ប្រូតេអូមិច
លក្ខណៈពិសេស
●ប្រូតេអូមិចគុណភាព៖ ប្រើប្រាស់ LC-MS/MS ដើម្បីកំណត់អត្តសញ្ញាណសមាសធាតុប្រូតេអ៊ីននៅក្នុងគំរូស្មុគស្មាញ (បន្ទះជែល SDS-PAGE, IP, Co-IP, Pull-down)។ គុណសម្បត្តិ៖ គ្មានដែនកំណត់ចំនួនគំរូ ការរកឃើញលឿន ដំណើរការគំរូសាមញ្ញ ទិន្នផលខ្ពស់ និងសមត្ថភាពក្នុងការរកឃើញប្រូតេអ៊ីនដែលមានកម្រិតទាប។
● ប្រូតេអូមិចបរិមាណដែលគ្មានស្លាក៖ បច្ចេកវិទ្យាដែលមិនមានស្លាកជាមួយនឹងការរកឃើញគំរូនីមួយៗ។ វាស់បរិមាណប្រូតេអ៊ីនដោយការប្រៀបធៀបអាំងតង់ស៊ីតេសញ្ញា peptide នៅក្នុងទិន្នន័យម៉ាសស្ពិចត្រូម៉ែត្រី។ គុណសម្បត្តិ៖ ប្រតិបត្តិការសាមញ្ញ អត្រាទិន្នផលខ្ពស់ (គ្មានដែនកំណត់ចំនួនគំរូ) និងការអនុវត្តយ៉ាងទូលំទូលាយ (សមស្របសម្រាប់ការប្រៀបធៀបប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល "វត្តមាន/អវត្តមាន" នៅទូទាំងប្រភេទសត្វ)។
● ប្រូតេអូមិចបរិមាណ DIA៖ ប្រើប្រាស់របៀបទទួលទិន្នន័យឯករាជ្យ (DIA) ដោយស្កេនអ៊ីយ៉ុងទាំងអស់នៅក្នុងបង្អួចដែលបានបែងចែកដើម្បីចាប់យកព័ត៌មានអ៊ីយ៉ុងពេញលេញ។ គុណសម្បត្តិ៖ សមត្ថភាពធ្វើម្តងទៀតបានល្អជាង ការគ្របដណ្តប់ប្រូតេអ៊ីនខ្ពស់ជាង និងការវាស់បរិមាណបានត្រឹមត្រូវជាងរបៀប DDA (TMT/Label Free) ដែលល្អសម្រាប់ការសិក្សាគំរូធំៗ។
● ប្រូតេអូមិចបរិមាណដែលគ្មានស្លាក 4D/ប្រូតេអូមិចបរិមាណ 4D-DIA៖ ផ្អែកលើស្ពិចត្រូម៉ែត្រម៉ាស Bruker timsTOF ដោយបន្ថែមការចល័តអ៊ីយ៉ុង (ផ្នែកឆ្លងកាត់ការប៉ះទង្គិច) ទៅនឹងការបំបែក 3D បែបប្រពៃណី។ គុណសម្បត្តិ៖ ការប្រើប្រាស់អ៊ីយ៉ុង និងភាពត្រឹមត្រូវប្រសើរឡើង ការបង្កើនប្រសិទ្ធភាពយ៉ាងទូលំទូលាយនៃជម្រៅគ្របដណ្តប់ ភាពរសើប និងអត្រាទិន្នផល; ជម្រៅកំណត់អត្តសញ្ញាណខ្ពស់ជាងវិធីសាស្ត្រ 3D បែបប្រពៃណី។
● ប្រូតេអូមិកបរិមាណឥតគិតថ្លៃ Astral Label/ប្រូតេអូមិកបរិមាណ Astral DIA៖ ផ្អែកលើម៉ាស៊ីនវាស់ម៉ាសស្ពិចត្រូម៉ែត្រដែលមានគុណភាពបង្ហាញខ្ពស់ OrbitrapTM AstralTM។ គុណសម្បត្តិ៖ ទិន្នផលខ្ពស់ជាង (គំរូជាង 100 ក្នុងមួយថ្ងៃ ជាមួយនឹងជម្រាល 8 នាទី) ការគ្របដណ្តប់កាន់តែជ្រៅ (ប្រូតេអ៊ីនជាង 8,000 ត្រូវបានរកឃើញនៅក្នុងកោសិកា Hela ក្នុងរយៈពេល 8 នាទី) និងភាពរសើបខ្ពស់ជាង (ត្រូវការគំរូតិចជាង)។
