条形 баннер-03

Құралдар

16s / 18s / оның ампликонның тізбекті-пакбио

16- және 18-ші RRNA гендері, ішкі транскриптпен (оның) аймағы (оның) аймағы, жоғары сақталған және гипер-айнымалы аймақтардың үйлесіміне, оларды прокариотикалық және эукариотты организмдерді сипаттауға арналған ең тығыз молекулалық іздестіру маркерлері ретінде қызмет етеді. Осы аймақтардың күшейтілуі және реттілігі әртүрлі экожүйелердегі микробтық құрамды және әртүрлілікті зерттеуге арналған оқшаулаусыз тәсіл ұсынады. Иллюзинаның реттілігі әдетте 16-ші және оның V3-V4 сияқты қысқа гиперворлық аймақтарға бағытталған кезде, оның 1-ін және оның 1-ге жуық таксономиялық аннотацияның толық ұзындығы 16-дан, 18-ші және оның толық ұзақтығы бар екендігі көрсетілді. Бұл жан-жақты тәсіл түрлердің сәйкестендірілуіне дейінгі шешім деңгейіне қол жеткізу үшін дәл жіктелген тізбектің жоғары пайыздық мөлшерлемелеріне әкеледі. Pacbio-дың бір молекуласы нақты уақыттағы (SMRT) Толығырақ платформа, жоғары деңгейлі ампликондарды қамтитын жоғары ұзын оқылымдарды (HIFI), жарықтандырудың дәлдігін қамтамасыз ететін жоғары ұзын оқылымдарды (HIFI) ұстанады. Бұл мүмкіндік зерттеушілерге теңдестірмеген артықшылыққа ие болуға мүмкіндік береді - генетикалық ландшафттың панорамалық көрінісі. Ұзартылған қамту, әсіресе, әсіресе, әсіресе бактериялар немесе саңырауқұлақ қауымдастықтарының ішінде, әсіресе бактериалды немесе саңырауқұлақтардың ішінде, сонымен қатар микробтық популяциялардың күрделі түсінуіне мүмкіндік береді.


Қызмет туралы мәліметтер

Биоинформатика

Демо нәтижелері

Таңдаулы жарияланымдар

Қызмет көрсету ерекшеліктері

● Секьюналыс алаңы: Pacbio Revio

● ТЕХНАЛЫҚ РЕЖИМ: ОКҚ (Hifi оқылады)

● Мақсатты аймақты күшейту, содан кейін Hifi SMRT Bell Cling кітапханасын дайындауға дейін ампликондарды байланыстыру

Қызметтің артықшылықтары

Таксономиялық қаулы жоғары: тХан қысқа ампликонның реттілігі,Түрінің деңгейіндегі OTU жіктеуіштерін жоғарылату.

Жоғары қоңырау шалу: Pacbio CCS режимі (HiFi оқылады).

Оқшаулаусыз: Қоршаған орта үлгілеріндегі микробты композицияны тез анықтау.

Кеңінен қолданылатын: Микробтық қауымдастық алуан түрлі зерттеулер.

Жалпы биоинформатикалық талдау: Qiime2-дің соңғы2 пакеті (микробты экологиямен сандық түсінік) Деректер базасы, аннотация, ОТУ / ASV тұрғысынан әр түрлі талдаулармен.

Кең сараптама: Жыл сайынғы ампликонның мыңдаған біршама реттелетін жобаларымен Б.М.Гген онжылдық тәжірибе, жоғары білікті талдау тобы, жан-жақты мазмұн және сатылымнан кейінгі тамаша қолдау әкеледі.

Қызмет көрсету ерекшеліктері

Кітапхана

САЯСАТ САЯСАТЫ

Деректер ұсынылады

Ампликон

Pacbio Revio

10/30/50 k Тегтер (ОКҚ)

Үлгі талаптары

Концентрация (NG / мкл)

Жалпы сома (мкг)

Көлемі (мкл)

≥5

≥0.3

≥20

Ұсынылатын үлгіні жеткізу

Үлгілерді сұйық азотпен 3-4 сағат бойы мұздатыңыз және сұйық азот немесе -80 градусқа ұзақ мерзімді броньдау үшін сақтаңыз. Құрғақ мұзбен жеткізу үшін үлгі қажет.

Қызмет көрсету ағымы

Үлгіні жеткізу

Үлгіні жеткізу

Кітапхананы дайындау

Кітапхана құрылысы

Жүйелі кідіріс

Жүйелі кідіріс

Деректерді талдау

Деректерді талдау

Сатылғаннан кейін

Сатудан кейінгі қызметтер


  • Алдыңғы:
  • Келесі:

  • 流程图第三版 2-02

    Келесі талдауды қамтиды:

    ● Деректердің сапасын басқару

    ● OTU кластерлері / шу (ASV)

    Antu аннотациясы

    ● Альфа әртүрлілігін талдау: бірнеше индекстер, соның ішінде Shannon, Simpson және ACE.

    ● Бета әртүрлілігін талдау

    ● Топтық талдау

    ● Корреляциялық талдау: қоршаған орта факторлары мен композиция мен әртүрлілік арасында

    ● 16s функционалды генді болжау

     

    Таксономиялық таралу гистограммасы

    图片 57

    Қоғамдық тарату филогенетикалық ағаш

    图片 58

    Альфа әртүрлілігін талдау: ACE

    көрсеткіш图片 59

     

    Бета әртүрлілігін талдау: PCOA

    图片 60

     

    Топтық талдау: АНОВА

    图片 61

     

     

     

    Pacbio-мен Б.М.Кгеннің ампликонның реттелетін қызметтері ұсынатын жетістіктерді зерттеңіз.

    Гао, Х. және Ванг, Х. (2023) «Альпілік шалғын», ашыту, ашыту бойынша екі өсіп келе жатқан екі кезеңмен әр түрлі фенологияға (Rumen Rumens Bs. Rushysy)) салыстырмалы талдаумен салыстырмалы талдау және 9 ( 1), б. 16. DOI: 10.3390 / Fermentation9010016 / S1.

    LI, S. және Al. (2023) 'Шөлді топырақтардағы шөлді топырақтардағы шөлді топырақтарда, сонымен қатар жоғары ажыратымдылықтағы анализдерді және NPJ биофильмдер мен микробиомаларды қолдана отырып, 2023 9: 1, 9 (1), 1-14 бет. Doi: 10.1038 / S41522-023-00439-8.

    Mu, L. және Al. (2022) 'Ашықтану сипаттамаларына, бактериялық әртүрлілікке, бактериялық әртүрлілікке, жоңышқа, күріш сабанмен және бидай кебекімен, азық-түлік және ауылшаруашылық ғылымдарының журналына әсері, 102 (4), 1475 бет. 1487. Doi: 10.1002 / jsfa.11482.

    Ян, Ж. және басқалар. (2023) «Тотығу стрессінің биомаркерлері мен ішек микроботаларының өзара әрекеттесуі Sonchus Brachyotus DC сығындыларының антиоксидантты әсерінен. Ересектерге арналған ішек тотығу стрессінде, «антиоксиданттар», 2023, том. 12, 192, 12 (1), б. 192. Doi: 10.3390 / Antiox12010192.

    Баға алыңыз

    Хабарламаңызды мына жерге жазып, бізге жіберіңіз

    Сіздің хабарламаңызды бізге жіберіңіз: