Өнімдер

ДНҚ/РНҚ секвенирлеуі – Нанопора секвенсері

ДНҚ/РНҚ реттілігі – Нанопора секвенсерінің таңдаулы кескіні

ONT секвенциясы - бұл нанокеуектерге негізделген нақты уақыт режиміндегі бір молекулалы электрлік сигналдарды секвенирлеу технологиясы, әрбір платформаның реттілік принципі бірдей.Екі тізбекті ДНҚ/РНҚ биофильмге енгізілген нанокеуекті протеинмен байланысады және мотор ақуызының жетекшілігімен ашылады, биофильмнің екі жағындағы кернеу айырмашылығының әсерінен ДНҚ/РНҚ жіптері нанокеуекті арна ақуызы арқылы белгілі бір деңгейде өтеді. мөлшерлемесі.ДНҚ/РНҚ тізбегіндегі әртүрлі негіздердің химиялық қасиеттерінің айырмашылығына байланысты бір негіз немесе ДНҚ молекуласы нанокерекше арнасынан өткенде әртүрлі электрлік сигналдардың өзгеруіне себеп болады.Осы сигналдарды анықтау және оларға сәйкес келу арқылы сәйкес базалық типтерді есептеуге болады және нақты уақыт режимінде ретті анықтауды аяқтауға болады.

Бізбен хабарласыңы

Қызмет мәліметтері

Демо нәтижесі

Қызмет мәліметтерінің мүмкіндіктері

Платформа	Кітапхана өлшемі	Теориялық деректер шығымы (әр ұяшыққа)	Бір негізді дәлдік	Қолданбалар
Нанопора	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90 Гб/ұяшық	85-92%	SV шақыру, De novo, Толық ұзындықты реттілік, Iso-Seq, Гендік аннотация, ДНҚ метилденуін анықтау

Қызметтің артықшылықтары

● Түрлі түрлермен мыңдаған жабық жобалары бар PacBio секвенирлеу платформасындағы 5 жылдан астам тәжірибесі.
● BMKGENE қос платформалы РНҚ/ДНҚ сертификаты бар Oxford Nanopore компаниясының ресми серіктесі болып табылады.
● Толық жабдығы және жеткілікті реттілік өткізу қабілеті бар секвенсерлердің негізгі үлгілері бар.
● Nanopore платформасының негізінде 10-нан астам жануарлар мен өсімдіктерге арналған Denovo зерттеулері халықаралық танымал журналдарда жарияланды.

Үлгіге қойылатын талаптар

Үлгі түрі

Сома

Концентрация(Qubit®)

Көлемі

Тазалық

Басқалар

Геномдық ДНҚ

Деректер талабына байланысты

≥20нг/мкл

≥15мкл

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

260 нм-де таза шың, ластанулар жоқ

Концентрацияны Qubit және Qubit/Nanopore ≤ 2 арқылы өлшеу керек

Жалпы РНҚ

≥1,2 мкг

≥100мкг/мкл

≥15мкл

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; ластанулар жоқ

RIN мәні ≥7,5

Қызметтің жұмыс процесі

Үлгіні дайындау

Кітапхана құрылысы

Тізбектеу

Деректерді талдау

Жобаны жеткізу

Алдыңғы: DNA/RNA Sequencing – Illumina Sequencer

Келесі: Ерекше локусты күшейтілген фрагмент тізбегі (SLAF-кезегі)

ДНҚ үлгісінің деректер сапасын бағалау

Кесте 1. Таза деректер бойынша статистика.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1 218 239	26.37	1 121 736	25.90	28 014	15 764	23 090	143 181	9

РНҚ үлгісінің деректер сапасын бағалау

Кесте 1. Таза деректер бойынша статистика.

Файл атауы	ClientID	ReadNum	Негізгі сан	N50	Орташа ұзындық	Максималды ұзындық	Орташа QScore
RNA_BMK001	C2	8 947 708	4 047 230 083	398	452	129 227	12-тоқсан