Illumina алдын ала жасалған кітапханалары
Ерекше өзгешеліктері
●Платформалар:Illumina NovaSeq 6000 және NovaSeq X Plus
●Реттік режимдер:PE150 және PE250
●Кітапханалардың секвенирлеу алдында сапасын бақылау
●Деректерді секвенирлеу, сапа бақылауы және жеткізу:Q30 оқуларын демультиплекстеуден және сүзгілеуден кейін сапаны бақылау есебін және шикі деректерді fastq форматында жеткізу
Қызмет көрсетудің артықшылықтары
●Реттік қызметтерінің әмбебаптығы:Тұтынушы жолақ, ағын ұяшығы немесе қажетті деректер көлемі бойынша (жолақтардың ішінара секвенирленуі) реттілікті таңдай алады.
●Illumina секвенирлеу платформасында кең тәжірибе:әртүрлі түрлері бар мыңдаған жабық жобалармен.
●Реттілікті тексеру бойынша сапаны бақылау есебін жеткізу:сапа көрсеткіштерімен, деректердің дәлдігімен және секвенирлеу жобасының жалпы өнімділігімен.
●Жетілген секвенирлеу процесі:қысқа айналым уақытымен.
●Қатаң сапаны бақылау: біз үнемі жоғары сапалы нәтижелерге қол жеткізуді қамтамасыз ету үшін қатаң сапаны бақылау талаптарын енгіземіз.
Үлгі платформалар
| Платформа | Ағын ұяшығы | Реттік режим | Бірлік | Болжамды шығыс |
| NovaSeq X | 10B (8 жолақ) | PE150 | Бір жолақты жол Жартылай жолақ | 375 Гб / жолақ |
| 25B (8 жолақ) | PE150 | Бір жолақты жол Жартылай жолақ | 1000 Гб/жолақ | |
| NovaSeq 6000 | SP Flow ұяшығы (2 жолақты) | PE250 | Ағын ұяшығы Бір жолақты жол Жартылай жолақ | 325-400 M оқу / жолақ |
| S4 ағын ұяшығы (4 жолақ) | PE150 | Ағын ұяшығы Бір жолақты жол Жартылай жолақ | ~800 ГБ / жолақ |
Үлгі талаптары
| Деректер көлемі (X) | Концентрация (qPCR/nM) | Дыбыс деңгейі | |
| Жартылай жолақты реттілік
| X ≤ 10 Гб | ≥ 1 нМ | ≥ 25 мкл |
| 10 Гб < X ≤ 50 Гб | ≥ 2 нМ | ≥ 25 мкл | |
| 50 Гб < X ≤ 100 Гб | ≥ 3 нМ | ≥ 25 мкл | |
| X > 100 Гб | ≥ 4 нМ | ≥ 25 мкл | |
| Жолақтарды ретке келтіру | Әр жолаққа | ≥ 1,5 нМ / Кітапхана қоры | ≥ 25 мкл / Кітапхана пулы |
Шоғырлану мен жалпы мөлшерден басқа, қолайлы шың үлгісі де қажет.
Ескерту: Төмен әртүрлілік кітапханаларының жолақтарын секвенирлеу сенімді базалық шақыруды қамтамасыз ету үшін PhiX қосымшасын қажет етеді.
Алдын ала жинақталған кітапханаларды үлгі ретінде ұсынуды ұсынамыз. Егер сізге кітапхананы біріктіруді орындау үшін BMKGENE қажет болса, мына сілтемені қараңыз
ішінара жолақты секвенирлеуге арналған кітапхана талаптары.
Кітапхана көлемі (ең жоғары нүктелер картасы)
Негізгі шың 300-450 б.с./сағ аралығында болуы керек.
Кітапханаларда бір негізгі шың болуы керек, адаптердің ластануы болмауы және праймерлердің димерлері болмауы керек.
Егер сіздің үлгілеріңіз бастапқы материал талаптарына сәйкес келмесе, бізге хабарласыңыз.
Қызмет көрсету жұмыс процесі
Кітапхана сапасын бақылау
Реттік реттеу
Деректер сапасын бақылау
Жобаны жеткізу
Кітапхананың сапаны бақылау есебі
Кітапхана сапасы туралы есеп секвенирлеу, кітапхана көлемін бағалау және фрагментациялау алдында ұсынылады.
СБ есебін секвенирлеу
1-кесте. Реттілік деректері бойынша статистика.
| Үлгі идентификаторы | BMKID | Шикі оқулар | Шикі деректер (bp) | Таза оқулар (%) | Q20(%) | Q30(%) | Жалпы сома (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
1-сурет. Әрбір үлгідегі оқулар бойынша сапа үлестірімі
2-сурет. Негізгі мазмұнды бөлу
3-сурет. Оқылған мазмұнның секвенирлеу деректеріндегі таралуы
