● ការអានលំដាប់វែងលើ Nanopore P48 (បណ្ណាល័យ 10Kb); PacBio Revio (បណ្ណាល័យ 8Kb)
● ការកែកំហុស៖ ការធ្វើលំដាប់លើ Illumina NovaSeq (បណ្ណាល័យ PE150)
●ការផ្គុំមេតាហ្សែនដែលមានគុណភាពខ្ពស់៖ជាមួយនឹង contigs តិចជាងមុន ដែលមាន continuity ខ្ពស់ជាង។
●ភាពត្រឹមត្រូវខ្ពស់ជាង៖ការកំណត់អត្តសញ្ញាណប្រភេទសត្វ និងការព្យាករណ៍ហ្សែនមុខងារ។
●ការផ្គុំដែលប្រសើរឡើងសម្រួលដល់ការញែកហ្សែនបាក់តេរី និងការវិភាគមេតាហ្សែនណូមប្រៀបធៀប។
●ការវិភាគជីវព័ត៌មានវិទ្យាដ៏ទូលំទូលាយ៖ការវិភាគរបស់យើងមិនត្រឹមតែផ្តោតទៅលើភាពចម្រុះនៃចំណាត់ថ្នាក់ប៉ុណ្ណោះទេ ប៉ុន្តែថែមទាំងផ្តោតលើភាពចម្រុះនៃមុខងាររបស់សហគមន៍ផងដែរ។
●បទពិសោធន៍យ៉ាងទូលំទូលាយក្រុមការងាររបស់យើងនាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាច្រើនដល់គម្រោងនីមួយៗ ដោយមានកំណត់ត្រាជោគជ័យក្នុងការបិទគម្រោងមេតាហ្សែនិចច្រើននៅក្នុងវិស័យស្រាវជ្រាវផ្សេងៗ និងដំណើរការគំរូជាង 200,000 ក្រុមការងាររបស់យើងនាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាច្រើនដល់គម្រោងនីមួយៗ។
| វេទិកាលំដាប់ | យុទ្ធសាស្ត្ររៀបលំដាប់ | ទិន្នន័យដែលបានណែនាំ |
| អ៊ីលូមីណា ណូវ៉ាសេក | PE150 | ៦ជីកាបៃ |
| រន្ធណាណូ P48 | ១០ គីឡូបៃ | ៦ / ១០ ជីកាបៃ |
| PacBio Revio | ៨ គីឡូបៃ | ១០ / ២០ ជីកាបៃ |
| កំហាប់ (ng/µL) | បរិមាណសរុប (µg) | បរិមាណ (µL) | |
| បណ្ណាល័យ Illumina PE150 | ≥1 | ≥0.03 | ≥២០ |
| បណ្ណាល័យ Nanopore 10 kb | ≥៤០ | ≥2 | ≥២០ |
| បណ្ណាល័យ PacBio ទំហំ 8 kb | ≥50 | ១០ មីក្រូក្រាម/កោសិកា | ≥២០ |
រួមបញ្ចូលការវិភាគដូចខាងក្រោម៖
● ការគ្រប់គ្រងគុណភាពទិន្នន័យលំដាប់លំដោយ
● ការផ្គុំមេតាហ្សែន និងការទស្សន៍ទាយហ្សែន
● ចំណារពន្យល់ហ្សែន
● ការវិភាគភាពចម្រុះអាល់ហ្វាតាមចំណាត់ថ្នាក់
● ការវិភាគមុខងាររបស់សហគមន៍៖ មុខងារជីវសាស្រ្ត ការរំលាយអាហារ ភាពធន់នឹងថ្នាំអង់ទីប៊ីយ៉ូទិក
● ការវិភាគលើភាពចម្រុះទាំងមុខងារ និងចំណាត់ថ្នាក់៖
ការវិភាគភាពចម្រុះបេតា
ការវិភាគអន្តរក្រុម
ការវិភាគទំនាក់ទំនង៖ រវាងកត្តាបរិស្ថាន និងសមាសភាព និងភាពចម្រុះនៃ OUT
ការចែកចាយសំណុំហ្សែនមិនស្ទួន៖
ការពន្យល់អំពីហ្សែន៖ ផ្លូវ KEGG
ចំណារពន្យល់ហ្សែន៖ eggNOG
ការបញ្ចូលហ្សែន៖ កាបូអ៊ីដ្រាត CAZY
បណ្តាញទំនាក់ទំនងប្រភេទសត្វ៖
ស្វែងយល់ពីវឌ្ឍនភាពដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មលំដាប់មេតាហ្សេណេមិករបស់ BMKGene ជាមួយ Nanopore + Illumina ជាមួយនឹងការបោះពុម្ពផ្សាយពិសេសនេះ៖
Jin, H. et al. (2023) 'ការចងក្រងហ្សែនដែលមានគុណភាពខ្ពស់នៃមីក្រូជីវសាស្រ្តពោះវៀនរបស់មនុស្សនៃជនជាតិម៉ុងហ្គោលីខាងក្នុង', Nature Microbiology 2023 8:1, 8(1), ទំព័រ 150–161។ doi: 10.1038/s41564-022-01270-1។