Өнімдер

Прокариоттық РНҚ секвенциясы

Прокариоттық РНҚ секвенциясы өзгеретін жасушалық транскриптомды талдау арқылы белгілі бір сәтте РНҚ-ның болуын және санын анықтау үшін келесі ұрпақ секвенирлеуін (NGS) пайдаланады.Біздің компанияның прокариоттық РНҚ секвенциясы анықтамалық геномдары бар прокариоттарға бағытталған, сізге транскриптомды профильдеу, ген құрылымын талдау және т.б. қамтамасыз етеді. Ол іргелі ғылыми зерттеулерге, дәрілік заттарды зерттеу мен әзірлеуге және т.б. кеңінен қолданылды.

Платформа: Illumina NovaSeq платформасы

Бізбен хабарласыңы

Қызмет мәліметтері

Қызмет сипаттамалары

Платформа: Illumina NovaSeq платформасы, PE150

Кітапхана түрі: 350bp кірістіру cDNA кітапханасы (ең жоғары таратуға байланысты)

Тізбектеу стратегиясы: жұптастырылған соңы 150 бит

Ұсынылатын деректер көлемі: 2 Гб өңделмеген деректер/үлгі

Биоинформатика

(1) Деректердің сапасын бақылау реттілігі: нуклеотидтердің таралуы, негізгі сапаның таралуы, rRNA қатынасын бағалау;

(2) Тізбекті туралауды талдау: Туралау нәтижелерінің статистикасы, Тізбектелудің қанықтылығы, Тізбектелуді қамту;

(3) Анықтамалық геномдық аннотация (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Экспрессиялық талдау: Өрнектердің таралуы (Екі немесе одан да көп үлгілермен), Үлгілер арасындағы өрнекті талдау (Венн талдауы, Корреляциялық талдау, PCA талдауы);

(5) Дифференциалды өрнек талдауы (Екі немесе одан да көп үлгілермен);

(6) Гендер жиынын талдау: Венн талдауы, Кластерлік талдау, Функция аннотациясын талдау (COG, GO, KEGG), Функцияны байыту талдауы (GO, KEGG), Функцияларды байыту хордалық графигі, Ипат талдауы;

(7) sRNA талдауы: sRNA болжамы, sRNA аннотациясы (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA қайталама құрылымын болжау, sRNA мақсатты генін болжау;

(8) Транскрипт құрылымын талдау: Оперон талдауы, Транскрипцияның басталу және аяқталу тораптарын болжау, UTR аннотациясы және талдау, Промотер реттілігін болжау, SNP/InDel талдауы (SNP/InDel аннотациясы, SNP/InDel аймақтық таралуы, SNP статистикасы).