条形 Banner-០៣

ផលិតផល

ការធ្វើលំដាប់មេតាហ្សែន-TGS

图片៦៧

មេតាហ្សែនណូម គឺជាការប្រមូលផ្តុំនៃសម្ភារៈហ្សែននៃសហគមន៍ចម្រុះនៃសារពាង្គកាយ ដូចជាមេតាហ្សែនណូមបរិស្ថាន និងមនុស្ស។ វាមានហ្សែននៃអតិសុខុមប្រាណដែលអាចដាំដុះបាន និងមិនអាចដាំដុះបាន។ ការធ្វើលំដាប់មេតាហ្សែនណូមអនុញ្ញាតឱ្យមានការសិក្សាអំពីទេសភាពហ្សែនដ៏ស្មុគស្មាញទាំងនេះ ដែលបានបង្កប់នៅក្នុងគំរូអេកូឡូស៊ី ដោយផ្តល់នូវច្រើនជាងការវិភាគពន្ធុវិទ្យា។ វាក៏ផ្តល់នូវទស្សនៈវិស័យហ្សែនមុខងារផងដែរ ដោយស្វែងយល់ពីហ្សែនដែលបានអ៊ិនកូដ និងតួនាទីដែលអាចធ្វើទៅបានរបស់វានៅក្នុងដំណើរការបរិស្ថាន។ ខណៈពេលដែលវិធីសាស្រ្តបាញ់កាំភ្លើងបែបប្រពៃណីជាមួយនឹងការធ្វើលំដាប់អ៊ីលូម៉ាត្រូវបានគេប្រើប្រាស់យ៉ាងទូលំទូលាយនៅក្នុងការសិក្សាមេតាហ្សែនណូម ការមកដល់នៃការធ្វើលំដាប់អានយូររបស់ណាណូផ័រ និងប៉ាក់ប៊ីយ៉ូ បានផ្លាស់ប្តូរវិស័យនេះ។ បច្ចេកវិទ្យាណាណូផ័រ និងប៉ាក់ប៊ីយ៉ូ បង្កើនការវិភាគជីវព័ត៌មានវិទ្យាផ្នែកខាងក្រោម ជាពិសេសការផ្គុំមេតាហ្សែនណូម ដែលធានាបាននូវការផ្គុំជាបន្តបន្ទាប់កាន់តែច្រើន។ របាយការណ៍បង្ហាញថា មេតាហ្សែនណូមដែលមានមូលដ្ឋានលើណាណូផ័រ និងផ្អែកលើប៉ាក់ប៊ីយ៉ូ បានបង្កើតហ្សែនបាក់តេរីពេញលេញ និងបិទជិតដោយជោគជ័យពីមីក្រូជីវសាស្ត្រស្មុគស្មាញ (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020)។ ការរួមបញ្ចូលការអាន Nanopore ជាមួយការអាន Illumina ផ្តល់នូវវិធីសាស្រ្តជាយុទ្ធសាស្ត្រសម្រាប់ការកែកំហុស ដោយកាត់បន្ថយភាពត្រឹមត្រូវទាបដែលមាននៅក្នុង Nanopore។ ការរួមបញ្ចូលគ្នាដ៏ស៊ីសង្វាក់គ្នានេះទាញយកអត្ថប្រយោជន៍ពីចំណុចខ្លាំងនៃវេទិកាស៊ីក្វេននីមួយៗ ដោយផ្តល់នូវដំណោះស្រាយដ៏រឹងមាំមួយដើម្បីយកឈ្នះលើដែនកំណត់ដែលអាចកើតមាន និងជំរុញភាពជាក់លាក់ និងភាពជឿជាក់នៃការវិភាគមេតាហ្សេណូមិក។

វេទិកា៖ Nanopore PromethION 48, Illumia និង PacBio Revio


ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

ជីវព័ត៌មានវិទ្យា

លទ្ធផលសាកល្បង

ការបោះពុម្ពផ្សាយពិសេស

លក្ខណៈពិសេសសេវាកម្ម

● ការអានលំដាប់វែងលើ Nanopore P48 (បណ្ណាល័យ 10Kb); PacBio Revio (បណ្ណាល័យ 8Kb)

● ការកែកំហុស៖ ការធ្វើលំដាប់លើ Illumina NovaSeq (បណ្ណាល័យ PE150)

គុណសម្បត្តិសេវាកម្ម

●ការផ្គុំមេតាហ្សែនដែលមានគុណភាពខ្ពស់៖ជាមួយនឹង contigs តិចជាងមុន ដែលមាន continuity ខ្ពស់ជាង។

●ភាពត្រឹមត្រូវខ្ពស់ជាង៖ការកំណត់អត្តសញ្ញាណប្រភេទសត្វ និងការព្យាករណ៍ហ្សែនមុខងារ។

●ការផ្គុំដែលប្រសើរឡើងសម្រួលដល់ការញែកហ្សែនបាក់តេរី និងការវិភាគមេតាហ្សែនណូមប្រៀបធៀប។

