Нанопордың толық ұзақ мерзімді транскриптомені

NanoPore транскриптомды кезеңі - бұл толық ұзындығы бар, толық ұзақ мерзімді CDNA-ны реттейтін күшті әдіс, транскрипт идентификаторын дәл анықтайды және мөлшерлеу. BMKCloud Nanopore толық ұзақ мерзімді транскриптометрлік мұнай құбыры генде де, транскрипт деңгейінде де сапалы және сандық талдауды қамтамасыз ететін жоғары сапалы аннотацияланған анықтамалық геномға қатысты RNA-SEQ мәліметтерін талдауға арналған. Сапаны бақылаудан кейін толық ұзындықпен химиялық емес (FLNC) тізбегі алынады және консенсусқа консенсус тізбегі артық транскрипттерді кетіру үшін сілтеме геномымен салыстырылады. Осы транскрипт жиынынан, өрнек мөлшерленеді және әр түрлі гендер мен транскрипттер анықталған және функционалды түрде анықталады. Құбыр желісіне балама полистилизация (APA) талдау, балама бөлшектеу, қарапайым (КСР) және сәйкес нысандар, кодтау тізбегін болжау (CDS), ген отбасылық талдау, транскрипция факторларын талдау, роман гендерін болжау және транскрипттердің функционалды аннотациясы.