page_head_bg

ផលិតផល

លំដាប់មេតាណុល (NGS)

Metagenome សំដៅលើបណ្តុំនៃសម្ភារៈហ្សែនសរុបនៃសហគមន៍ចម្រុះនៃសារពាង្គកាយ ដូចជា metagenome បរិស្ថាន មេតាហ្សែនរបស់មនុស្ស។ល។ វាមានហ្សែននៃអតិសុខុមប្រាណដែលអាចដាំដុះបាន និងមិនអាចដាំដុះបាន។លំដាប់ Metagenomic គឺជាឧបករណ៍ម៉ូលេគុលដែលប្រើដើម្បីវិភាគសម្ភារៈហ្សែនចម្រុះដែលស្រង់ចេញពីសំណាកបរិស្ថាន ដែលផ្តល់ព័ត៌មានលំអិតអំពីភាពសម្បូរបែបនៃប្រភេទសត្វ រចនាសម្ព័ន្ធចំនួនប្រជាជន ទំនាក់ទំនង phylogenetic ហ្សែនមុខងារ និងបណ្តាញទំនាក់ទំនងជាមួយកត្តាបរិស្ថាន។

វេទិកា៖Illumina NovaSeq6000


ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

លទ្ធផលសាកល្បង

ករណី​សិក្សា

អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម

Øភាពឯកោ និង​ការដាំដុះ​ដោយ​គ្មាន​ការ​ដាំដុះ​សម្រាប់​ការ​បង្កើត​ទម្រង់​សហគមន៍​អតិសុខុមប្រាណ

Øគុណភាពបង្ហាញខ្ពស់ក្នុងការរកឃើញប្រភេទសត្វដែលមានបរិមាណតិចនៅក្នុងគំរូបរិស្ថាន

Øគំនិតនៃ "មេតា-" រួមបញ្ចូលលក្ខណៈជីវសាស្រ្តទាំងអស់នៅកម្រិតមុខងារ កម្រិតប្រភេទ និងកម្រិតហ្សែន ដែលឆ្លុះបញ្ចាំងពីទិដ្ឋភាពថាមវន្តដែលខិតទៅជិតការពិត។

ØBMK ប្រមូលផ្តុំបទពិសោធន៍ដ៏ធំនៅក្នុងប្រភេទគំរូចម្រុះជាមួយនឹងគំរូជាង 10,000 ត្រូវបានដំណើរការ។

លក្ខណៈបច្ចេកទេសនៃសេវាកម្ម

លំដាប់វេទិកា

បណ្ណាល័យ

ទិន្នផលទិន្នន័យដែលបានណែនាំ

ពេលវេលាបង្វិលតាមការប៉ាន់ស្មាន

Illumina NovaSeq 6000

PE250

ស្លាក 50K/100K/300K

30 ថ្ងៃ។

ការវិភាគជីវវិទ្យា

üការត្រួតពិនិត្យគុណភាពទិន្នន័យឆៅ

üការជួបប្រជុំគ្នា metagenome

üសំណុំហ្សែនមិនប្រើឡើងវិញ និងចំណារពន្យល់

üការវិភាគភាពចម្រុះនៃប្រភេទសត្វ

üការវិភាគមុខងារហ្សែន

üការវិភាគអន្តរក្រុម

üការវិភាគសមាគមប្រឆាំងនឹងកត្តាពិសោធន៍

2

តម្រូវការគំរូ និងការដឹកជញ្ជូន

តម្រូវការគំរូ៖

សម្រាប់ការដកស្រង់ DNA:

ប្រភេទគំរូ

ចំនួនទឹកប្រាក់

ការប្រមូលផ្តុំ

ភាព​បរិសុទ្ធ

ការដកស្រង់ DNA

> ៣០ ង

1 ng / μl

OD260/280= 1.6-2.5

សម្រាប់គំរូបរិស្ថាន៖

ប្រភេទគំរូ

នីតិវិធីគំរូដែលបានណែនាំ

ដី

បរិមាណគំរូ៖ ប្រហាក់ប្រហែល។5 ក្រាម;សារធាតុក្រៀមស្វិតដែលនៅសេសសល់ត្រូវតែយកចេញពីផ្ទៃ។កិនបំណែកធំ ៗ និងឆ្លងកាត់តម្រង 2 មម;គំរូ Aliquot នៅក្នុងបំពង់ EP-tube ឬ cyrotube ដែលគ្មានមេរោគសម្រាប់ការកក់ទុក។

លាមក

បរិមាណគំរូ៖ ប្រហាក់ប្រហែល។5 ក្រាម;ប្រមូលនិង aliquot គំរូនៅក្នុង EP-tube មាប់មគឬ cryotube សម្រាប់ការកក់ទុក។

មាតិកាពោះវៀន

គំរូចាំបាច់ត្រូវដំណើរការក្រោមលក្ខខណ្ឌ aseptic ។លាងសម្អាតជាលិកាដែលប្រមូលបានជាមួយ PBS;Centrifuge PBS និងប្រមូល precipitant នៅក្នុង EP-tubes ។

ភក់

បរិមាណគំរូ៖ ប្រហាក់ប្រហែល។5 ក្រាម;ប្រមូលនិង aliquot សំណាកសំណល់នៅក្នុងបំពង់ EP-tube ឬ cryotube ដែលគ្មានមេរោគសម្រាប់ការកក់ទុក

