page_head_bg

ផលិតផល

លំដាប់មេតាណុល - ណាណូប៉ូរ៉េ

Metagenomics គឺជាឧបករណ៍ម៉ូលេគុលដែលប្រើដើម្បីវិភាគវត្ថុធាតុហ្សែនចម្រុះដែលស្រង់ចេញពីសំណាកបរិស្ថាន ដែលផ្តល់ព័ត៌មានលម្អិតអំពីភាពចម្រុះនៃប្រភេទសត្វ និងភាពសម្បូរបែប រចនាសម្ព័ន្ធចំនួនប្រជាជន ទំនាក់ទំនង phylogenetic ហ្សែនមុខងារ និងបណ្តាញទំនាក់ទំនងជាមួយកត្តាបរិស្ថាន។ល។ ដល់ការសិក្សាមេតាណិច។ការសម្តែងដ៏ល្អឥតខ្ចោះរបស់វានៅក្នុងប្រវែងអាន ភាគច្រើនបានពង្រឹងការវិភាគមេតាហ្សែនចុះក្រោម ជាពិសេសការផ្គុំមេតាហ្សែន។ឆ្លៀតយកអត្ថប្រយោជន៍នៃប្រវែងអាន ការសិក្សាមេតាហ្សែនដែលមានមូលដ្ឋានលើ Nanopore គឺអាចសម្រេចបាននូវការប្រមូលផ្តុំជាបន្តបន្ទាប់បន្ថែមទៀត បើប្រៀបធៀបជាមួយមេតាណមបាញ់កាំភ្លើង។វាត្រូវបានគេបោះពុម្ភផ្សាយថា metagenomics ដែលមានមូលដ្ឋានលើ Nanopore បានបង្កើតដោយជោគជ័យនូវហ្សែនបាក់តេរីពេញលេញ និងបិទពី microbiomes (Moss, EL, et. al,ជីវបច្ចេកវិទ្យាធម្មជាតិឆ្នាំ ២០២០)

វេទិកា៖Nanopor PromethION P48


ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

លទ្ធផលសាកល្បង

ករណី BMK

អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម

Øការជួបប្រជុំគ្នាដែលមានគុណភាពខ្ពស់-បង្កើនភាពត្រឹមត្រូវនៃការកំណត់ប្រភេទសត្វ និងការព្យាករណ៍ហ្សែនមុខងារ

Øភាពឯកោនៃហ្សែនបាក់តេរីដែលបិទជិត

Øកម្មវិធីដែលមានអនុភាព និងអាចទុកចិត្តបានកាន់តែច្រើននៅក្នុងតំបន់ចម្រុះ ឧ. ការរកឃើញអតិសុខុមប្រាណបង្កជំងឺ ឬហ្សែនដែលទាក់ទងនឹងភាពធន់នឹងថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិច

Øការវិភាគមេតាហ្សែនប្រៀបធៀប

លក្ខណៈបច្ចេកទេសនៃសេវាកម្ម

លំដាប់វេទិកា

បណ្ណាល័យ

ទិន្នផលទិន្នន័យដែលបានណែនាំ

ពេលវេលាបង្វិលតាមការប៉ាន់ស្មាន

Illumina NovaSeq 6000

PE250

ស្លាក 50K/100K/300K

30 ថ្ងៃ។

ការវិភាគជីវវិទ្យា

üការត្រួតពិនិត្យគុណភាពទិន្នន័យឆៅ

üការជួបប្រជុំគ្នា metagenome

üសំណុំហ្សែនមិនប្រើឡើងវិញ និងចំណារពន្យល់

üការវិភាគភាពចម្រុះនៃប្រភេទសត្វ

üការវិភាគមុខងារហ្សែន

üការវិភាគអន្តរក្រុម

üការវិភាគសមាគមប្រឆាំងនឹងកត្តាពិសោធន៍

2

តម្រូវការគំរូ និងការដឹកជញ្ជូន

តម្រូវការគំរូនិងការដឹកជញ្ជូន

តម្រូវការគំរូ៖   

សម្រាប់ការដកស្រង់ DNA:

ប្រភេទគំរូ

ចំនួនទឹកប្រាក់

ការប្រមូលផ្តុំ

ភាព​បរិសុទ្ធ

ការដកស្រង់ DNA

> ៣០ ង

1 ng / μl

OD260/280= 1.6-2.5

សម្រាប់គំរូបរិស្ថាន៖

ប្រភេទគំរូ

នីតិវិធីគំរូដែលបានណែនាំ

ដី

បរិមាណគំរូ៖ ប្រហាក់ប្រហែល។5 ក្រាម;សារធាតុក្រៀមស្វិតដែលនៅសេសសល់ត្រូវតែយកចេញពីផ្ទៃ។កិនបំណែកធំ ៗ និងឆ្លងកាត់តម្រង 2 មម;គំរូ Aliquot នៅក្នុងបំពង់ EP-tube ឬ cyrotube ដែលគ្មានមេរោគសម្រាប់ការកក់ទុក។

លាមក

បរិមាណគំរូ៖ ប្រហាក់ប្រហែល។5 ក្រាម;ប្រមូលនិង aliquot គំរូនៅក្នុង EP-tube មាប់មគឬ cryotube សម្រាប់ការកក់ទុក។

មាតិកាពោះវៀន

គំរូចាំបាច់ត្រូវដំណើរការក្រោមលក្ខខណ្ឌ aseptic ។លាងសម្អាតជាលិកាដែលប្រមូលបានជាមួយ PBS;Centrifuge PBS និងប្រមូល precipitant នៅក្នុង EP-tubes ។

