មេតាបូឡូមិក
លក្ខណៈពិសេស
●មិនមែនមេតាបូឡូមិកគោលដៅ (ការរកឃើញមេតាបូឡូមិក)
ដោយផ្អែកលើបច្ចេកវិទ្យាក្រូម៉ាតូក្រាហ្វី-ម៉ាសស្ពិចត្រូម៉ែត្រីរាវ (LC-MS) មេតាបូឡូមិកមិនកំណត់គោលដៅអាចឱ្យមានការរកឃើញដោយមិនលំអៀងនៃសារធាតុរំលាយអាហារម៉ូលេគុលតូចៗឱ្យបានច្រើនតាមដែលអាចធ្វើទៅបាននៅក្នុងគំរូជីវសាស្រ្តដូចជាកោសិកា ជាលិកា សរីរាង្គ ឬសារធាតុរាវក្នុងរាងកាយ។ វាធ្វើការវិភាគប្រៀបធៀបរវាងក្រុមពិសោធន៍ និងក្រុមត្រួតពិនិត្យ ត្រួតពិនិត្យសារធាតុរំលាយអាហារឌីផេរ៉ង់ស្យែលតាមរយៈការវិភាគស្ថិតិ។
● មេតាបូឡូមិកមិនកំណត់គោលដៅសម្រាប់ជាតិខ្លាញ់
ការប្រើប្រាស់បច្ចេកវិទ្យារាវក្រូម៉ាតូក្រាហ្វី-ម៉ាសស្ពិចត្រូម៉ែត្រី (LC-MS)nបច្ចេកវិទ្យា Metabolomics for Lipids ដែលផ្តោតលើគោលដៅ សម្រេចបាននូវការរកឃើញដោយមិនលំអៀងនៃម៉ូលេគុល lipid ឱ្យបានច្រើនតាមដែលអាចធ្វើទៅបាននៅក្នុងគំរូជីវសាស្រ្ត រួមទាំងកោសិកា ជាលិកា សរីរាង្គ ឬសារធាតុរាវក្នុងរាងកាយ។
● ធំទូលាយ-មេតាបូឡូមិកគោលដៅ
សេវាកម្មនេះរួមបញ្ចូលគ្នាយ៉ាងល្អឥតខ្ចោះនូវគុណសម្បត្តិដែលមានគុណភាពបង្ហាញខ្ពស់ និងគ្របដណ្តប់យ៉ាងទូលំទូលាយនៃបច្ចេកវិទ្យាមិនកំណត់គោលដៅ ជាមួយនឹងភាពរសើបខ្ពស់ និងសមត្ថភាពវាស់វែងបរិមាណត្រឹមត្រូវនៃបច្ចេកវិទ្យា MRM (ការត្រួតពិនិត្យប្រតិកម្មច្រើន) គោលដៅ។ លំហូរការងារមានដូចខាងក្រោម៖ ទីមួយ ម៉ាស្សស្ពិចត្រូម៉ែត្រីដែលមានគុណភាពបង្ហាញខ្ពស់ត្រូវបានប្រើដើម្បីអនុវត្តការស្កេន MS² គ្របដណ្តប់ខ្ពស់ខ្លាំងលើគំរូ ដើម្បីទទួលបានវិសាលគម MS² នៃសារធាតុរំលាយ "ទាំងអស់"។ បន្ទាប់មក ការកំណត់អត្តសញ្ញាណសារធាតុរំលាយត្រឹមត្រូវត្រូវបានធ្វើឡើងដោយការផ្សំជាមួយបណ្ណាល័យ MS² ដែលមានគុណភាពបង្ហាញខ្ពស់ (គ្របដណ្តប់សារធាតុរំលាយជាង 25,000 ជាមួយនឹងវិសាលគម MS² ដែលមានគុណភាពបង្ហាញខ្ពស់ស្តង់ដារច្រើនសម្រាប់សារធាតុរំលាយនីមួយៗ)។ បន្ទាប់មក ព័ត៌មានគូអ៊ីយ៉ុង MRM ត្រូវបានស្រង់ចេញពីវិសាលគមម៉ាស ដើម្បីបង្កើតបណ្ណាល័យជាក់លាក់សម្រាប់គំរូ។ ជាចុងក្រោយ ម៉ាស្សស្ពិចត្រូម៉ែត្រីបីជ្រុងជាមួយបច្ចេកវិទ្យា MRM ត្រូវបានអនុវត្តសម្រាប់ការវាស់វែងបរិមាណត្រឹមត្រូវ។
● មេតាបូលីកគោលដៅ
ការវិភាគមេតាបូឡូមិកគោលដៅផ្តោតលើសមាសធាតុគោលដៅជាច្រើន ឬសារធាតុមេតាបូលីតទាំងអស់/ដោយផ្នែកដែលពាក់ព័ន្ធនឹងផ្លូវជាក់លាក់មួយ។ ដោយប្រើសារធាតុស្តង់ដារ វាបង្កើតវិធីសាស្ត្ររកឃើញដែលមានភាពជាក់លាក់ខ្លាំង ភាពរសើបខ្ពស់ និងសមត្ថភាពធ្វើម្តងទៀតបានល្អសម្រាប់ការវាស់វែង និងការវិភាគសមាសធាតុគោលដៅ។ វាទទួលយកស្តង់ដារខាងក្រៅរួមផ្សំជាមួយស្តង់ដារខាងក្នុងសម្រាប់ការវាស់វែងដាច់ខាត ជាមួយនឹងលីនេអ៊ែរនៃខ្សែកោងស្តង់ដារឈានដល់ជាង 0.99 និងភាពរសើបរហូតដល់កម្រិត ng/mL។
