● Секьюналыс алаңы: Pacbio Revio
● ТЕХНАЛЫҚ РЕЖИМ: ОКҚ (Hifi оқылады)
● Мақсатты аймақты күшейту, содан кейін Hifi SMRT Bell Cling кітапханасын дайындауға дейін ампликондарды байланыстыру
●Таксономиялық қаулы жоғары: тХан қысқа ампликонның реттілігі,Түрінің деңгейіндегі OTU жіктеуіштерін жоғарылату.
●Жоғары қоңырау шалу: Pacbio CCS режимі (HiFi оқылады).
●Оқшаулаусыз: Қоршаған орта үлгілеріндегі микробты композицияны тез анықтау.
●Кеңінен қолданылатын: Микробтық қауымдастық алуан түрлі зерттеулер.
●Жалпы биоинформатикалық талдау: Qiime2-дің соңғы2 пакеті (микробты экологиямен сандық түсінік) Деректер базасы, аннотация, ОТУ / ASV тұрғысынан әр түрлі талдаулармен.
●Кең сараптама: Жыл сайынғы ампликонның мыңдаған біршама реттелетін жобаларымен Б.М.Гген онжылдық тәжірибе, жоғары білікті талдау тобы, жан-жақты мазмұн және сатылымнан кейінгі тамаша қолдау әкеледі.
Кітапхана | САЯСАТ САЯСАТЫ | Деректер ұсынылады |
Ампликон | Pacbio Revio | 10/30/50 k Тегтер (ОКҚ) |
Концентрация (NG / мкл) | Жалпы сома (мкг) | Көлемі (мкл) |
≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
Үлгілерді сұйық азотпен 3-4 сағат бойы мұздатыңыз және сұйық азот немесе -80 градусқа ұзақ мерзімді броньдау үшін сақтаңыз. Құрғақ мұзбен жеткізу үшін үлгі қажет.
Келесі талдауды қамтиды:
● Деректердің сапасын басқару
● OTU кластерлері / шу (ASV)
Antu аннотациясы
● Альфа әртүрлілігін талдау: бірнеше индекстер, соның ішінде Shannon, Simpson және ACE.
● Бета әртүрлілігін талдау
● Топтық талдау
● Корреляциялық талдау: қоршаған орта факторлары мен композиция мен әртүрлілік арасында
● 16s функционалды генді болжау
Таксономиялық таралу гистограммасы
Қоғамдық тарату филогенетикалық ағаш
Альфа әртүрлілігін талдау: ACE
Бета әртүрлілігін талдау: PCOA
Топтық талдау: АНОВА
Pacbio-мен Б.М.Кгеннің ампликонның реттелетін қызметтері ұсынатын жетістіктерді зерттеңіз.
Гао, Х. және Ванг, Х. (2023) «Альпілік шалғын», ашыту, ашыту бойынша екі өсіп келе жатқан екі кезеңмен әр түрлі фенологияға (Rumen Rumens Bs. Rushysy)) салыстырмалы талдаумен салыстырмалы талдау және 9 ( 1), б. 16. DOI: 10.3390 / Fermentation9010016 / S1.
LI, S. және Al. (2023) 'Шөлді топырақтардағы шөлді топырақтардағы шөлді топырақтарда, сонымен қатар жоғары ажыратымдылықтағы анализдерді және NPJ биофильмдер мен микробиомаларды қолдана отырып, 2023 9: 1, 9 (1), 1-14 бет. Doi: 10.1038 / S41522-023-00439-8.
Mu, L. және Al. (2022) 'Ашықтану сипаттамаларына, бактериялық әртүрлілікке, бактериялық әртүрлілікке, жоңышқа, күріш сабанмен және бидай кебекімен, азық-түлік және ауылшаруашылық ғылымдарының журналына әсері, 102 (4), 1475 бет. 1487. Doi: 10.1002 / jsfa.11482.
Ян, Ж. және басқалар. (2023) «Тотығу стрессінің биомаркерлері мен ішек микроботаларының өзара әрекеттесуі Sonchus Brachyotus DC сығындыларының антиоксидантты әсерінен. Ересектерге арналған ішек тотығу стрессінде, «антиоксиданттар», 2023, том. 12, 192, 12 (1), б. 192. Doi: 10.3390 / Antiox12010192.