● ប្រូតេអូមិកបរិមាណ TMT៖ ប្រើប្រាស់ស្លាកអ៊ីសូតូបចំនួន 18 ដើម្បីដាក់ស្លាកប៉ិបទីតសម្រាប់ការរកឃើញគំរូចំនួន 18 ក្នុងពេលដំណាលគ្នា។ គុណសម្បត្តិ៖ ស្ថេរភាពខ្ពស់ (ការជ្រៀតជ្រែកស្ថេរភាពឧបករណ៍តិចតួចបំផុត កំហុសប្រព័ន្ធតូច) និងភាពរសើបខ្ពស់ (ការបំបែកប្រភាគកាត់បន្ថយភាពស្មុគស្មាញនៃគំរូ ធ្វើអោយប្រសើរឡើងនូវការរកឃើញប្រូតេអ៊ីនដែលមានកម្រិតទាប)។
● ប្រូតេអូមិកគោលដៅ PRM៖ បច្ចេកវិទ្យាគោលដៅដែលមានគុណភាពបង្ហាញខ្ពស់សម្រាប់ការរកឃើញជ្រើសរើសនៃប្រូតេអ៊ីន/ប៉ិបទីតគោលដៅ។ គុណសម្បត្តិ៖ អាចឱ្យមានការកំណត់បរិមាណទាក់ទង/ដាច់ខាត និងការផ្ទៀងផ្ទាត់លទ្ធផលប្រូតេអូមិកបរិមាណ។ គ្មានការរឹតបន្តឹងអង្គបដិប្រាណ ការអនុវត្តកាន់តែទូលំទូលាយជាង Western Blot និង ELISA។
គុណសម្បត្តិ
● ឧបករណ៍ទំនើប៖ បំពាក់ដោយវេទិកាប្រូតេអូមិចធម្មតា និងម៉ាស៊ីនវាស់ម៉ាសជម្រៅខ្ពស់ទំនើប (ឧ. 4D, Astral)។
● ការរកឃើញដែលមានស្ថេរភាព៖ ប្រព័ន្ធត្រួតពិនិត្យគុណភាពយ៉ាងម៉ត់ចត់ធានានូវដំណើរការធ្វើតេស្តដែលមានភាពស៊ីសង្វាក់គ្នា និងមានស្ថេរភាព។
● លទ្ធផលដែលអាចទុកចិត្តបាន៖ ការវិភាគគុណភាព និងបរិមាណក្នុងពេលដំណាលគ្នាផ្តល់នូវការបញ្ចេញមតិដែលទាក់ទង ទម្ងន់ម៉ូលេគុល ភាពសម្បូរបែប និងទិន្នន័យសំខាន់ៗផ្សេងទៀតសម្រាប់ក្រុមនីមួយៗ។
● ស្វ័យប្រវត្តិកម្មខ្ពស់៖ ប្រព័ន្ធ LC-MS ស្វ័យប្រវត្តិអាចឱ្យមានការវិភាគរហ័ស និងដំណើរការបំបែកដ៏ល្អឥតខ្ចោះ។
លក្ខណៈបច្ចេកទេសសេវាកម្ម
| ការប្រៀបធៀបបច្ចេកទេសប្រូតេអូមិចដែលមិនកំណត់គោលដៅ | ||||
| គ្មានស្លាក | ឌីអា | ធីអឹមធី | ||
| ការដាក់ស្លាក | NO | NO | បាទ/ចាស៎ | |
| របៀបស្កេនទិន្នន័យ | ឌីអេឌីអេ | ឌីអេឌីអេ | ឌីអា | ឌីអេឌីអេ |
| ភាពអាចផលិតឡើងវិញបាន | ទាបជាង | ខ្ពស់ | ខ្ពស់ | |
| ភាពរសើប | ទាបជាង | ខ្ពស់ | ខ្ពស់ | |
| ការធ្វើពហុគុណ | NO | បាទ/ចាស៎ | NO | បាទ/ចាស៎ |
| ពាក្យសុំ | ការប្រៀបធៀបវត្តមាន/អវត្តមាននៃប្រូតេអ៊ីន | គំរូទ្រង់ទ្រាយធំ | ការវិភាគលើបាច់ផ្សេងៗគ្នានៃគំរូ | ការប្រៀបធៀបការបញ្ចេញមតិប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល នៅក្នុងប្រភេទ និងជាលិកាដូចគ្នា |
| ភាពត្រឹមត្រូវ | ★ | ★★(4D/Astral DlA ★★★) | ★★ | |
| ចំនួនរកឃើញ | ★ | ★★(4D/Astral D|A★★★) | ★★ | |
តម្រូវការគំរូ
តើអ្នកកំពុងឆ្ងល់ថាតើសំណាករបស់អ្នកបំពេញតាមលក្ខណៈវិនិច្ឆ័យរបស់យើងដែរឬទេ? ចុចទីនេះដើម្បីទទួលបានតម្រូវការគំរូចុងក្រោយបំផុត.
