Өнімдер

ДНҚ/РНҚ секвенирлеуі – Нанопоралық секвенирлеуші

ДНҚ/РНҚ секвенирлеуі – Nanopore секвенирлеушісінің таңдаулы суреті

ONT секвенирлеу - нанокеуектерге негізделген бір молекулалы нақты уақыттағы электрлік сигналдарды секвенирлеу технологиясы, әр платформаның секвенирлеу принципі бірдей. Қос тізбекті ДНҚ/РНҚ биоүлбірге енген нанокеуекті ақуызбен байланысады және қозғалтқыш ақуызының басшылығымен тарқайды, биоүлбірдің екі жағынан кернеу айырмашылығының әсерінен ДНҚ/РНҚ тізбектері нанокеуекті арна ақуызы арқылы белгілі бір жылдамдықпен өтеді. ДНҚ/РНҚ тізбегіндегі әртүрлі негіздердің химиялық қасиеттерінің айырмашылығына байланысты, бір негіз немесе ДНҚ молекуласы нанокеуекті арнадан өткенде, әртүрлі электрлік сигналдардың өзгеруіне әкеледі. Осы сигналдарды анықтау және сәйкестендіру арқылы тиісті негіз түрлерін есептеуге болады және тізбекті нақты уақытта анықтауды аяқтауға болады.

Бізбен хабарласыңы

Қызмет көрсету мәліметтері

Демо нәтижесі

Қызмет көрсету туралы мәліметтердің ерекшеліктері

Платформа	Кітапхана көлемі	Теориялық деректер өнімділігі (ұяшыққа шаққандағы)	Бір базалық дәлдік	Қолданбалар
Нанопора	8Kb, 10kb, 20kb, Ультраұзын, кДНҚ-ПТР	70-90 Гб/ұяшық	85-92%	SV шақыруы, De novo, Толық ұзындықтағы секвенирлеу, Iso-Seq, Ген аннотациясы, ДНҚ метилденуін анықтау

Қызмет көрсетудің артықшылықтары

● Әртүрлі түрлермен мыңдаған жабық жобалармен PacBio секвенирлеу платформасында 5 жылдан астам тәжірибе.
● BMKGENE - қос платформалы РНҚ/ДНҚ сертификатына ие Oxford Nanopore компаниясының ресми серіктесі.
● Толық жабдықтары және жеткілікті секвенирлеу өнімділігі бар секвенсорлардың негізгі үлгілері бар.
● Nanopore платформасына негізделген 10-нан астам жануарлар мен өсімдіктерді зерттеу Denovo халықаралық деңгейде танымал журналдарда жарияланды.

Үлгі талаптары

Үлгі түрі

Сома

Концентрация (Qubit®)

Дыбыс деңгейі

Тазалық

Басқалары

Геномдық ДНҚ

Деректер талабына байланысты

≥20 нг/мкл

≥15 мкл

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1.5;

260 нм-дегі мөлдір шың, ластану жоқ

Концентрацияны Qubit және Qubit/Nanopore ≤ 2 арқылы өлшеу қажет.

Жалпы РНҚ

≥1,2 мкг

≥100 мкг/мкл

≥15 мкл

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; ластану жоқ

RIN мәні ≥7.5

Қызмет көрсету жұмыс процесі

Үлгіні дайындау

Кітапхана құрылысы

Реттік реттеу

Деректерді талдау

Жобаны жеткізу

Алдыңғы: Illumina алдын ала жасалған кітапханалары

Келесі: Арнайы локустық күшейтілген фрагменттерді секвенирлеу (SLAF-Seq)

ДНҚ үлгісінің деректер сапасын бағалау

1-кесте. Таза деректер бойынша статистика.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
ДНҚ_BMK01	1 218 239	26.37	1 121 736	25.90	28 014	15 764	23 090	143 181	9

РНҚ үлгісінің деректер сапасын бағалау

1-кесте. Таза деректер бойынша статистика.

Файл атауы	Клиент идентификаторы	ReadNum	BaseNum	N50	Орташа ұзындық	Максималды ұзындық	Орташа Qscore
RNA_BMK001	C2	8 947 708	4 047 230 083	398	452	129 227	12-ші сұрақ