Геномдық қауымдастықтың талдауы
1.Қызметтің артықшылықтары
● Жоба жағдайларының көптігі: 2009 жылы құрылғаннан бері BMKGENE популяциялық GWAS зерттеулерінде жүздеген түр жобаларын аяқтады, зерттеушілерге 100-ден астам мақаланы жариялауға көмектесті және жиынтық әсер ету коэффициенті 500-ге жетті.
● Кәсіби талдаушылар.
● Қысқа талдау циклі.
● Деректерді дәл өңдеу.
2. Қызмет көрсету сипаттамалары
| Түр | Популяция шкаласы | Тізбектеу стратегиясы және тереңдігі |
| SLAF-GWAS | Үлгі нөмірі ≥200 | Геном өлшемі < 400М, реф-геномы бар WGS ұсынылады |
| Геном өлшемі ≤ 1G, 100K тегтер және 10X | ||
| 1G ≤ Геном өлшемі ≤ 2G, 200K тегтер және 10X | ||
| Геном өлшемі > 2G, 300K тегтер және 10X | ||
| WGS-GWAS | Үлгі нөмірі ≥200 | Әрбір үлгі үшін 10X |
3. Материалды таңдау
Әртүрлі сорттар, кіші түрлер, жер тұқымдары/гендік банктер/аралас тұқымдастар/жабайы ресурстар
Әртүрлі сорттар, түршелер, ландрасалар
Жартылай отбасы/толық отбасы/жабайы ресурстар
4. Биоақпараттық талдау
● Геномдық қауымдастықты талдау
● Маңызды SNP талдауы және скринингі
● Кандидат генінің функционалды аннотациясы
5. Қызметтің жұмыс ағыны
Эксперимент дизайны
Үлгіні жеткізу
РНҚ экстракциясы
Кітапхана құрылысы
Тізбектеу
Деректерді талдау
Сатудан кейінгі қызметтер
а.QC фенотипі
Жиілік таралу гистограммасы
Фенотип статистикасы
б.Қауымдастық талдауы (үлгі: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ сюжеті
Манхэттен сюжеті
| Жыл | Журнал | IF | Тақырып |
| 2022 | NC | 17.69 | Ағаш пионы Paeonia ostii гига-хромосомаларының және гига-геномының геномдық негізі. |
| 2015 | NP | 7.43 | Үй шаруашылығының іздері соядағы агрономиялық маңызы бар геномдық аймақтарды бекітеді |
| 2018 | MP | 9.32 | Дүниежүзілік рапс қосындыларының топтамасының тұтас геномдық қайта секвенциясы олардың экотиптік дивергенциясының генетикалық негізін ашады. |
| 2022 | HR | 7.29 | Геномдық қауымдастықтың талдауы қарбыз тұқымының мөлшерінің табиғи өзгеруіне молекулалық түсінік береді. |
