი | მეზენქიმური ღეროვანი უჯრედებიდან მიღებული აპოპტოზური ვეზიკულები ამსუბუქებენ ჰიპერმგრძნობელობის რეაქციებს CD8+ T უჯრედების აპოპტოზის ინდუქციის გზით კალციუმის გადატვირთვისა და მიტოქონდრიული დისფუნქციის გზით | მოწინავე მეცნიერება |
| 2024 წელი | ინტეგრირებული მულტი-ომიკა აჩვენებს სიმსივნის საწინააღმდეგო გაძლიერებულ ეფექტურობას | ტრანსლაციური ონკოლოგია |
| 2024 წელი | მულტი-ომიკური ანალიზი ავლენს მეტაბოლიზმის გზების გამორჩეულ მახასიათებლებს, რომლებიც მხარს უჭერენ გიგანტური გოგრის ნაყოფის ზომა და ფერის ვარიაცია | საერთაშორისო მოლ. მეცნიერება. |
| 2024 წელი | ტრანსკრიპტომისა და მეტაბოლომის პროფილირება ახალ ინფორმაციას გვაწვდის უმოქმედო კუნთების ატროფიის შესახებ ქათმის ხორცში: სწრაფად შეკუმშვადი კუნთოვანი ბოჭკოების პოტენციური როლი | საერთაშორისო მოლ. მეცნიერება. |
| 2023 წელი | მულტიომიკური ანალიზი ავლენს ტეტრაციკლინის გავლენას ჭვავის ბალახის ფესვის ზრდაზე. | საშიში მასალების ჟურნალი |