ធុងទឹក។

សម្រាប់សំណាកដែលមានបរិមាណអតិសុខុមប្រាណមានកំណត់ ដូចជាទឹកម៉ាស៊ីន ទឹកអណ្តូងជាដើម ប្រមូលទឹកយ៉ាងតិច 1 លី ហើយឆ្លងកាត់តម្រង 0.22 μm ដើម្បីពង្រឹងមីក្រូជីវជាតិនៅលើភ្នាស។ទុកភ្នាសក្នុងបំពង់មាប់មគ។

ស្បែក

ជូតផ្ទៃស្បែកដោយប្រុងប្រយ័ត្នដោយប្រើកប្បាសក្រៀវ ឬកាំបិតវះកាត់ ហើយដាក់វានៅក្នុងបំពង់មាប់មគ។

ការដឹកជញ្ជូនគំរូដែលបានណែនាំ

បង្កកសំណាកក្នុងអាសូតរាវរយៈពេល 3-4 ម៉ោង ហើយរក្សាទុកក្នុងអាសូតរាវ ឬ -80 ដឺក្រេ ដល់ការកក់រយៈពេលយូរ។ការដឹកជញ្ជូនគំរូជាមួយទឹកកកស្ងួតត្រូវបានទាមទារ។

លំហូរការងារសេវាកម្ម

logo_02

ការចែកចាយគំរូ

logo_04

ការសាងសង់បណ្ណាល័យ

logo_05

លំដាប់

logo_06

ការវិភាគ​ទិន្នន័យ

logo_07

សេវាកម្មក្រោយពេលលក់


  • មុន៖
  • បន្ទាប់៖

  • 1.Histogram: ការចែកចាយប្រភេទសត្វ

    3

    2.ហ្សែនមុខងារដែលបានរៀបរាប់អំពីផ្លូវមេតាបូលីក KEGG

    4

    3. ផែនទីកំដៅ៖ មុខងារឌីផេរ៉ង់ស្យែលផ្អែកលើភាពសម្បូរបែបនៃហ្សែនដែលទាក់ទង54.Circos នៃ CARD ហ្សែនធន់នឹងថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិច

    6

    ករណី BMK

    ប្រេវ៉ាឡង់នៃហ្សែនធន់នឹងថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិច និងភ្នាក់ងារបង្ករោគដោយបាក់តេរីនៅតាមបណ្តោយឫសគល់នៃព្រៃកោងកាង

    បោះពុម្ពផ្សាយ៖ទិនានុប្បវត្តិនៃសម្ភារៈគ្រោះថ្នាក់ឆ្នាំ 2021

    យុទ្ធសាស្ត្រតម្រៀប៖

    សមា្ភារៈ៖ ការដកស្រង់ DNA នៃបំណែកបួននៃគំរូដើមកោងកាងដែលពាក់ព័ន្ធ៖ ដីដែលមិនបានដាំ, rhizosphere, episphere និង endosphere compartments
    វេទិកា៖ Illumina HiSeq 2500
    គោលដៅ៖ metagenome
    តំបន់ 16S rRNA ហ្សែន V3-V4

    លទ្ធផលសំខាន់

    ការរៀបចំតាមលំដាប់មេតាណម និងទម្រង់មេតាបាកូដនៅលើដីបន្តពូជនៃដើមកោងកាងត្រូវបានដំណើរការក្នុងគោលបំណងសិក្សាការផ្សព្វផ្សាយហ្សែនធន់នឹងថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិច (ARGs) ពីដីចូលទៅក្នុងរុក្ខជាតិ។ទិន្នន័យ Metagenomic បានបង្ហាញថា 91.4% នៃហ្សែនធន់ទ្រាំនឹងថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិចត្រូវបានសម្គាល់ជាទូទៅនៅក្នុងផ្នែកដីទាំងបួនដែលបានរៀបរាប់ខាងលើ ដែលបង្ហាញពីម៉ូដបន្តបន្ទាប់។16S rRNA amplicon sequencing បានបង្កើត 29,285 លំដាប់ ដែលតំណាងឱ្យ 346 ប្រភេទ។រួមបញ្ចូលគ្នាជាមួយនឹងការបង្រួបបង្រួមប្រភេទសត្វដោយការបន្តពូជ amplicon ការផ្សព្វផ្សាយនេះត្រូវបានគេរកឃើញថាឯករាជ្យនៃ microbiota ដែលមានទំនាក់ទំនងជា root ទោះបីជាយ៉ាងណាក៏ដោយ វាអាចត្រូវបានសម្របសម្រួលដោយការចល័តនៃធាតុហ្សែន។ការសិក្សានេះបានកំណត់លំហូរនៃ ARGs និងភ្នាក់ងារបង្កជំងឺពីដីចូលទៅក្នុងរុក្ខជាតិតាមរយៈការបន្តគ្នានៃដី-ឫស។

    ឯកសារយោង

    Wang, C. , Hu, R. , Strong, PJ, Zhuang, W. , & Shu, L..(ឆ្នាំ ២០២០)។ប្រេវ៉ាឡង់នៃហ្សែនធន់នឹងថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិច និងភ្នាក់ងារបង្ករោគដោយបាក់តេរីនៅតាមបណ្តោយដី-ឫសកោងកាង។ទិនានុប្បវត្តិនៃសម្ភារៈគ្រោះថ្នាក់, ៤០៨, 124985 ។

    ទទួលបានសម្រង់មួយ។

    សរសេរសាររបស់អ្នកនៅទីនេះ ហើយផ្ញើវាមកយើង

    ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកពួកយើង៖