សន្និបាតហ្សែនផ្សិត De novo
BMKGENE ផ្តល់ជូននូវដំណោះស្រាយចម្រុះសម្រាប់ហ្សែនផ្សិត ដោយបំពេញតម្រូវការស្រាវជ្រាវចម្រុះ និងភាពពេញលេញនៃហ្សែនដែលចង់បាន។ ការប្រើប្រាស់ការធ្វើលំដាប់ Illumina រយៈពេលខ្លីតែម្នាក់ឯងអនុញ្ញាតឱ្យបង្កើតហ្សែនព្រាង។ ការធ្វើលំដាប់ខ្លី និងការធ្វើលំដាប់វែងដោយប្រើ Nanopore ឬ Pacbio ត្រូវបានផ្សំសម្រាប់ហ្សែនផ្សិតដែលកាន់តែចម្រាញ់ជាមួយនឹងទំនាក់ទំនងវែងជាង។
លក្ខណៈពិសេសសេវាកម្ម
ជាមួយនឹងជម្រើសពីរដែលអាចធ្វើទៅបានដើម្បីជ្រើសរើសអាស្រ័យលើកម្រិតនៃភាពពេញលេញនៃហ្សែនដែលចង់បាន៖
● ជម្រើសព្រាងហ្សែន៖ ការធ្វើលំដាប់ហ្សែនខ្លីជាមួយ Illumina NovaSeq PE150។
● ជម្រើសហ្សែនល្អិតល្អន់របស់ផ្សិត៖
ការស្ទង់មតិហ្សែន៖ Illumina NovaSeq PE150។
ការផ្គុំហ្សែន៖ PacBio Revio (អាន HiFi) ឬ Nanopore PromethION 48។
គុណសម្បត្តិសេវាកម្ម
●មានយុទ្ធសាស្ត្រលំដាប់លំដោយច្រើនសម្រាប់គោលដៅស្រាវជ្រាវ និងតម្រូវការផ្សេងៗគ្នានៃភាពពេញលេញនៃហ្សែន
●លំហូរការងារជីវព័ត៌មានវិទ្យាពេញលេញ៖នេះរួមបញ្ចូលទាំងការផ្គុំហ្សែន និងការព្យាករណ៍នៃធាតុហ្សែនច្រើន ចំណារពន្យល់ហ្សែនមុខងារ និងយុថ្កាជាប់គ្នា។
●ជំនាញទូលំទូលាយដោយមានការផ្គុំហ្សែនអតិសុខុមប្រាណជាង 12,000 យើងនាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាងមួយទសវត្សរ៍ ក្រុមវិភាគដែលមានជំនាញខ្ពស់ ខ្លឹមសារដ៏ទូលំទូលាយ និងការគាំទ្រក្រោយការលក់ដ៏ល្អឥតខ្ចោះ។
●ការគាំទ្រក្រោយពេលលក់៖ការប្តេជ្ញាចិត្តរបស់យើងលាតសន្ធឹងលើសពីការបញ្ចប់គម្រោងជាមួយនឹងរយៈពេលសេវាកម្មក្រោយពេលលក់រយៈពេល 3 ខែ។ ក្នុងអំឡុងពេលនេះ យើងផ្តល់ជូននូវការតាមដានគម្រោង ជំនួយដោះស្រាយបញ្ហា និងវគ្គសំណួរ និងចម្លើយ ដើម្បីដោះស្រាយសំណួរណាមួយដែលទាក់ទងនឹងលទ្ធផល។
លក្ខណៈបច្ចេកទេសសេវាកម្ម
| សេវាកម្ម | យុទ្ធសាស្ត្ររៀបលំដាប់ | ការគ្រប់គ្រងគុណភាព |
| សេចក្តីព្រាងហ្សែន | អ៊ីលូមីណា PE150 100x | Q30≥85% |
| ហ្សែនល្អិតល្អន់ | ការស្ទង់មតិហ្សែន៖ Illumina PE150 50 x ការផ្គុំ៖ PacBio HiFi 30x ឬ Nanopore 100x | contig N50 ≥1Mb (Pacbio កោសិកាតែមួយ) contig N50 ≥2Mb (ONT កោសិកាតែមួយ) contig N50 ≥500kb (ផ្សេងៗ) |
តម្រូវការសេវាកម្ម
| កំហាប់ (ng/µL) | បរិមាណសរុប (µg) | បរិមាណ (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| ប៉ាក់ប៊ីយ៉ូ | ≥២០ | ≥2 | ≥២០ | ១.៧-២.២ | ≥1.6 |
