-
Хроматиндік иммунопреципитация реттілігі (ChIP-секв)
ChIP-Seq гистонды модификациялау, транскрипция факторлары және басқа ДНҚ-байланысты ақуыздар үшін ДНҚ нысандарының геномдық профилін қамтамасыз етеді.Ол қалпына келтірілген ДНҚ-ның жоғары өнімді секвенциясы үшін келесі ұрпақ секвенирлеуінің (NGS) күшімен ерекше ақуыз-ДНҚ кешендерін қалпына келтіру үшін хроматиндік иммундық-преципитацияның (ChIP) селективтілігін біріктіреді.Сонымен қатар, ақуыз-ДНҚ кешендері тірі жасушалардан қалпына келтірілетіндіктен, байланыстыру орындарын әртүрлі жасуша түрлері мен тіндерінде немесе әртүрлі жағдайларда салыстыруға болады.Қолданулар транскрипциялық реттеуден бастап даму жолдарына дейін ауру механизмдеріне дейін және одан тыс жерлерде.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы
-
Тұтас геномды бисульфит секвенциясы
Цитозиндегі (5-мС) бесінші позициядағы ДНҚ метилденуі ген экспрессиясы мен жасушалық белсенділікке түбегейлі әсер етеді.Қалыпты емес метилдену үлгілері қатерлі ісік сияқты бірнеше жағдайлармен және аурулармен байланысты болды.WGBS бір базалық рұқсатта геномдық метилденуді зерттеудің алтын стандартына айналды.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы
-
Жоғары өткізу қабілеттілігі бар Транспозаға қол жетімді хроматинді талдау (ATAC-seq)
ATAC-seq – ген экспрессиясын жаһандық эпигенетикалық бақылау үшін маңызды болып табылатын геномдық хроматиннің қолжетімділігін талдауға арналған жоғары өнімді секвенирлеу әдісі.Секвенирлеу адаптерлері ашық хроматин аймақтарына гиперактивті Tn5 транспозасы арқылы енгізіледі.ПТР күшейтуден кейін секвенирлеу кітапханасы құрастырылады.Барлық ашық хроматин аймақтарын транскрипция факторының немесе белгілі бір гистонның модификацияланған аймағының байланысу орындарымен шектеліп қана қоймай, нақты кеңістік-уақыт жағдайында алуға болады.
-
Қысқартылған өкілдік бисульфит реттілігі (RRBS)
ДНҚ метилденуін зерттеу әрқашан ауруды зерттеуде өзекті тақырып болды және ген экспрессиясы мен фенотиптік белгілермен тығыз байланысты.RRBS - ДНҚ метилденуін зерттеудің дәл, тиімді және үнемді әдісі.Бисульфитті секвенирлеумен біріктірілген ферменттік ыдырау (Msp I) арқылы промотор және CpG аралдарының аймақтарын байыту жоғары ажыратымдылықтағы ДНҚ метилденуін анықтауды қамтамасыз етеді.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы
