ការធ្វើលំដាប់លំដោយ Amplicon 16S/18S/ITS-PacBio
លក្ខណៈពិសេសសេវាកម្ម
● វេទិកាសម្រាប់ធ្វើលំដាប់៖ PacBio Revio
● របៀបស៊ីក្វេន៖ CCS (អានសំឡេង HiFi)
● ការពង្រីកតំបន់គោលដៅ បន្តដោយការភ្ជាប់ឧបករណ៍ពង្រីកសំឡេងជាគូ មុនពេលរៀបចំបណ្ណាល័យកណ្តឹង HiFi SMRT
គុណសម្បត្តិសេវាកម្ម
●គុណភាពបង្ហាញថ្នាក់វិទ្យាខ្ពស់ជាងមុន៖ Tលំដាប់លំដោយអំព្លីកុងខ្លីរបស់ហាន,អនុញ្ញាតឱ្យមានអត្រាចំណាត់ថ្នាក់ OTU ខ្ពស់ជាងនៅកម្រិតប្រភេទសត្វ។
●ការហៅទូរស័ព្ទមូលដ្ឋានដែលមានភាពត្រឹមត្រូវខ្ពស់: ការរៀបលំដាប់របៀប PacBio CCS (ការអាន HiFi)។
●គ្មានភាពឯកោ៖ ការកំណត់អត្តសញ្ញាណយ៉ាងរហ័សនៃសមាសធាតុអតិសុខុមប្រាណនៅក្នុងគំរូបរិស្ថាន។
●អាចអនុវត្តបានយ៉ាងទូលំទូលាយការសិក្សាសហគមន៍អតិសុខុមប្រាណចម្រុះ។
●ការវិភាគជីវព័ត៌មានដ៏ទូលំទូលាយកញ្ចប់ QIIME2 ចុងក្រោយបំផុត (ការយល់ដឹងអំពីបរិមាណអំពីអេកូឡូស៊ីអតិសុខុមប្រាណ) ជាមួយនឹងការវិភាគចម្រុះទាក់ទងនឹងមូលដ្ឋានទិន្នន័យ ចំណារពន្យល់ OTU/ASV។
●ជំនាញទូលំទូលាយ៖ ជាមួយនឹងគម្រោងលំដាប់អំព្លីកុងរាប់ពាន់ដែលបានធ្វើឡើងជារៀងរាល់ឆ្នាំ BMKGENE នាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាងមួយទសវត្សរ៍ ក្រុមវិភាគដែលមានជំនាញខ្ពស់ ខ្លឹមសារដ៏ទូលំទូលាយ និងការគាំទ្រក្រោយពេលលក់ដ៏ល្អឥតខ្ចោះ។
លក្ខណៈបច្ចេកទេសសេវាកម្ម
| បណ្ណាល័យ | យុទ្ធសាស្ត្ររៀបលំដាប់ | ទិន្នន័យដែលបានណែនាំ |
| អាំព្លីខុន | PacBio Revio | ស្លាក 10/30/50 K (CCS) |
តម្រូវការគំរូ
| កំហាប់ (ng/µL) | បរិមាណសរុប (µg) | បរិមាណ (µL) |
| ≥៥ | ≥0.3 | ≥២០ |
ការដឹកជញ្ជូនគំរូដែលបានណែនាំ
បង្កកសំណាកក្នុងអាសូតរាវរយៈពេល 3-4 ម៉ោង ហើយរក្សាទុកក្នុងអាសូតរាវ ឬរក្សាទុកក្នុងសីតុណ្ហភាព -80 ដឺក្រេ រហូតដល់រយៈពេលវែង។ ការដឹកជញ្ជូនសំណាកជាមួយទឹកកកស្ងួតគឺត្រូវបានទាមទារ។
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការដឹកជញ្ជូនគំរូ
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
ការរៀបចំលំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
រួមបញ្ចូលការវិភាគដូចខាងក្រោម៖
●ការគ្រប់គ្រងគុណភាពទិន្នន័យឆៅ
●ការដាក់ជាក្រុម OTU/បន្ថយសំឡេងរំខាន (ASV)