គុណសម្បត្តិ
●វេទិការកឃើញកម្រិតខ្ពស់
-បំពាក់ដោយម៉ាស៊ីនវាស់ម៉ាសដែលមានគុណភាពបង្ហាញខ្ពស់លំដាប់កំពូល និងម៉ាស៊ីនវាស់ម៉ាសបីជ្រុងបួនប៉ូល ដែលអាចឱ្យមានការរកឃើញ និងវិភាគសារធាតុរំលាយអាហាររាប់ពាន់ប្រភេទក្នុងពេលដំណាលគ្នា។
●មូលដ្ឋានទិន្នន័យដ៏ទូលំទូលាយ
- មូលដ្ឋានទិន្នន័យសាធារណៈ៖ គ្របដណ្តប់លើ METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas និង Lipidmaps ដែលរួមបញ្ចូលសារធាតុរំលាយអាហារជាង 500,000។
- ផ្ទៃក្នុងមូលដ្ឋានទិន្នន័យជាក់លាក់របស់រុក្ខជាតិ៖ មានសារធាតុរំលាយអាហារជាង 25,000 រួមទាំងសារធាតុរំលាយអាហារបឋម និងបន្ទាប់បន្សំ។
- ផ្ទៃក្នុងមូលដ្ឋានទិន្នន័យជាក់លាក់លើសត្វ/វេជ្ជសាស្ត្រ៖ រួមបញ្ចូលសារធាតុរំលាយអាហារជាង 12,000។
●ប្រព័ន្ធត្រួតពិនិត្យគុណភាពយ៉ាងតឹងរ៉ឹង
-ការគ្រប់គ្រងគុណភាពយ៉ាងតឹងរ៉ឹង ដែលគ្របដណ្តប់លើស្ថេរភាពឧបករណ៍ សំណល់សារធាតុ ការត្រួតពិនិត្យគុណភាព (QC) នៃសំណាក PCA និងការវិភាគសហសម្ព័ន្ធ ដើម្បីធានាបាននូវគុណភាពទិន្នន័យដែលអាចទុកចិត្តបាន។
●សមត្ថភាពរកឃើញមេតាបូលីតខ្ពស់
- មិនមែនមេតាបូឡូមិកគោលដៅ៖ រកឃើញមេតាបូលីតជាមធ្យមជាង 4,200 ក្នុងមួយការរត់ ដែលល្អសម្រាប់ការរុករកមេតាបូលីតដែលមិនស្គាល់នៅក្នុងគំរូ និងកំណត់អត្តសញ្ញាណមេតាបូលីតនៅក្នុងគំរូស្មុគស្មាញ។
- ធំទូលាយ-មេតាបូឡូមិកគោលដៅ (រុក្ខជាតិ): រកឃើញមេតាបូលីតជាមធ្យមជាង 2,410 ក្នុងមួយការរត់ រួមទាំងមេតាបូលីតបឋម និងបន្ទាប់បន្សំ។
- ធំទូលាយ-ការវាស់ស្ទង់មេតាបូលីសគោលដៅ (សត្វ)៖ រកឃើញមេតាបូលីសជាមធ្យមជាង 1,250 ក្នុងមួយការរត់។
- មេតាបូឡូមិកគោលដៅ៖ បន្ទះសម្រាប់ប្រភេទមេតាបូលីតច្រើន។
●ការវិភាគដ៏ទូលំទូលាយ
-ផ្តល់ជូននូវធាតុវិភាគជាង 10 និងតារាងមើលឃើញជាង 20។
●សេវាកម្មក្រោយពេលលក់ដ៏ឈ្លាសវៃ
-ផ្តល់ការពិគ្រោះយោបល់បន្ទាប់ពីការលក់ និងការគាំទ្រការបកស្រាយរបាយការណ៍ចុងក្រោយ។
លក្ខណៈបច្ចេកទេសសេវាកម្ម
| ដំណោះស្រាយ | វេទិកា | ការចម្លងជីវសាស្រ្តដែលបានណែនាំ |
|---|---|---|
| មេតាបូឡូមិកមិនកំណត់គោលដៅ | UHPLC-TOF-MS (Waters Xevo G2-XS QTof) | សំណាករុក្ខជាតិ និងអតិសុខុមប្រាណ៖ ≥ 6 គំរូសត្វ៖ ≥ ១០ សំណាកគ្លីនិក៖ ≥ 30 គំរូចម្លងជីវសាស្រ្តទាំងអស់ត្រូវបានវិភាគដោយឯករាជ្យ។ |
| មេតាបូឡូមិកដែលមានគោលដៅទូលំទូលាយ | ទឹក Xevo G2-XS QTOF + AB Sciex QTRAP 6500+ | គំរូរុក្ខជាតិ៖ ≥ 3 |
| មេតាបូឡូមិកគោលដៅ | UHPLC-QQQ-MS (AB Sciex QTRAP 6500+) GC-MS (Agilent 7890-5977, Agilent 7820-5977) | គំរូរុក្ខជាតិ៖ ≥ 3 គំរូសត្វ៖ ≥ 6 |
