Де Ново бактериялық геномдық құрастыру
Біз 0 олқылықтарға кепілдік беретін бактериялық геномдық құрастыру қызметін ұсынамыз. Бұл Nanopore және Pacbio сияқты ұзақ оқу технологиясын интеграциялау арқылы, мысалы, ингредиенті тексеруге және «Ассамблеяны тексеруге және оны оқылуда қателерді түзетуге арналған қысқа оқитын реттілікпен біріктіре аласыз. Біздің қызметіміз арнайы зерттеу мақсаттарын орындау, функционалды аннотациядан және биоинформатикалық талдаудан толық биоинформатикалық жұмыс процесін ұсынады. Бұл қызмет түрлі генетикалық және геномдық зерттеулер үшін нақты анықтамалық геномдарды әзірлеуге мүмкіндік береді. Бұған қоса, ол штаммды оңтайландыру, генетикалық инженерия және микробтық технологиялық технологияны дамыту, ғылыми түсініктер мен биотехнологиялық инновацияларды жетілдіру үшін сенімді және алшақтық ақысыз мәліметтерді алу үшін негіз болады.
Қызмет көрсету ерекшеліктері
● геномның толықтығының қажетті дәрежесіне байланысты таңдау үшін екі мүмкін нұсқамен.
● геномның жобасы Опция: Иллюминина ПЭ150 көмегімен қысқа оқылған реттілік.
● 0 Gap геномын аяқтаңыз.
● Nanopore Promeethion 48 немесе геномдық құрастыру үшін Pacbio Revio-да ұзақ оқу.
● Иллюмина Новоектегі геномдық тексеру және қателерді түзету (нанопор) немесе геномды құру үшін қысқа оқыңыз.
Қызметтің артықшылықтары
●Нөлдік Gap геномы кепілдендірілген.
●Толық биоинформатика жұмыс процесі:Бұған геномды жинау және бірнеше геномдық элементтерді, функционалды ген аннотациясын және геномдық визуализацияларды, мысалы, цирктер учаскесі.
●Кең сараптама: 20000-нан астам микроб геномдар жиналған, BMKGENE онжылдыққа онжылдық, білікті талдау тобы, жан-жақты мазмұн және сатылымнан кейінгі тамаша қолдау әкеледі.
●Сатудан кейінгі қолдау:Біздің міндеттемелеріміз жобаны аяқтағаннан кейін 3 айдан кейінгі қызмет көрсету мерзімін ұзартады. Осы уақыт ішінде біз нәтижелерге қатысты кез-келген сұраныстарды шешуге бағытталған, ақаулықтарды жою, ақаулықтарды жою, & A сессияларын ұсынамыз.
●Бірнеше реттілік стратегиясы:Зерттеудің әртүрлі мақсаттары мен геномның толықтығының талаптары үшін.
Қызмет көрсету ерекшеліктері
| Қызмет көрсету | САЯСАТ САЯСАТЫ |
| Жобаның геномы | Иллюминина PE150 100x |
| 0 Gap геномы | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio Hifi 30x + Illumina PE150 100x (міндетті емес) |
Үлгі талаптары:
| Концентрация (NG / мкл) | Жалпы сома (мкг) | Көлемі (мкл) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | |
| Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Нанопор | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Илумина | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Бактериялар: ≥3.5x1010 Ұяшықтар
Қызмет көрсету ағымы
Үлгіні жеткізу
Кітапхана құрылысы
Жүйелі кідіріс
Деректерді талдау
Сатудан кейінгі қызметтер
Келесі талдауды қамтиды:
● Деректердің сапасын реттейтін
● геномды құрастыру
● геном компоненттерін талдау: CD-ді болжау және бірнеше геномдық элементтерді болжау
● Бірнеше жалпы мәліметтер базасымен (GO, KEGG және т.б.) және алдыңғы қатарлы мәліметтер базасымен функционалды аннотация (карта, VFDB және т.б.)
● геномдық визуализация
Біз геномды Fasta Fasta форматында және геномды аннотация файлында (gff) ұсынамыз.
Генонез
Генотаның аннотация - Қажаған көмірсулар
Геномды визуализация - Цирк учаскесі
Б.Р. Баккгеннің бактериялық геномдық құрастыру қызметтері басылымдар жинағы арқылы жеңілдетілген жетістіктерді зерттеңіз.
Дай, В.Т. (2023) 'Бактериялар Uniformis F18-22-ді табу,Молекулалық ғылымдардың халықаралық журналы, 24 (19), б. 14669. Doi: 10.3390 / ijms24191469 / s1.
Канг, С. және al. (2021) «Қытайда жануарлар дүниесінен Blaoxa-1 және Blandm-1-мен Blaxa-1 және Blandm-1 алып жүретін мультиргке төзімді протездер:Интегративті зоология, 16 (6), б. 798-809 бет. Doi: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Ванг, tt және al. .Биотехнология журналы, 260, б. 38-41 бет. Doi: 10.1016 / j.jbiotec.2017.09.001.
Ванг, X. et al. (2021) 'Клебсиелланың бірнеше рет репликонға төзімділігі Монтистпен танымал микробқа қарсы гендерді кеңінен тарату',Микробиологиядағы шекаралар, 12, б. 754931. Doi: 10.3389 / FMICB.2021.754931 / Bibtex.