| រន្ធណាណូ | ≥៤០ | ≥2 | ≥២០ | ១.៧-២.២ | ១.០-៣.០ |
| អ៊ីលូមីណា | ≥1 | ≥0.06 | ≥២០ | - | - |
ផ្សិតកោសិកាតែមួយ៖ ≥3.5x1010 កោសិកា
ផ្សិតម៉ាក្រូ៖ ≥10 ក្រាម
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការដឹកជញ្ជូនគំរូ
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
ការរៀបចំលំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
រួមបញ្ចូលការវិភាគដូចខាងក្រោម៖
ការស្ទង់មតិហ្សែន៖
- ការគ្រប់គ្រងគុណភាពទិន្នន័យលំដាប់លំដោយ
- ការប៉ាន់ស្មានហ្សែន៖ ទំហំ ភាពខុសប្លែកគ្នានៃហ្សែន ធាតុដដែលៗ
ការផ្គុំហ្សែនល្អិតល្អន់៖
- ការគ្រប់គ្រងគុណភាពទិន្នន័យលំដាប់លំដោយ
- ដឺ ណូវ៉ូការផ្គុំ
- ការវិភាគសមាសធាតុហ្សែន៖ ការព្យាករណ៍នៃ CDS និងធាតុហ្សែនច្រើន
- ចំណារពន្យល់មុខងារជាមួយមូលដ្ឋានទិន្នន័យទូទៅច្រើន (GO, KEGG ជាដើម) និងមូលដ្ឋានទិន្នន័យកម្រិតខ្ពស់ (CARD, CAZy ជាដើម)
ការស្ទង់មតិហ្សែន៖ ការចែកចាយ k-mer
ការផ្គុំហ្សែន៖ ចំណារពន្យល់ហ្សែនដូចគ្នា (មូលដ្ឋានទិន្នន័យ NR)
ការផ្គុំហ្សែន៖ ការចំណារពន្យល់ហ្សែនមុខងារ (GO)
ស្វែងយល់ពីវឌ្ឍនភាពដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មផ្គុំហ្សែនផ្សិតរបស់ BMKGene តាមរយៈការប្រមូលផ្ដុំសៀវភៅដែលបានរៀបចំយ៉ាងល្អ។
Hao, J. et al. (2023) 'ការវិភាគទម្រង់អូមិករួមបញ្ចូលគ្នានៃផ្សិតឱសថ Inonotus obliquus ក្រោមលក្ខខណ្ឌលិចទឹក',ហ្សែន BMC, 24(1), ទំព័រ 1–12។ doi: 10.1186/S12864-023-09656-Z/FIGURES/3។
Lu, L. et al. (2023) 'ការធ្វើលំដាប់ហ្សែនបង្ហាញពីការវិវត្តន៍ និងយន្តការបង្កជំងឺនៃភ្នាក់ងារបង្កជំងឺចំណុចភ្នែកមុតស្រួចនៃស្រូវសាលី Rhizoctonia cerealis',ទិនានុប្បវត្តិដំណាំ, ១១(២), ទំព័រ ៤០៥–៤១៦។ doi: 10.1016/J.CJ.2022.07.024 ។
Zhang, H. et al. (2023) 'ធនធានហ្សែនសម្រាប់ប្រភេទសត្វ Clareedia ចំនួនបួនដែលបណ្តាលឱ្យមានចំណុចដុល្លារលើស្មៅចម្រុះ',ជំងឺរុក្ខជាតិ, 107(3), ទំព័រ 929–934។ doi: 10.1094/PDIS-08-22-1921-A
Zhang, SS et al. (2023) 'ភស្តុតាងហ្សែន និងម៉ូលេគុលនៃប្រព័ន្ធរួមរ័ក Tetrapolar នៅក្នុងផ្សិតដែលអាចបរិភោគបាន Grifola frondosa',ទិនានុប្បវត្តិផ្សិត, 9(10), ទំព័រ 959។ doi: 10.3390/JOF9100959/S1។