តម្រូវការគំរូ
តើអ្នកកំពុងឆ្ងល់ថាតើសំណាករបស់អ្នកបំពេញតាមលក្ខណៈវិនិច្ឆ័យរបស់យើងដែរឬទេ? ចុចទីនេះដើម្បីទទួលបានតម្រូវការគំរូចុងក្រោយបំផុត.
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការប្រមូលគំរូ
ការស្រង់ចេញមេតាបូលីត
ការទទួលបានទិន្នន័យ
ការវិភាគទិន្នន័យ
ការដឹកជញ្ជូនទិន្នន័យ
១. សំឡេងរំខានផ្ទៃខាងក្រោយ និងដំណើរការទិន្នន័យឆៅដែលមានគុណភាពទាប
២. ការវាយតម្លៃគុណភាពទិន្នន័យ
២.១ ការវិភាគសមាសធាតុសំខាន់ៗ
២.២ ការវាយតម្លៃលទ្ធភាពនៃការបន្តពូជ
៣. ចំណារពន្យល់អំពីមេតាបូលីត
៣.១ ចំណារពន្យល់មូលដ្ឋានទិន្នន័យ KEGG
៣.២ ចំណារពន្យល់មូលដ្ឋានទិន្នន័យ HMDB
៣.៣ ចំណារពន្យល់មូលដ្ឋានទិន្នន័យ Lipidmaps
៤. ការវិភាគទិន្នន័យការដាក់ជាក្រុមគំរូ (ការចម្លងជីវសាស្រ្ត)≥3)
៤.១ ការវិភាគសមាសធាតុចម្បងរបស់ក្រុម
៤.២ ការវិភាគឌីស្គ្រីមីណង់ផ្នែកការ៉េតូចបំផុតដោយផ្នែកអ័រថូហ្គោណល (OPLS-DA)
៤.៣ ការវិភាគមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែលក្រុម
៥. ការជ្រើសរើសមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល (ការចម្លងជីវសាស្រ្ត)≥3)
៥.១ ការវិភាគការផ្លាស់ប្តូរផ្នត់ឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៥.២ គ្រោងភ្នំភ្លើងមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៥.៣ ផែនទីកំដៅចង្កោមមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៥.៤ គ្រោងសហសម្ព័ន្ធមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៥.៥ គ្រោងពិន្ទុ Z នៃសារធាតុរំលាយអាហារឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៥.៦ ការវិភាគគ្រោងរ៉ាដាមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៥.៧ គ្រោងវីយូឡុងមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៥.៨ គ្រោងប្រអប់មេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៥.៩ ការវិភាគមុខងារ និងបង្កើនសារធាតុរំលាយអាហារឌីផេរ៉ង់ស្យែល KEGG
៥.១០ ការវិភាគខ្សែកោង ROC
៥.១១ ការដាក់ជាក្រុមមធ្យម k នៃសារធាតុរំលាយអាហារឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៥.១២ ដ្យាក្រាម Venn នៃសារធាតុរំលាយអាហារឌីផេរ៉ង់ស្យែល
១. ការវាយតម្លៃគុណភាពទិន្នន័យ
↑Cការវិភាគទំនាក់ទំនង(គំរូសាកល្បង/គំរូត្រួតពិនិត្យគុណភាព)
↑ការវិភាគសមាសភាគចម្បង ↑ការវិភាគចង្កោមមេតាបូលីត
២. ចំណារពន្យល់អំពីមេតាបូលីត
↑ចំណារពន្យល់មូលដ្ឋានទិន្នន័យ KEGG↑ចំណារពន្យល់មូលដ្ឋានទិន្នន័យ HMDB
