ការធ្វើលំដាប់ Amplicon 16S/18S/ITS-NGS
លក្ខណៈពិសេសសេវាកម្ម
● វេទិកាស៊ីក្វេន៖ Illumina NovaSeq។
● ការពង្រីកតំបន់ខ្លីៗនៃ 16S, 18S និង ITS ក្នុងចំណោមគោលដៅពង្រីកផ្សេងទៀត។
● ជម្រើសដែលអាចបត់បែនបាននៃអំព្លីកុង។
● មានបទពិសោធន៍គម្រោងពីមុនជាមួយគោលដៅពង្រីកច្រើន។
គុណសម្បត្តិសេវាកម្ម
●គ្មានការដាក់ឱ្យនៅដាច់ដោយឡែក៖ការកំណត់អត្តសញ្ញាណយ៉ាងឆាប់រហ័សនៃសមាសធាតុអតិសុខុមប្រាណនៅក្នុងគំរូបរិស្ថាន។
●គុណភាពបង្ហាញខ្ពស់នៅក្នុងសមាសធាតុដែលមានកម្រិតទាបនៅក្នុងគំរូបរិស្ថាន។
●អាចអនុវត្តបានយ៉ាងទូលំទូលាយការសិក្សាសហគមន៍អតិសុខុមប្រាណចម្រុះ។
●ការវិភាគជីវព័ត៌មានដ៏ទូលំទូលាយកញ្ចប់ QIIME2 ចុងក្រោយបំផុត (ការយល់ដឹងអំពីបរិមាណអំពីអេកូឡូស៊ីអតិសុខុមប្រាណ) ជាមួយនឹងការវិភាគចម្រុះទាក់ទងនឹងមូលដ្ឋានទិន្នន័យ ចំណារពន្យល់ OTU/ASV។
●ជំនាញទូលំទូលាយ៖ ជាមួយនឹងគម្រោងស៊ីក្វេនអំព្លីកុងចំនួន 150 ពាន់ដែលបានធ្វើឡើងជារៀងរាល់ឆ្នាំ BMKGENE នាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាងមួយទសវត្សរ៍ ក្រុមវិភាគដែលមានជំនាញខ្ពស់ ខ្លឹមសារដ៏ទូលំទូលាយ និងការគាំទ្រក្រោយពេលលក់ដ៏ល្អឥតខ្ចោះ។
លក្ខណៈបច្ចេកទេសសេវាកម្ម
| បណ្ណាល័យ | យុទ្ធសាស្ត្ររៀបលំដាប់ | ទិន្នន័យដែលបានណែនាំ |
| អាំព្លីខុន | អ៊ីលមូណា PE250 | ស្លាក 50/100/300K (អានជាគូ) |
តម្រូវការសេវាកម្ម
| កំហាប់ (ng/µL) | បរិមាណសរុប (ង) | បរិមាណ (µL) |
| ≥1 | ≥២០០ | ≥២០ |
● ដី/ភក់៖ ១-២ក្រាម
● មាតិកាពោះវៀន - សត្វ៖ 0.5-2 ក្រាម
● សារធាតុក្នុងពោះវៀន - សត្វល្អិត៖ 0.1-0.25 ក្រាម
● ផ្ទៃរុក្ខជាតិ (ដីល្បាប់ដែលមានជីវជាតិ): 0.1-0.5 ក្រាម
● ដីល្បាប់ដែលសម្បូរទៅដោយទឹកស៊ុប fermentation): 0.1-0.5 ក្រាម
● លាមក (សត្វធំៗ): 0.5-2ក្រាម
● លាមក (កណ្ដុរ): 3-5 គ្រាប់
● សារធាតុរាវលាងសួត៖ ក្រដាសតម្រង
● សំឡីជូតទ្វារមាស៖ សំឡីជូតចំនួន ៥-៦ ដុំ
● សំឡីជូតស្បែក/ប្រដាប់ភេទ/ទឹកមាត់/ជាលិកាទន់មាត់/សំឡីជូតបំពង់ក/សំឡីជូតរន្ធគូថ៖ ២-៣ សំឡីជូត
● អតិសុខុមប្រាណលើផ្ទៃ៖ ក្រដាសតម្រង
● ទឹក/ខ្យល់/ជីវហ្វីម៖ ក្រដាសតម្រង
● អង់ដូហ្វីត៖ ១-២ក្រាម
● បន្ទះធ្មេញ៖ ០.៥-១ក្រាម
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការដឹកជញ្ជូនគំរូ
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
ការរៀបចំលំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
រួមបញ្ចូលការវិភាគដូចខាងក្រោម៖
- ការគ្រប់គ្រងគុណភាពទិន្នន័យឆៅ
- ការដាក់ជាក្រុម OTU / ការកាត់បន្ថយសំលេងរំខាន (ASV)
- ចំណារពន្យល់ OTU
- ការវិភាគភាពចម្រុះអាល់ហ្វា៖ សន្ទស្សន៍ច្រើន រួមទាំង Shannon, Simpson និង ACE។
- ការវិភាគភាពចម្រុះបេតា
- ការវិភាគអន្តរក្រុម
- ការវិភាគទំនាក់ទំនង៖ រវាងកត្តាបរិស្ថាន និងសមាសភាព OUT និងភាពចម្រុះ
- ការព្យាករណ៍ហ្សែនមុខងារ 16S
អ៊ីស្តូក្រាមនៃការចែកចាយចំណាត់ថ្នាក់
ផែនទីកំដៅចង្កោមភាពសម្បូរបែបនៃចំណាត់ថ្នាក់
ការវិភាគភាពចម្រុះអាល់ហ្វា៖ ខ្សែកោងកម្រ
ការវិភាគភាពចម្រុះបេតា៖ NMDS
ការវិភាគអន្តរក្រុម៖ ការរកឃើញជីវសញ្ញាណ LEFSE
ស្វែងយល់ពីវឌ្ឍនភាពដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មលំដាប់ amplicon របស់ BMKGene ជាមួយ Illumina តាមរយៈការប្រមូលផ្ដុំនៃការបោះពុម្ពផ្សាយដែលបានរៀបចំយ៉ាងល្អ។
Dong, C. et al. (2022) 'ការផ្គុំ អតិសុខុមប្រាណស្នូល និងមុខងារនៃអតិសុខុមប្រាណដី និងសំបកឈើក្នុង Eucommia ulmoides', Frontiers in Microbiology, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL។
Li, Y. et al. (2023) 'ការប្តូរសរីរាង្គសំយោគបាក់តេរីសម្រាប់ការព្យាបាលជំងឺទ្វារមាសដែលបង្កឡើងដោយបាក់តេរី Gardnerella vaginalis ចំពោះសត្វកណ្ដុរ', Microbiome, 11(1), ទំព័រ 1–14។ doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. និង Liu, H. (2022) 'មីក្រូជីវសាស្ត្រនៃធូលីខ្យល់ដែលប្រមូលបានក្នុងអំឡុងពេលពិសោធន៍ទ្រទ្រង់ជីវិតដែលបិទជិតដែលមានមូលដ្ឋានលើដី "Lunar Palace 365"', មីក្រូជីវសាស្ត្របរិស្ថាន, 17(1), ទំព័រ 1–20។ doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8។
Yin, S. et al. (2022) 'ភាពសម្បូរបែបនៃហ្សែនមុខងារដែលពឹងផ្អែកលើវត្ថុធាតុដើមដែលទាក់ទងនឹងការបំលែងអាសូតដែលគ្រប់គ្រងការបាត់បង់អាសូតក្នុងជីកំប៉ុស', Bioresource Technology, 361, ទំព័រ 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678។