ភក់

បរិមាណគំរូ៖ ប្រហាក់ប្រហែល។5 ក្រាម;ប្រមូលនិង aliquot សំណាកសំណល់នៅក្នុងបំពង់ EP-tube ឬ cryotube ដែលគ្មានមេរោគសម្រាប់ការកក់ទុក

ធុងទឹក។

សម្រាប់សំណាកដែលមានបរិមាណអតិសុខុមប្រាណមានកំណត់ ដូចជាទឹកម៉ាស៊ីន ទឹកអណ្តូងជាដើម ប្រមូលទឹកយ៉ាងតិច 1 លី ហើយឆ្លងកាត់តម្រង 0.22 μm ដើម្បីពង្រឹងមីក្រូជីវជាតិនៅលើភ្នាស។ទុកភ្នាសក្នុងបំពង់មាប់មគ។

ស្បែក

ជូតផ្ទៃស្បែកដោយប្រុងប្រយ័ត្នដោយប្រើកប្បាសក្រៀវ ឬកាំបិតវះកាត់ ហើយដាក់វានៅក្នុងបំពង់មាប់មគ។

ការដឹកជញ្ជូនគំរូដែលបានណែនាំ

បង្កកសំណាកក្នុងអាសូតរាវរយៈពេល 3-4 ម៉ោង ហើយរក្សាទុកក្នុងអាសូតរាវ ឬ -80 ដឺក្រេ ដល់ការកក់រយៈពេលយូរ។ការដឹកជញ្ជូនគំរូជាមួយទឹកកកស្ងួតត្រូវបានទាមទារ។

លំហូរការងារសេវាកម្ម

logo_02

ការចែកចាយគំរូ

logo_04

ការសាងសង់បណ្ណាល័យ

logo_05

លំដាប់

logo_06

ការវិភាគ​ទិន្នន័យ

logo_07

សេវាកម្មក្រោយពេលលក់


  • មុន៖
  • បន្ទាប់៖

  • 1.Heatmap: ប្រភេទនៃភាពសម្បូរបែបនៃចង្កោម32.ហ្សែនមុខងារដែលបានរៀបរាប់អំពីផ្លូវមេតាបូលីក KEGG43.Species correlation network54.Circos នៃ CARD ហ្សែនធន់នឹងថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិច
    6

    ករណី BMK

    Nanopore metaagenomics អាច​ធ្វើ​ឱ្យ​មាន​ការ​ធ្វើ​រោគ​វិនិច្ឆយ​យ៉ាង​ឆាប់​រហ័ស​នៃ​ការ​ឆ្លង​មេរោគ​ផ្លូវដង្ហើម​ផ្នែក​ខាងក្រោម​បាក់តេរី​

    បោះពុម្ពផ្សាយ៖ជីវបច្ចេកវិទ្យាធម្មជាតិ ឆ្នាំ 2019

    គំនួសពណ៌បច្ចេកទេស
    លំដាប់លំដោយ៖ Nanopore MinION
    គ្លីនីកមេតាណូមិច ជីវព័ត៌មានវិទ្យា៖ ការបំផ្លាញ DNA របស់ម្ចាស់ផ្ទះ ការវិភាគ WIMP និង ARMA
    ការរកឃើញរហ័ស៖ ៦ ម៉ោង។
    ភាពប្រែប្រួលខ្ពស់៖ 96.6%

    លទ្ធផលសំខាន់

    ក្នុងឆ្នាំ 2006 ការឆ្លងមេរោគផ្លូវដង្ហើមផ្នែកខាងក្រោម (LR) បានបណ្តាលឱ្យមនុស្ស 3 លាននាក់បានស្លាប់នៅទូទាំងពិភពលោក។វិធីសាស្រ្តធម្មតាសម្រាប់ការរកឃើញធាតុបង្កជំងឺ LR1 គឺការដាំដុះ ដែលមានភាពរសើបខ្សោយ ពេលវេលាវិលជុំរយៈពេលយូរ និងខ្វះការណែនាំក្នុងការព្យាបាលដោយថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិចដំបូង។ការធ្វើរោគវិនិច្ឆ័យអតិសុខុមប្រាណលឿន និងត្រឹមត្រូវ គឺជាតម្រូវការបន្ទាន់យូរមកហើយ។លោកវេជ្ជបណ្ឌិត Justin មកពីសាកលវិទ្យាល័យ East Anglia និងដៃគូរបស់គាត់បានបង្កើតវិធីសាស្ត្រមេតាណុលដែលមានមូលដ្ឋានលើ Nanopore ដោយជោគជ័យសម្រាប់ការរកឃើញមេរោគ។យោងទៅតាមលំហូរការងាររបស់ពួកគេ 99.99% នៃ DNA របស់ម៉ាស៊ីនអាចនឹងត្រូវអស់។ការរកឃើញមេរោគ និងហ្សែនដែលធន់នឹងថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិច អាចបញ្ចប់ក្នុងរយៈពេល 6 ម៉ោង។

    ឯកសារយោង
    Charalampous, T., Kay, GL, Richardson, H. , Aydin, A. , & O'Grady, J. .(2019)។Nanopore metaagenomics អាច​ធ្វើ​ឱ្យ​មាន​ការ​ធ្វើ​រោគ​វិនិច្ឆយ​យ៉ាង​ឆាប់​រហ័ស​នៃ​ការ​ឆ្លង​មេរោគ​ផ្លូវដង្ហើម​ផ្នែក​ខាងក្រោម​បាក់តេរី​។ជីវវិទ្យាធម្មជាតិ, ៣៧(៧), ១.

    ទទួលបានសម្រង់មួយ។

    សរសេរសាររបស់អ្នកនៅទីនេះ ហើយផ្ញើវាមកយើង

    ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកពួកយើង៖