мРНҚ-секвенциясы (NGS) – De novo

мРНҚ секвенирлеу белгілі бір жағдайларда жасушалардағы барлық мРНҚ транскрипттерін профильдеуге мүмкіндік береді және әртүрлі зерттеу салаларында кеңінен қолданылатын технология болып табылады. BMKCloud De novo мРНҚ-секвенирлеу құбыры анықтамалық геном болмаған кезде поли-А байытылған секвенирлеу кітапханаларын талдауға арналған. Құбыр сапаны бақылаудан басталады, содан кейінжаңадантранскрипт құрастыру және униген жиынтығын таңдау. Униген құрылымын талдау кодтау тізбегін (CDS) және қарапайым тізбек қайталануларын (SSR) болжайды. Кейіннен, дифференциалды экспрессия талдауы тексерілген жағдайлар арасында дифференциалды экспрессияланған гендерді (DEG) табады, содан кейін биологиялық түсініктерді алу үшін функционалды аннотация және DEG-ді байыту жүзеге асырылады.