Өнімдер

Экзосомалық кіші РНҚ секвенирлеуі-Illumina

Экзосомалар – жасушалар бөлетін, әдетте диаметрі 30-дан 100 нанометрге дейінгі ұсақ көпіршіктер. Бұл көпіршіктерде әртүрлі РНҚ бар. Экзосомалардағы РНҚ түрлерінің ішінде ең көп таралған және кеңінен зерттелгені – микроРНҚ (miRNA). miRNA – ұзындығы шамамен 18-25 нуклеотидті кодтамайтын ұсақ РНҚ класы. Олар мақсатты мРНҚ-ның 3′ аударылмаған аймағына (3′ UTR) байланысу арқылы транскрипциядан кейінгі геннің үнсізденуін қамтамасыз етеді, осылайша ген экспрессиясын реттейді. Мысалы, белгілі бір ісік жасушалары бөлетін экзосомаларда miR-126 және miR-92a сияқты нақты miRNA болады. Бұл miRNA-лар реципиент жасушаларындағы ген экспрессиясына әсер етуі және ісік ангиогенезін ынталандыруы мүмкін (Tomohiro Umezu және т.б., Oncogene, 2012).

Бізбен хабарласыңы

Қызмет көрсету мәліметтері

биоинформатика

Демо нәтижелері

Ерекше өзгешеліктері

● Экзосомалық жалпы РНҚ кіріс материалы ретінде пайдаланылады. Тазарту кезінде miRNA моншақтары miRNA бөліп алу үшін қолданылады.

● Биоақпараттық талдау miRNA болжамы мен олардың нысаналарына бағытталған.

Қызмет көрсетудің артықшылықтары

● Кешенді биоинформатикалық талдау: Белгілі және жаңа miRNA-ларды анықтауға, miRNA нысаналарын анықтауға және тиісті функционалды аннотациялауға және бірнеше дерекқорлармен (KEGG, GO) байытуға мүмкіндік береді.

● Қатаң сапаны бақылау: Біз үлгі мен кітапхананы дайындаудан бастап секвенирлеу мен биоинформатикаға дейінгі барлық кезеңдерде негізгі бақылау нүктелерін енгіземіз. Бұл мұқият бақылау үнемі жоғары сапалы нәтижелердің берілуін қамтамасыз етеді.

● Сатудан кейінгі қолдау: Біздің міндеттемеміз жобаны аяқтаудан тысқары, сатудан кейінгі 3 айлық қызмет көрсету мерзімін қамтиды. Осы уақыт ішінде біз жобаны бақылау, ақаулықтарды жою бойынша көмек және нәтижелерге қатысты кез келген сұрақтарға жауап беру үшін сұрақ-жауап сессияларын ұсынамыз.

Үлгі талаптары және жеткізу

Кітапхана	Платформа	Ұсынылған деректер	Деректерді сапаны бақылау
Экзосомалық miRNA оқшаулануы	Illumina SE50	10M-20M оқу	Q30≥85%

Үлгі талаптары

Нуклеотидтер:

Сома (нг)	Көлемі (мкл)
40	20

Тін:

Экзосома: 100 мкл; 40 мкг; >10^9 бөлшектер/мл
Сарысу/плазма: 5 мл
Жасуша дақылының үстіңгі қабаты: 100 мл
Зәр: 100 мл
Сілекей: 15 мл
Мұрыннан бөліну: 15 мл
Жұлын-ми сұйықтығы: 15 мл
Амниотикалық сұйықтық: 50 мл
Шәует: 5 мл
Өт: 5 мл
Асцит: 50 мл
Сүт: 15 мл
Фолликулярлық сұйықтық: 15 мл
Нәжіс үстіңгі қабаты: 50 мл
Микробтық дақылдың үстіңгі қабаты: 100 мл
Жануар тіндері: 3 г
Өсімдік тіндері: 1 г

Ұсынылған үлгі жеткізу

Контейнер: 2 мл центрифуга түтігі (қалайы фольга ұсынылмайды)
Үлгі таңбалау: Топ+көшірме, мысалы, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Жеткізу:
1. Құрғақ мұз: Үлгілерді пакеттерге салып, құрғақ мұзға көму керек.
2. РНҚ-тұрақты түтіктер: РНҚ үлгілерін РНҚ-тұрақтандыру түтігінде (мысалы, RNAstable®) кептіріп, бөлме температурасында жеткізуге болады.

Қызмет көрсету жұмыс ағыны

Тәжірибелік дизайн

Үлгіні жеткізу

РНҚ экстракциясы

Кітапхана құрылысы

Реттік реттеу

Деректерді талдау

Сатудан кейінгі қызметтер

Алдыңғы: BMKMANU S3000_Кеңістіктік транскрипция

Келесі: Экзосомалық мРНҚ/LncRNA/CircRNA секвенирлеу-Illumina

Биоинформатика

● Шикі деректердің сапасын бақылау
● sRNA жіктелуі
● Анықтамалық геномға сәйкестендіру
● Белгілі және жаңа miRNA анықтау
● Дифференциалды miRNA экспрессиясын талдау
● miRNA нысаналарының функционалдық аннотациясы

miRNA идентификациясы: құрылымы және тереңдігі