BMKMANU S1000 кеңістіктік транскриптом
BMKMANU S1000 Кеңістіктік транскриптомның техникалық схемасы
BMKMANU S1000 артықшылықтары
1) Ішкі ұяшықты ажыратымдылық: Әрбір түсіру аймағында диаметрі 2,5 мкм және нүкте орталықтары арасындағы 5 мкм қашықтық бар >2 миллион кеңістіктік штрих-кодталған нүктелер бар, бұл ішкі жасушалық ажыратымдылықпен (5 мкм) кеңістіктік транскриптомды талдауға мүмкіндік береді.
2) Көп деңгейлі ажыратымдылықты талдау: Оңтайлы ажыратымдылықта әртүрлі тін ерекшеліктерін шешу үшін 100 мкм мен 5 мкм аралығындағы икемді көп деңгейлі талдау.
3) Транскриптомды жан-жақты профильдеу: Бүкіл тіндік слайдтан алынған транскрипттерді мақсатты гендердің санына және мақсатты аймаққа шектеусіз талдауға болады.
Қызмет сипаттамалары
| Кітапхана | Тізбектеу стратегиясы | Деректерді шығару ұсынылады |
| S1000 cDNA кітапханасы | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Гб/үлгі |
Үлгі талаптары
| Үлгі | Сан | Өлшем | РНҚ сапасы |
| OCT енгізілген тіндік блок | 2-3 блок/үлгі | Шамамен6,8x6,8x6,8 мм3 | RIN≥7 |
Үлгіні дайындау бойынша нұсқаулық және қызмет көрсету жұмыс процесі туралы қосымша мәліметтер алу үшін аBMKGENE сарапшысы
Қызметтің жұмыс ағыны
Эксперимент дизайны
Үлгіні жеткізу
Алдын ала эксперимент
Кеңістіктік штрих-кодтау
Кітапхана құрылысы
Тізбектеу
Деректерді талдау
Сатудан кейінгі қызметтер
BMKMANU S1000 жасаған деректер BMKGENE дербес әзірлеген «BSTMatrix» бағдарламалық құралын пайдалану арқылы талданады, соның ішінде:
1) Гендік экспрессия матрицасын генерациялау
2) HE кескінді өңдеу
3) Талдау үшін төменгі үшінші тарап бағдарламалық жасақтамасымен үйлесімді
4) Онлайн «BSTViewer» әртүрлі ажыратымдылықтағы визуализация нәтижелерін алуға көмектеседі.
1.Дақтық кластерлеу
2. Кеңістіктік таралу
Nоте: Ажыратымдылықдеңгей=13 (100 мкм, сол); 7 (50 мкм, дұрыс)
3.Маркер өрнегі көптігі кластерлеу жылу картасы
4. Үлгі аралық деректерді талдау
