● Рибосомалық кДНҚ-ны азайту үшін арнайы зондтар қолданылады.
● Стрэндке тән кітапхана құрылымы.
● мРНҚ, lncRNA және circRNA деректерін бір уақытта алу үшін бір жұмыс процесі.
● Қатаң сапаны бақылау: Біз үлгі мен кітапхананы дайындаудан бастап секвенирлеу мен биоинформатикаға дейінгі барлық кезеңдерде негізгі бақылау нүктелерін енгіземіз. Бұл мұқият бақылау үнемі жоғары сапалы нәтижелердің берілуін қамтамасыз етеді.
● Сатудан кейінгі қолдау: Біздің міндеттемеміз жобаны аяқтаудан тысқары, сатудан кейінгі 3 айлық қызмет көрсету мерзімін қамтиды. Осы уақыт ішінде біз жобаны бақылау, ақаулықтарды жою бойынша көмек және нәтижелерге қатысты кез келген сұрақтарға жауап беру үшін сұрақ-жауап сессияларын ұсынамыз.
| Кітапхана | Платформа | Ұсынылған деректер | Деректерді сапаны бақылау |
| рРНҚ-ның таусылған бағыттық кітапханасы | Illumina PE150 | 10-16 ГБ | Q30≥85% |
Нуклеотидтер:
| Сома (нг) | Көлемі (мкл) |
| 40 | 20 |
Тін:
Экзосома: 100 мкл; 40 мкг; >10^9 бөлшектер/мл
Сарысу/плазма: 5 мл
Жасуша дақылының үстіңгі қабаты: 100 мл
Зәр: 100 мл
Сілекей: 15 мл
Мұрыннан бөліну: 15 мл
Жұлын-ми сұйықтығы: 15 мл
Амниотикалық сұйықтық: 50 мл
Шәует: 5 мл
Өт: 5 мл
Асцит: 50 мл
Сүт: 15 мл
Фолликулярлық сұйықтық: 15 мл
Нәжіс үстіңгі қабаты: 50 мл
Микробтық дақылдың үстіңгі қабаты: 100 мл
Жануар тіндері: 3 г
Өсімдік тіндері: 1 г
Контейнер: 2 мл центрифуга түтігі (қалайы фольга ұсынылмайды)
Үлгі таңбалау: Топ+көшірме, мысалы, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Жеткізу:
1. Құрғақ мұз: Үлгілерді пакеттерге салып, құрғақ мұзға көму керек.
2. РНҚ-тұрақты түтіктер: РНҚ үлгілерін РНҚ-тұрақтандыру түтігінде (мысалы, RNAstable®) кептіріп, бөлме температурасында жеткізуге болады.
Биоинформатика
циркРНҚ болжамы: хромосомалық таралу
Дифференциалды түрде экспрессияланған циркРНҚ – Вулкан графигі
Дифференциалды түрде экспрессияланған циркРНҚ – иерархиялық кластерлеу
ЦиркРНҚ-ның иесі гендерінің функционалдық байытылуы
Дифференциалды ген экспрессиясын (ДЭГ) талдау
lncRNA экспрессиясын сандық бағалау – кластерлеу
lncRNA нысана гендерінің байытылуы
Бірлескен мРНҚ және lncRNA позициясын талдау – Циркос графигі (ортаңғы шеңбер - мРНҚ, ал ішкі шеңбер - lncRNA)