ერთბირთვიანი რნმ-ის თანმიმდევრობა
ტექნიკური პრინციპი
ბირთვების იზოლაცია მიიღწევა 10× Genomics ChromiumTM, რომელიც შედგება რვა არხიანი მიკროფლიდიკური სისტემით ორმაგი გადაკვეთით.ამ სისტემაში გელის მარცვლები შტრიხკოდებითა და პრაიმერით, ფერმენტებითა და ერთი ბირთვით არის ჩასმული ნანოლიტრის ზომის ზეთის წვეთში, რაც წარმოქმნის გელის მძივს-ემულსიას (GEM).GEM-ის ჩამოყალიბების შემდეგ, უჯრედების ლიზისი და შტრიხკოდების გათავისუფლება ხორციელდება თითოეულ GEM-ში.mRNA გადაიწერება საპირისპიროდ cDNA მოლეკულებში 10× შტრიხკოდებით და UMI-ით, რომლებიც შემდგომ ექვემდებარება სტანდარტული თანმიმდევრობის ბიბლიოთეკის მშენებლობას.
ქსოვილი არ არის შესაფერისი ერთუჯრედიანი სუსპენზიის მოსამზადებლად
| უჯრედი / ქსოვილი | მიზეზი |
| გაუხსნელი გაყინული ქსოვილი | ახალი ან დიდი ხნის განმავლობაში შენახული ორგანიზაციების მიღება შეუძლებელია |
| კუნთოვანი უჯრედი, მეგაკარიოციტი, ცხიმი… | უჯრედის დიამეტრი ძალიან დიდია ინსტრუმენტში შესასვლელად |
| ღვიძლი… | ზედმეტად მყიფეა გასატეხად, არ შეუძლია ცალკეული უჯრედების გარჩევა |
| ნეირონის უჯრედი, ტვინი… | უფრო მგრძნობიარე, ადვილად სტრესი, შეცვლის თანმიმდევრობის შედეგებს |
| პანკრეასი, ფარისებრი... | მდიდარია ენდოგენური ფერმენტებით, რომლებიც გავლენას ახდენენ ერთუჯრედიანი სუსპენზიის წარმოებაზე |
ერთუჯრედიანი vs ერთუჯრედიანი
| ერთბირთვიანი | ერთუჯრედიანი |
| უჯრედის შეუზღუდავი დიამეტრი | უჯრედის დიამეტრი: 10-40 მკმ |
| მასალა შეიძლება იყოს გაყინული ქსოვილი | მასალა უნდა იყოს ახალი ქსოვილი |
| გაყინული უჯრედების დაბალი სტრესი | ფერმენტულმა მკურნალობამ შეიძლება გამოიწვიოს უჯრედების სტრესული რეაქცია |
| არ არის საჭირო სისხლის წითელი უჯრედების ამოღება | სისხლის წითელი უჯრედები უნდა მოიხსნას |
| ბირთვული გამოხატავს ბიოინფორმაციას | მთელი უჯრედი გამოხატავს ბიოინფორმაციას |
სერვისის სპეციფიკაციები
| ბიბლიოთეკა | თანმიმდევრობის სტრატეგია | მონაცემთა მოცულობა | ნიმუშის მოთხოვნები | ქსოვილის |
| 10× Genomics ერთ ბირთვიანი ბიბლიოთეკა | 10x Genomics -Illumina PE150 | 100000 წაკითხვა/უჯრედი დაახლ.100-200 გბ | უჯრედის ნომერი: >2×105 უჯრედის კონს.700-1200 უჯრედ/მკლ-ზე | ≥ 200 მგ |
ნიმუშის მომზადების ინსტრუქციისა და მომსახურების სამუშაო პროცესის შესახებ დამატებითი ინფორმაციისთვის, გთხოვთ, თავისუფლად ესაუბროთ აBMKGENE ექსპერტი
სერვისის სამუშაო ნაკადი
ექსპერიმენტის დიზაინი
ნიმუშის მიწოდება
ბირთვების იზოლაცია
ბიბლიოთეკის მშენებლობა
თანმიმდევრობა
Მონაცემთა ანალიზი
გაყიდვის შემდგომი მომსახურება
1.ლაქების დაჯგუფება
2. მარკერის გამოხატვის სიმრავლის კლასტერული სითბოს რუკა
3. Maker გენის განაწილება სხვადასხვა კლასტერებში
4.უჯრედის ტრაექტორიის ანალიზი/ფსევდოდრომი