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការប្រមូលគំរូ
ការស្រង់ចេញប្រូតេអ៊ីន
ការរំលាយអាហារដោយអង់ស៊ីម
ការបែកគ្នា
ការទទួលបានទិន្នន័យ
ការវិភាគទិន្នន័យ
ការដឹកជញ្ជូនទិន្នន័យ
ប្រូតេអូមិកគុណភាព
១. ដំណោះស្រាយ/ជែលប្រូតេអ៊ីន៖ តារាងលទ្ធផលគុណភាព
២. លទ្ធផលស្វែងរកមូលដ្ឋានទិន្នន័យ
2.1 បញ្ជីនៃផ្នែក peptide ដែលត្រូវគ្នានៅក្នុងការស្វែងរកមូលដ្ឋានទិន្នន័យ
2.2 បញ្ជីប្រូតេអ៊ីនដែលត្រូវគ្នានៅក្នុងការស្វែងរកមូលដ្ឋានទិន្នន័យ
2.3 បញ្ជីនៃការកែប្រែដែលត្រូវគ្នានៅក្នុងការស្វែងរកមូលដ្ឋានទិន្នន័យ (phosphorylation, ubiquitination, ។ល។)
៣. ទិន្នន័យឆៅ
ប្រូតេអូមិកបរិមាណ(គ្មានស្លាក/DIA/TMT)
១. ការដំណើរការទិន្នន័យជាមុន
១.១ ការស្វែងរកមូលដ្ឋានទិន្នន័យប្រូតេអ៊ីន
២. ការវិភាគការបញ្ចេញមតិប្រូតេអ៊ីន
២.១ ការវិភាគសមាសធាតុចម្បង (PCA)
២.២ គម្លាតស្តង់ដារដែលទាក់ទង (RSD)
២.៣ ការចែកចាយនិន្នាការមធ្យម K
២.៤ ការវាយតម្លៃលទ្ធភាពនៃការបន្តពូជ
2.5 ផែនទីកំដៅនៃការបញ្ចេញមតិប្រូតេអ៊ីន
៣. ចំណារពន្យល់មុខងារ
៣.១ ចំណារពន្យល់មុខងារ GO
៣.២ ចំណារពន្យល់មុខងារ KEGG
៣.៣ ចំណារពន្យល់មុខងារ COG
៣.៤ ចំណារពន្យល់មុខងារ GOslim
៣.៥ ចំណារពន្យល់ដូមេនរចនាសម្ព័ន្ធប្រូតេអ៊ីន Pfam
៤. ការវិភាគឌីផេរ៉ង់ស្យែលប្រូតេអ៊ីន (ការចម្លងជីវសាស្រ្ត ≥ ៣)
៤.១ លទ្ធផលនៃការវិភាគឌីផេរ៉ង់ស្យែលប្រូតេអ៊ីន
៤.២ ការចែកចាយនៃការផ្លាស់ប្តូរផ្នត់ប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល (FC)
៤.៣ ការវិភាគស្ថិតិនៃបរិមាណប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៤.៤ គំនូសតាងភ្នំភ្លើងប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៤.៥ ផែនទីកំដៅចង្កោមប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៤.៦ ចំណារពន្យល់មុខងារ GO នៃប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល និងការវិភាគការបង្កើនប្រសិទ្ធភាព
