BMKCloud Log in
条形 Banner-០៣

ព័ត៌មាន

ការវិវត្តន៍ហ្សែន

ហ្សែនណូវ៉ូ
ការជួបប្រជុំ|ការកំណត់ភេទ ការងារបន្តបន្ទាប់គ្នាទាំងមូល និងសេវាកម្មជីវព័ត៌មានដោយផ្នែកត្រូវបានផ្តល់ដោយ Biomarker Techonologies ។

អរូបី

រូបសញ្ញានៃសត្វនាគសមុទ្ររួមមាន ចុងស្លឹកដូចស្លឹក មាត់បំពង់គ្មានធ្មេញ និងការមានផ្ទៃពោះជាបុរសដែលពាក់ព័ន្ធនឹងការភ្ញាស់ពងដែលបង្កកំណើតនៅលើ "បំណះកូន" ។យើង de novo-sequenced genomes បុរស និងស្ត្រីនៃ seadragon ធម្មតា (Phyllopteryx taeniolatus) និងប្រភេទដែលទាក់ទងយ៉ាងជិតស្និទ្ធរបស់វា ត្រីពងក្រពើ (Syngnathoides biaculeatus) ។ទម្រង់ប្រតិចារិកពីភាពថ្មីថ្មោងនៃការវិវត្តន៍ ដែលជាផ្នែកបន្ថែមដូចស្លឹក បង្ហាញថាសំណុំហ្សែនដែលជាធម្មតាពាក់ព័ន្ធនឹងការវិវឌ្ឍន៍ចុងត្រូវបានជ្រើសរើស ក៏ដូចជាការពង្រឹងស្គ្រីបត្រានសម្រាប់ការជួសជុលជាលិកា និងហ្សែនការពារភាពស៊ាំ។zebrafish mutants សម្រាប់ scpp5 ដែលត្រូវបានបាត់បង់នៅក្នុង syngnathids ទាំងអស់ត្រូវបានគេរកឃើញថាមានធ្មេញ pharyngeal ខ្វះខាត ឬខូចទ្រង់ទ្រាយ ដោយគាំទ្រសម្មតិកម្មដែលថាការបាត់បង់ scpp5 បានរួមចំណែកដល់ការបាត់បង់ធ្មេញនៅក្នុង syngnathids ។ការរួមភេទដែលកំណត់ទីតាំងដែលអ៊ិនកូដហ្សែន amhr2y ជាក់លាក់របស់បុរសដែលត្រូវបានចែករំលែកដោយ seadragon ធម្មតា និងត្រី pipefish ក្រពើត្រូវបានកំណត់អត្តសញ្ញាណ។ 

សំភារៈ​និង​វិធី​សា​ស្រ្ត:

សម្ភារៈ

Fនាគសមុទ្រធម្មតារបស់យើង (P. taeniolatus) និង​ត្រី​ពង​ក្រពើ​ពីរ (S. biaculeatus) គំរូ។សត្វនាគសមុទ្រធម្មតាពីរ (ឈ្មោលមួយ និងស្រីមួយ) និង ត្រីពងក្រពើពីរ (ឈ្មោលមួយ និងស្រីមួយ) បុគ្គលត្រូវបានប្រើប្រាស់សម្រាប់ការបន្តពូជហ្សែនទាំងមូល ហើយបុគ្គលសត្វនាគសមុទ្រធម្មតាពីរនាក់ទៀតត្រូវបានប្រើសម្រាប់ដំណើរការបន្តពូជហ្សែន។

យុទ្ធសាស្ត្រលំដាប់ហ្សែន

បណ្ណាល័យ 70/350 bp (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (Sequel) ឬ Nanopore 30 Kb (MinION)+ Hi-C (NovaSeq 6000)។​ ការរៀបចំ​តាម​លំដាប់ និង​បុគ្គល​នាគ​សមុទ្រ​ធម្មតា​បុរស​ពីរ​ផ្សេងទៀត​ត្រូវ​បាន​ប្រើ​សម្រាប់​ការ​បន្ត​ហ្សែន។

លំដាប់ប្រតិចារិក

Fឬសត្វនាគសមុទ្រទូទៅ ខួរក្បាល ភ្នែក ក្រអូមមាត់ ថ្លើម បេះដូង តម្រងនោម មេសនតេរី ពោះវៀន សាច់ដុំ ព្រុយ ស្បែក ចុងស្លឹក ពងស្វាស និងអូវែត្រូវបានប្រមូល។

យុទ្ធសាស្រ្តប្រមូលផ្តុំ Genome de Novo

Canu (ការកែតម្រូវ) + WTDBG2 (ការជួបប្រជុំគ្នា) + Pilon (ប៉ូឡូញ) + Lachesis (Hi-C) ។

លទ្ធផលចម្បង

រូប។-1.-លក្ខណៈពិសេសសំខាន់ៗ-of-the-common-seadragon-P.-taeniolatus-and-the-alligator-pipefish-S

រូបភព 1. លក្ខណៈសំខាន់ៗនៃសត្វនាគសមុទ្រធម្មតា (P. taeniolatus) និងត្រីពងក្រពើ (S. biaculeatus) និងទីតាំង phylogenetic របស់វា។

រូប។-2.-សរីរវិទ្យា-និង-ហ្សែន-តុបតែងមុខ-នៃ-the-leaf-like-appendages-in-the-common-seadragon-P

រូបភព 2. សរីរវិទ្យា និងការបង្កើតហ្សែននៃឧបសម្ព័ន្ធដូចស្លឹកនៅក្នុងនាគសមុទ្រធម្មតា (P. taeniolatus) ។

រូប។-3.-Putative-sex-determination-gene-in-the-common-seadragon-P.-taeniolatus-and-the-alligator-pipefish-S.-biaculeatus

រូបភព 3. ហ្សែនកំណត់ការរួមភេទដោយដាក់នៅក្នុងសត្វនាគសមុទ្រទូទៅ (P. taeniolatus) និងត្រីពងក្រពើ (S. biaculeatus) ។

រូប។-៤

រូបភពទី 4. ផូណូតផូណូតផៃ្ទផែរីងហ្គេលនៅក្នុងត្រីហ្សេប្រ៊ូស អេសភីភី៥ មេម៉ូហ្សីហ្កាសស។


ពេលវេលាបង្ហោះ៖ ០៨-មករា-២០២២

ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកយើង៖