↑ចំណារពន្យល់មូលដ្ឋានទិន្នន័យ Lipidmaps
៣. ការវិភាគទិន្នន័យការដាក់ជាក្រុមគំរូ (ការចម្លងជីវសាស្រ្ត)≥3)
↑ការវិភាគសមាសធាតុចម្បងរបស់ក្រុម(២D/៣D)
↑ការវិភាគឌីស្គ្រីមីណង់ផ្នែកការ៉េតូចបំផុតដោយផ្នែកអ័រថូហ្គោណល (OPLS-DA)
៤. ការជ្រើសរើសមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល (ការចម្លងជីវសាស្រ្ត)≥3)
↑ការវិភាគការផ្លាស់ប្តូរផ្នត់ឌីផេរ៉ង់ស្យែល↑គ្រោងភ្នំភ្លើងនៃសារធាតុរំលាយអាហារឌីផេរ៉ង់ស្យែល
↑ផែនទីកំដៅចង្កោមមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល↑គ្រោងសហសម្ព័ន្ធមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល
↑គ្រោងពិន្ទុ Z នៃសារធាតុរំលាយអាហារឌីផេរ៉ង់ស្យែល↑ការវិភាគគ្រោងរ៉ាដាមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល
↑គ្រោងវីយូឡុងមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល↑គ្រោងប្រអប់មេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល
↑ការវិភាគចំណារពន្យល់មុខងារ និងបង្កើនសារធាតុរំលាយអាហារឌីផេរ៉ង់ស្យែល KEGG
↑ការវិភាគខ្សែកោង ROC↑ការដាក់ជាចង្កោមមេតាបូលីតឌីផេរ៉ង់ស្យែល k-means
↑ឌីផេរ៉ង់ស្យែលមេតាបូលីត Venn
Wang X, Wang D, Liu X, Zhang H, Chen G, Xu M, Shen X, You C. កត្តាចម្លងហូមីអូដូមេនដូច BEL1 SAWTOOTH1 (MdSAW1) នៅក្នុង Malus domestica បង្កើនការអត់ធ្មត់របស់ផ្លែប៉ោមប្តូរហ្សែន និង Arabidopsis ចំពោះភាពតានតឹងលើសស័ង្កសី។ Int J Biol Macromol. ឧសភា 2025;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub ថ្ងៃទី 10 ខែមីនា ឆ្នាំ 2025។ PMID: 40074134.
Ain QU, Hussain HA, Rahman L, Zhang Q, Rehman A, Hussain S, Uddin S, Imran A. ឥទ្ធិពលអន្តរកម្មនៃភាគល្អិតណាណូពណ៌បៃតងដែលសម្របសម្រួលដោយ Moringa oleifera និងផ្សិត mycorrhizal arbuscular លើការលូតលាស់ ស្ថាបត្យកម្មប្រព័ន្ធឫស និងការស្រូបយកសារធាតុចិញ្ចឹមនៅក្នុងពោត (Zea mays L.)។ Plant Physiol Biochem។ ខែកញ្ញា ឆ្នាំ២០២៥;២២៦:១១០០៦៣។ doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063។ Epub ថ្ងៃទី២៤ ខែឧសភា ឆ្នាំ២០២៥។ PMID: ៤០៤៤១០៩៦។
Wang X, Luo J, Wang Q, Zhang Q, Zhao T, Liu Y, Li T, Liu X, Jiang J. ផ្កាម្លិះធ្វើឱ្យសកម្មម៉ូឌុលដូច SlJAZ2/3-SlMYC3 ដែលគ្រប់គ្រងការស្រូបយក K+ នៅក្នុងប៉េងប៉ោះឆ្លើយតបទៅនឹងភាពតានតឹង K+ ទាប។ J Integr Plant Biol. 2025 សីហា;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub ថ្ងៃទី 28 ខែឧសភា ឆ្នាំ 2025។ PMID: 40432500.
