Illumina алдын ала жасалған кітапханалар
Ерекше өзгешеліктері
●Платформалар:Illumina NovaSeq 6000 және NovaSeq X Plus
●Тізбектеу режимдері:PE150 және PE250
●Кітапханалардың секвенирлеу алдында сапасын бақылау
●Деректерді ретке келтіру QC және жеткізу:Q30 оқуларын демультиплекстеу және сүзуден кейін QC есебін және бастапқы деректерді fastq форматында жеткізу
Қызметтің артықшылықтары
●Секвенирлеу қызметтерінің әмбебаптығы:тұтынушы жолақ, ағын ұяшығы немесе талап етілетін деректер көлемі бойынша реттілікті таңдауы мүмкін (жартылай жолақты реттілік).
●Illumina секвенирлеу платформасында үлкен тәжірибе:түрлі түрлері бар мыңдаған жабық жобалармен.
●Сауықтыру бақылауының реттілігі туралы есепті жеткізу:сапа көрсеткіштерімен, деректер дәлдігімен және секвенирлеу жобасының жалпы өнімділігімен.
●Жетілген реттілік процесі:қысқа айналдыру уақытымен.
●Қатаң сапаны бақылау: дәйекті жоғары сапалы нәтижелерді жеткізуге кепілдік беру үшін біз QC қатаң талаптарын орындаймыз.
Үлгі платформалар
| Платформа | Ағын ұяшығы | Тізбектеу режимі | Бірлік | Болжалды өнім |
| NovaSeq X | 10B (8 жолақ) | PE150 | Бір жолақты жол Жартылай жолақ | 375 Гб / жолақ |
| 25B (8 жолақ) | PE150 | Бір жолақты жол Жартылай жолақ | 1000 Гб/жолақ | |
| NovaSeq 6000 | SP Flow ұяшығы (2 жолақты) | PE250 | Ағын ұяшығы Бір жолақты жол Жартылай жолақ | 325-400 М оқылым / Жолақ |
| S4 Ағын ұяшығы (4 жолақ) | PE150 | Ағын ұяшығы Бір жолақты жол Жартылай жолақ | ~800 Гб / жолақ |
Үлгіге қойылатын талаптар
| Деректер мөлшері (X) | Концентрация (qPCR/nM) | Көлемі | |
| Жартылай жолақты реттілік
| X ≤ 10 Гб | ≥ 1 нМ | ≥ 25 мкл |
| 10 Гб < X ≤ 50 Гб | ≥ 2 нМ | ≥ 25 мкл | |
| 50 Гб < X ≤ 100 Гб | ≥ 3 нМ | ≥ 25 мкл | |
| X > 100 Гб | ≥ 4 нМ | ≥ 25 мкл | |
| Жолды реттілік | Бір жолақ | ≥ 1,5 нМ / Кітапхана пулы | ≥ 25 мкл / Кітапхана бассейні |
Концентрация мен жалпы мөлшерге қоса, қолайлы шың үлгісі де қажет.
Ескертпе: Әртүрлілігі төмен кітапханалардың жолақты реттілігі сенімді базалық қоңырауды қамтамасыз ету үшін PhiX қосылуын қажет етеді.
Алдын ала жинақталған кітапханаларды үлгі ретінде жіберуді ұсынамыз. Кітапхананы біріктіруді орындау үшін BMKGENE қажет болса, мына сілтемені қараңыз
жартылай жолақты реттілікке арналған кітапхана талаптары.
Кітапхана өлшемі (Шың карта)
Негізгі шыңы 300-450 Bp шегінде болуы керек.
Кітапханалардың бір негізгі шыңы болуы керек, адаптердің ластануы және праймер димерлері болмауы керек.
Үлгілеріңіз бастапқы материал талаптарына сәйкес келмесе, бізге хабарласыңыз.
Қызметтің жұмыс процесі
Кітапхана сапасын бақылау
Тізбектеу
Деректер сапасын бақылау
Жобаны жеткізу
Кітапхананың QC есебі
Кітапхананың сапасы туралы есеп секвенирлеу, кітапхана көлемін бағалау және бөлшектеу алдында беріледі.
QC есебінің реттілігі
Кесте 1. Деректерді тізбектеу бойынша статистика.
| Үлгі идентификаторы | BMKID | Шикі оқиды | Шикі деректер (bp) | Таза оқулар (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Сурет 1. Әрбір үлгідегі оқулар бойынша сапа таралуы
Сурет 2. Негізгі мазмұнды бөлу
Сурет 3. Деректерді реттілікте оқу мазмұнының таралуы
