ហ្សែនផ្សិត
អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម
● យុទ្ធសាស្រ្តបន្តបន្ទាប់គ្នាជាច្រើនដែលមានសម្រាប់គោលដៅស្រាវជ្រាវផ្សេងៗគ្នា
● មានបទពិសោធន៍ខ្ពស់ក្នុងការប្រមូលផ្តុំហ្សែនផ្សិត ជាមួយនឹងការប្រមូលផ្តុំហ្សែនពេញលិង្គជាង 10,000 ។
● ក្រុមគាំទ្របច្ចេកទេសបន្ទាប់ពីការលក់ប្រកបដោយវិជ្ជាជីវៈដែលបំពេញតម្រូវការស្រាវជ្រាវជាក់លាក់បន្ថែមទៀត។
លក្ខណៈបច្ចេកទេសនៃសេវាកម្ម
| សេវាកម្ម | យុទ្ធសាស្រ្តលំដាប់ | ធានាគុណភាព | ពេលវេលាបង្វិលតាមការប៉ាន់ស្មាន |
| ផែនទីដ៏ល្អនៃផ្សិត | Illumina 50X + Nanopore 100X | ទំនាក់ទំនង N50≥2 Mb | 35 ថ្ងៃធ្វើការ |
| PacBio HiFi 30X | |||
| ផែនទីពេញលេញនៃលិង្គផ្សិត | Illumina 50X + Nanopore 100X (Pacbio HiFi 30X) + Hi-C 100X | សមាមាត្រយុថ្កាក្រូម៉ូសូម > 90% | 45 ថ្ងៃធ្វើការ |
ការវិភាគជីវវិទ្យា
● ការគ្រប់គ្រងគុណភាពទិន្នន័យឆៅ
● ការជួបប្រជុំហ្សែន
● ការវិភាគសមាសធាតុហ្សែន
● ចំណារពន្យល់អំពីមុខងារហ្សែន
● ការវិភាគហ្សែនប្រៀបធៀប
តម្រូវការគំរូ និងការដឹកជញ្ជូន
តម្រូវការគំរូ៖
សម្រាប់ការដកស្រង់ DNA:
| ប្រភេទគំរូ | ចំនួនទឹកប្រាក់ | ការប្រមូលផ្តុំ | ភាពបរិសុទ្ធ |
| ការដកស្រង់ DNA | 1.2 μg | 20 ng / μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
សម្រាប់គំរូជាលិកា៖
| ប្រភេទគំរូ | ការព្យាបាលគំរូដែលបានណែនាំ | ការផ្ទុកគំរូនិងការដឹកជញ្ជូន |
| ផ្សិត Unicellular | សង្កេតមើលផ្សិតនៅក្រោមមីក្រូទស្សន៍ ហើយប្រមូលពួកវាក្នុងដំណាក់កាលអិចស្ប៉ូណង់ស្យែលរបស់វា។ ផ្ទេរវប្បធម៌ (ដែលមានកោសិកាប្រហែល 3-4.5e9) ចូលទៅក្នុង eppendorf 1.5 ឬ 2 មីលីលីត្រ។(រក្សាលើទឹកកក) ច្របាច់បំពង់រយៈពេល 1 នាទីក្នុងកម្រិត 14000 ក្រាម ដើម្បីប្រមូលបាក់តេរី និងយកសារធាតុ supernatant ចេញដោយប្រុងប្រយ័ត្ន។ បិទបំពង់ និងបង្កកបាក់តេរីក្នុងអាសូតរាវយ៉ាងហោចណាស់ 1-3 ម៉ោង។ទុកបំពង់ក្នុងទូរទឹកកក -80 ℃។ | បង្កកសំណាកក្នុងអាសូតរាវរយៈពេល 3-4 ម៉ោង ហើយរក្សាទុកក្នុងអាសូតរាវ ឬ -80 ដឺក្រេ ដល់ការកក់រយៈពេលយូរ។ការដឹកជញ្ជូនគំរូជាមួយទឹកកកស្ងួតត្រូវបានទាមទារ។ |
| ផ្សិតម៉ាក្រូ | ជាលិកាក្នុងដំណាក់កាលលូតលាស់យ៉ាងសកម្មត្រូវបានណែនាំ។ លាងជម្រះជាលិកាដោយទឹកដែលគ្មានសារធាតុ endotoxin បន្ទាប់មក 70% ethonal ។ រក្សាទុកគំរូនៅក្នុងបំពង់ cryo ។ |
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការចែកចាយគំរូ
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
លំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
1.Circos ដ្យាក្រាមលើសមាសធាតុហ្សែនផ្សិត
ការវិភាគហ្សែនប្រៀបធៀប៖ មែកធាង Phylogenetic
