Хи-С негізіндегі хроматиннің өзара әрекеттесуі
Қызмет көрсету ерекшеліктері
● Иллюмина Новоектегі PE150-мен реттелу.
● Қызмет өндірілген нуклеин қышқылдарының орнына тіндердің үлгілерін қажет етеді, формальдегидпен қиылысады және ДНҚ-ақуыздың өзара әрекеттесуін сақтайды.
● Hi-C тәжірибесі биотинмен жабысқақ ұштарын шектеу және жөндеу, содан кейін өзара әрекеттесуді сақтай отырып, нәтижесінде пайда болатын ұштардың айналымы. Содан кейін ДНҚ Стептавидин моншақтарымен тартылады және кітапхананың кейінгі дайындығын тазартады.
Қызметтің артықшылықтары
●Ферменттердің оңтайлы шектеулері: 93% -ға дейінгі әр түрлі түрлерде жоғары HI-C тиімділігін қамтамасыз ету.
●Экспорттық сараптама және жариялау жазбалары:BMKGENE-де 800 түрлі түрлерден және түрлі патенттерден 2000 Hi-C тізбекті жобалармен кездеседі. 900-ден астам жинақталған әсер етуші факторы бар 100-ден астам жарияланған жағдай.
●Жоғары білікті биоинформатика тобы:Hi-C эксперименттері мен деректерді талдау және өзін-өзі дамыған визуализацияның бағдарламалық жасақтамасы үшін үйде патенттермен және бағдарламалық жасақтамамен қамтамасыз ету арқылы
●Сатудан кейінгі қолдау:Біздің міндеттемелеріміз жобаны аяқтағаннан кейін 3 айдан кейінгі қызмет көрсету мерзімін ұзартады. Осы уақыт ішінде біз нәтижелерге қатысты кез-келген сұраныстарды шешуге бағытталған, ақаулықтарды жою, ақаулықтарды жою, & A сессияларын ұсынамыз.
●Кешенді аннотация: Біз бірнеше зерттеулермен гендерді функционалдық аннотациялау үшін бірнеше мәліметтер базасын қолданамыз және бірнеше ғылыми жобалар туралы түсінік береміз.
Қызмет көрсету ерекшеліктері
| Кітапхана | САЯСАТ САЯСАТЫ | Ұсынылатын мәліметтер шығару | HI-C сигнал ажыратымдылығы |
| Хи-С кітапханасы | Иллюминина PE150 | Хроматин циклі: 150x Тәж: 50х | Хроматин циклі: 10Kb Тәж: 40 кб |
Қызмет көрсету талаптары
| Үлгі түрі | Қажетті сома |
| Жануарлардың ұлпасы | ≥2g |
| Бүкіл қан | ≥2мл |
| Саңырауқұлақтар | ≥1g |
| Өсімдіктер - жас тін | 1g / aliiquot, 2-4 Alliquotes ұсынылады |
| Мәдени жасушалар | ≥1x107 |
Келесі талдауды қамтиды:
● QC RAW деректері;
● Hi-C кітапханасы QC: жарамды өзара әрекеттесу жұптары және ыдырау экспоненттері (IDE);
● геномдық өзара әрекеттесуді профильдеу: ТМД / Транзиттік талдау және Hi-C өзара әрекеттесу картасы;
● A / B бөлікті бөлуді талдау;
● Тадтар мен хроматин ілмектерін анықтау;
● Үлгілер арасындағы 3D хроматин құрылымының элементтері мен ілеспе гендердің сәйкес функционалды аннотациясы бойынша дифференциалды талдау.
ТМД және трансмиссия үлкейту
Үлгілер арасындағы хромосомалық өзара әрекеттесудің жылу картасы
A / B бөлімдерінің геномдық таралуы
Хроматин ілмектерінің геномдық таралуы
Тадстарды визуализациялау
Б.М.kgene's hi-c жүйелі түрде жарияланымдар жинағы арқылы жеңілдетілген ғылыми-зерттеу жетістіктерін зерттеңіз.
Meng, t. және al. (2021) 'Салыстырмалы интеграцияланған көп омыналарды талдау CA2-ді Хордома үшін роман нысаны ретінде анықтайды,Нейро-онкология, 23 (10), 1709-1722 бет. Doi: 10.1093 / Neuonc / Noab156.
Xu, l. және al. (2021) 'геномды құру және қайта құру және геномды өзгерту NAFLD-дің интеграцияланған Hi-C, Nanopore және RNNE SETUNCENCENTY арқылы түсінік береді',ACTA Pharmaceutica Sinica B, 11 (10), 3150-3164 б. Doi: 10.1016 / j.aptb.2021.03.022.