●ចំណារពន្យល់ OTU
●ការវិភាគភាពចម្រុះអាល់ហ្វា៖ សន្ទស្សន៍ច្រើន រួមទាំង Shannon, Simpson និង ACE។
●ការវិភាគភាពចម្រុះបេតា
●ការវិភាគអន្តរក្រុម
●ការវិភាគទំនាក់ទំនង៖ រវាងកត្តាបរិស្ថាន និងសមាសភាព និងភាពចម្រុះនៃ OUT
●ការព្យាករណ៍ហ្សែនមុខងារ 16S
អ៊ីស្តូក្រាមនៃការចែកចាយចំណាត់ថ្នាក់
ដើមឈើពង្សាវតារនៃការចែកចាយសហគមន៍
ការវិភាគភាពចម្រុះអាល់ហ្វា៖ ACE
សន្ទស្សន៍
ការវិភាគភាពចម្រុះបេតា៖ PCoA
ការវិភាគអន្តរក្រុម៖ ANOVA
ស្វែងយល់ពីវឌ្ឍនភាពដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មលំដាប់ amplicon របស់ BMKGene ជាមួយ PacBio តាមរយៈការប្រមូលផ្ដុំនៃការបោះពុម្ពផ្សាយដែលបានរៀបចំយ៉ាងល្អ។
Gao, X. និង Wang, H. (2023) 'ការវិភាគប្រៀបធៀបនៃទម្រង់ និងមុខងារបាក់តេរីក្នុងរូមេនក្នុងអំឡុងពេលសម្របខ្លួនទៅនឹងបាតុភូតផ្សេងៗគ្នា (ការដាំឡើងវិញធៀបនឹងស្មៅ) នៅក្នុងចៀមអាល់ផែនមេរីណូដែលមានដំណាក់កាលលូតលាស់ពីរនៅលើវាលស្មៅអាល់ផែន', Fermentation, 9(1), ទំព័រ 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1។
Li, S. et al. (2023) 'ការចាប់យករូបធាតុងងឹតអតិសុខុមប្រាណនៅក្នុងដីវាលខ្សាច់ដោយប្រើមេតាហ្គេណូមិកដែលមានមូលដ្ឋានលើវប្បធម៌ និងការវិភាគដែលមានគុណភាពបង្ហាញខ្ពស់', npj Biofilms and Microbiomes 2023 9:1, 9(1), ទំព័រ 1–14។ doi: 10.1038/s41522-023-00439-8។
Mu, L. et al. (2022) 'ផលប៉ះពាល់នៃអំបិលអាស៊ីតខ្លាញ់លើលក្ខណៈ fermentation ភាពចម្រុះនៃបាក់តេរី និងស្ថេរភាព aerobic នៃ silage ចម្រុះដែលរៀបចំជាមួយ alfalfa ចំបើងអង្ករ និងកន្ទក់ស្រូវសាលី', ទិនានុប្បវត្តិវិទ្យាសាស្ត្រចំណីអាហារ និងកសិកម្ម, 102(4), ទំព័រ 1475–1487។ doi: 10.1002/JSFA.11482។
Yang, J. et al. (2023) 'អន្តរកម្មរវាងជីវសញ្ញាណស្ត្រេសអុកស៊ីតកម្ម និងមីក្រូជីវសាស្រ្តពោះវៀន នៅក្នុងឥទ្ធិពលប្រឆាំងអុកស៊ីតកម្មនៃសារធាតុចម្រាញ់ចេញពី Sonchus brachyotus DC. នៅក្នុងភាពតានតឹងអុកស៊ីតកម្មពោះវៀនដែលបង្កឡើងដោយ Oxazolone ចំពោះត្រី Zebrafish ពេញវ័យ', សារធាតុប្រឆាំងអុកស៊ីតកម្ម 2023, ភាគ 12, ទំព័រ 192, 12(1), ទំព័រ 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192។
