Толыққанды мРНҚ-ны-Nanopore
Ерекше өзгешеліктері
● Poly-a mrna-ны басып алу CDNA синтезі және кітапхананы дайындау
● толыққанды транскрипттердің реттелуі
● Анықтама геномына теңестіру негізінде биоинформациялық талдау
● Биоинформатикалық талдау тек генде және изоформалық деңгейде ғана емес, сонымен қатар LNCRNA, сонымен қатар LNCRNA, гендік терместер, поли-аденилизация және гендік құрылымды талдауды да қамтиды
Қызметтің артықшылықтары
●Изоформ деңгейіндегі өрнектерді сандық бағалау: егжей-тегжейлі және нақты өрнектерді талдауды қосу, бүкіл гендік өрнекті талдау кезінде маска жасалуы мүмкін өзгерістерді қосуды қосу
●Деректердің төмендеуі:Келесі буынның (NGS), NANOPORE-тің реттелуіне қарағанда, NanoPore-тің төмендеуі, гендік өрнек деңгейінің баламалы деңгейлеріне, кішігірім мәліметтермен қанықтыруға мүмкіндік береді.
●Өрнекті сандық бағалау дәлдігі: ген және Изоформ деңгейінде де
●Қосымша транскриптомдық ақпаратты анықтау: Балама полистилизация, синтез гендері және LCNRNA және олардың мақсатты гендері
●Кең сараптама: Біздің команда барлық жобаларға көп тәжірибе әкеледі, 850-ден астам нанопордың толық ұзындығы 1800-ден астам транскрипция жобаларын аяқтап, 8000-нан астам үлгіні өңдейді.
●Сатудан кейінгі қолдау: Біздің міндеттеме жобаны аяқтағаннан кейін 3 айдан кейін сатудан болған қызмет мерзімін ұзартады. Осы уақыт ішінде біз нәтижелерге қатысты кез-келген сұраныстарды шешуге бағытталған, ақаулықтарды жою, ақаулықтарды жою, & A сессияларын ұсынамыз.
Үлгі талаптары және жеткізу
| Кітапхана | САЯСАТ САЯСАТЫ | Деректер ұсынылады | Сапаны бақылау |
| Поли байытылған | Иллюминина PE150 | 6/12 ГБ | Сапа бойынша орташа балл: Q10 |
Үлгі талаптары:
Нуклеотидтер:
| (Ng / мкл) | Сома (мкг) | Бізіз | Адалдық |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Гельде ақуыз немесе ақуыз немесе ДНҚ-ның ластануы жоқ. | Өсімдіктер үшін: Rin≥7.0; Жануарлар үшін: Rin≥7.5; 5.0≥28s / 18S≥1.0; шектеулі немесе бастапқы биіктік жоқ |
● Өсімдіктер:
Тамыр, сабақтар немесе жапырақшалар: 450 мг
Жапырақ немесе тұқым: 300 мг
Жемістер: 1.2 г.
● Жануар:
Жүрек немесе ішек: 300 мг
Viscera немесе ми: 240 мг
Бұлшықет: 450 мг
Сүйектер, шаш немесе тері: 1г
● Артроподтар:
Жәндіктер: 6г
Кристатея: 300 мг
● бүкіл қан: 1 түтік
● Ұяшықтар: 106 Ұяшықтар
Ұсынылатын үлгіні жеткізу
Контейнер: 2 мл центрифуга түтігі (қалайы фольгасы ұсынылмайды)
Белгіленген таңбалау үлгісі: Group + Group ₸ 225-00 Бағалау, мысалы A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Жеткізу:
1. Құрғақ мұз: Үлгілерді сөмкелерден жинау керек және құрғақ мұзға көмілуі керек.
2
Қызмет көрсету ағымы
Нуклеотидтер:
Үлгіні жеткізу
Кітапхана құрылысы
Жүйелі кідіріс
Деректерді талдау
Сатудан кейінгі қызметтер
Қызмет көрсету ағымы
Тіндер:
Эксперимент дизайны
Үлгіні жеткізу
РНҚ алу
Кітапхана құрылысы
Жүйелі кідіріс
Деректерді талдау
Сатудан кейінгі қызметтер
● Деректерді шикізатты өңдеу
● Транскрипт сәйкестендіру
● балама шашу
● гендік деңгейдегі және изоформ деңгейіндегі өрнек
● Дифференциалды өрнекті талдау
● Функцияны аннотациялау және байыту (дег және деу)
Балама бөлшектеу талдауы
Балама полистенді талдау (APA)
lncrna болжау
Роман гендерінің аннотациясы
Дотарын кластерлеу
DEGS-де ақуыз-ақуыз желілері
BMKGENE NANOPORE-дің толық ұзындығы Нанопордың толық ұзындығы, басылған барлық қызметтерді зерттелді.
Гонг, B. және Al. (2023) 'Киназаның эпигурация және транскрипциялық активтендіру Kinase Fam20C глиома бойынша онкоген, генетика және геномика, 50 (6), 422-433 б. Doi: 10.1016 / j.jgg.2023.01.008.
Ол, z. және al. . 108636. DOI: 10.1016 / j.fsi.2023.108636.
Ма, Ю.Т. (2023) «Номопилема Номурай Веномды идентификациялау», геномика, 115 (6), б. 110709. Doi: 10.1016 / j.ygeno.2023.110709.
Ю, Д. және al. . Doi: 10.1186 / S13287-023-03491-5 / TABLES / 6.