●ការវិភាគជីវព័ត៌មានវិទ្យាដ៏ទូលំទូលាយ៖ការវិភាគរបស់យើងមិនត្រឹមតែផ្តោតទៅលើភាពចម្រុះនៃចំណាត់ថ្នាក់ប៉ុណ្ណោះទេ ប៉ុន្តែថែមទាំងផ្តោតលើភាពចម្រុះនៃមុខងាររបស់សហគមន៍ផងដែរ។

●បទពិសោធន៍យ៉ាងទូលំទូលាយក្រុមការងាររបស់យើងនាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាច្រើនដល់គម្រោងនីមួយៗ ដោយមានកំណត់ត្រាជោគជ័យក្នុងការបិទគម្រោងមេតាហ្សែនិចច្រើននៅក្នុងវិស័យស្រាវជ្រាវផ្សេងៗ និងដំណើរការគំរូជាង 200,000 ក្រុមការងាររបស់យើងនាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាច្រើនដល់គម្រោងនីមួយៗ។

លក្ខណៈបច្ចេកទេសសេវាកម្ម

វេទិកា​លំដាប់

យុទ្ធសាស្ត្រ​រៀប​លំដាប់

ទិន្នន័យដែលបានណែនាំ

អ៊ីលូមីណា ណូវ៉ាសេក

PE150

៦ជីកាបៃ

រន្ធណាណូ P48

១០ គីឡូបៃ

៦ / ១០ ជីកាបៃ

PacBio Revio

៨ គីឡូបៃ

១០ / ២០ ជីកាបៃ

តម្រូវការគំរូ

 

កំហាប់ (ng/µL)

បរិមាណសរុប (µg)

បរិមាណ (µL)

បណ្ណាល័យ Illumina PE150

≥1

≥0.03

≥២០

បណ្ណាល័យ Nanopore 10 kb

≥៤០

≥2

≥២០

បណ្ណាល័យ PacBio ទំហំ 8 kb

≥50

១០ មីក្រូក្រាម/កោសិកា ≥២០

លំហូរការងារសេវាកម្ម

ការដឹកជញ្ជូនគំរូ

ការដឹកជញ្ជូនគំរូ

ការរៀបចំបណ្ណាល័យ

ការសាងសង់បណ្ណាល័យ

ការរៀបចំលំដាប់

ការរៀបចំលំដាប់

ការវិភាគទិន្នន័យ

ការវិភាគទិន្នន័យ

សេវាកម្មក្រោយពេលលក់

សេវាកម្មក្រោយពេលលក់


  • មុន៖
  • បន្ទាប់៖

  • 流程图贝贝第三版-02

    រួមបញ្ចូលការវិភាគដូចខាងក្រោម៖

    ● ការគ្រប់គ្រងគុណភាពទិន្នន័យលំដាប់លំដោយ

    ● ការផ្គុំមេតាហ្សែន និងការទស្សន៍ទាយហ្សែន

    ● ចំណារពន្យល់ហ្សែន

    ● ការវិភាគភាពចម្រុះអាល់ហ្វាតាមចំណាត់ថ្នាក់

    ● ការវិភាគមុខងាររបស់សហគមន៍៖ មុខងារជីវសាស្រ្ត ការរំលាយអាហារ ភាពធន់នឹងថ្នាំអង់ទីប៊ីយ៉ូទិក

    ● ការវិភាគលើភាពចម្រុះទាំងមុខងារ និងចំណាត់ថ្នាក់៖

    ការវិភាគភាពចម្រុះបេតា

    ការវិភាគអន្តរក្រុម

    ការវិភាគទំនាក់ទំនង៖ រវាងកត្តាបរិស្ថាន និងសមាសភាព និងភាពចម្រុះនៃ OUT

    ការចែកចាយសំណុំហ្សែនមិនស្ទួន៖

    图片៦៨ 

    ការ​ពន្យល់​អំពី​ហ្សែន៖ ផ្លូវ KEGG

    图片៦៩ 

    ចំណារពន្យល់ហ្សែន៖ eggNOG

     图片70

     

    ការ​បញ្ចូល​ហ្សែន៖ កាបូអ៊ីដ្រាត CAZY

     图片71

    បណ្តាញទំនាក់ទំនងប្រភេទសត្វ៖

     图片72

    ស្វែងយល់ពីវឌ្ឍនភាពដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មលំដាប់មេតាហ្សេណេមិករបស់ BMKGene ជាមួយ Nanopore + Illumina ជាមួយនឹងការបោះពុម្ពផ្សាយពិសេសនេះ៖

    Jin, H. et al. (2023) 'ការចងក្រងហ្សែនដែលមានគុណភាពខ្ពស់នៃមីក្រូជីវសាស្រ្តពោះវៀនរបស់មនុស្សនៃជនជាតិម៉ុងហ្គោលីខាងក្នុង', Nature Microbiology 2023 8:1, 8(1), ទំព័រ 150–161។ doi: 10.1038/s41564-022-01270-1។

    ទទួលបានសម្រង់តម្លៃ

    សរសេរសាររបស់អ្នកនៅទីនេះ ហើយផ្ញើវាមកយើង

    ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកយើង៖