Pacbio толықметражды транскриптомы

PacBio толық ұзындықтағы транскриптомды секвенирлеу, Isoseq, транскрипт изоформаларын дәл анықтауға мүмкіндік береді, балама полиаденилдеу мен сплайсингке жарық түсіреді және ген экспрессиясын дәлірек талдауға әкеледі. BMKCloud PacBio толық ұзындықтағы транскриптом құбыры шеңберлік консенсус секвенирлеу (CCS) режимінде секвенирленген кДНҚ кітапханаларын талдауға арналған және толық ұзындықтағы химерлік емес (FLNC) тізбектерді анықтайды, олар кейін артық емес транскрипттерге топтастырылады. Кейінгі BUSCO талдауы транскриптом құрастыруының толықтығын бағалайды. Жиналған транскриптомнан бірнеше талдау жүргізіледі: балама сплайсинг, қарапайым тізбекті қайталау (SSR), lncRNA және сәйкес нысана гендерін болжау, жаңа гендерді болжау, ген тұқымдастығын талдау, транскрипция факторын талдау және транскрипттердің функционалды аннотациясы.