៤.៧ ចំណារពន្យល់មុខងារ KEGG និងការវិភាគការបង្កើនប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៤.៨ ចំណារពន្យល់មុខងារ COG នៃប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៤.៩ ចំណារពន្យល់ GOslim និងការវិភាគការបង្កើនប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៤.១០ ចំណារពន្យល់ដូមេន និងការវិភាគការបង្កើនរចនាសម្ព័ន្ធប្រូតេអ៊ីនឌីផេរ៉ង់ស្យែល
៥. ការវិភាគអន្តរកម្មបណ្តាញប្រូតេអ៊ីន
៦. ចំណារពន្យល់ផ្លូវប្រតិកម្មប្រូតេអ៊ីន
៧. ការព្យាករណ៍ Peptide សញ្ញា
៨. ការធ្វើមូលដ្ឋានីយកម្មប្រូតេអ៊ីនក្រោមកោសិកា
ប្រូតេអូមិកបរិមាណ(PRM)
១. លទ្ធផលនៃការវាស់បរិមាណប្រូតេអ៊ីន PRM
១.១ ទិដ្ឋភាពទូទៅនៃលទ្ធផលនៃការវាស់វែងបរិមាណ
១.២ ការចែកចាយតំបន់កំពូលអ៊ីយ៉ុងបំណែកសម្រាប់ផ្នែកប៉ិបទីត
ប្រូតេអូមិកបរិមាណ
១.ការវិភាគការបញ្ចេញមតិប្រូតេអ៊ីន
↑ការវិភាគសមាសភាគចម្បង (PCA)↑គម្លាតស្តង់ដារដែលទាក់ទង (RSD)
↑K-means ការចែកចាយនិន្នាការ ↑ទំនាក់ទំនងAការវិភាគនៃPរ៉ូទីនEការបញ្ចេញមតិLអ៊ីវល
↑ ផែនទីកំដៅការបញ្ចេញមតិប្រូតេអ៊ីន
២. ចំណារពន្យល់មុខងារ
↑ទៅ ចំណារពន្យល់មុខងារ↑ចំណារពន្យល់មុខងារ KEGG
↑ ចំណារពន្យល់មុខងារ COG ↑ ចំណារពន្យល់មុខងារ GOslim
↑ ចំណារពន្យល់ដូមេនរចនាសម្ព័ន្ធប្រូតេអ៊ីន Pfam
៣.ការវិភាគអន្តរកម្មបណ្តាញប្រូតេអ៊ីន
↑ ការវិភាគអន្តរកម្មបណ្តាញប្រូតេអ៊ីន
៤.ការព្យាករណ៍ Peptide សញ្ញា
↑ ការព្យាករណ៍ Peptide សញ្ញា
៥. ការធ្វើមូលដ្ឋានីយកម្មប្រូតេអ៊ីនក្រោមកោសិកា
↑ទីតាំងរងកោសិកានៃប្រូតេអ៊ីន
| ឆ្នាំ ២០២៥ | វេស៊ីគ្ល៍អាប៉ុបតូទិកដែលមានប្រភពមកពីកោសិកាដើមមេសេនឈីម៉ាល់ ធ្វើអោយប្រសើរឡើងនូវការឆ្លើយតបនៃប្រតិកម្មអាលែហ្សី តាមរយៈការជំរុញឱ្យមានអាប៉ុបតូស៊ីសកោសិកា T CD8+ ជាមួយនឹងកម្រិតកាល់ស្យូមលើសកម្រិត និងមុខងារមីតូខនឌ្រីមិនប្រក្រតី | វិទ្យាសាស្ត្រកម្រិតខ្ពស់ |
| ២០២៤ | ពហុអូមិចរួមបញ្ចូលគ្នាបង្ហាញពីប្រសិទ្ធភាពប្រឆាំងនឹងដុំសាច់ប្រសើរឡើងនៃ | ជំងឺមហារីកបកប្រែ |
| ២០២៤ | ការវិភាគពហុអូមិចបង្ហាញពីលក្ខណៈពិសេសប្លែកៗនៃផ្លូវមេតាបូលីសដែលគាំទ្រដល់ ទំហំផ្លែឈើ និងការប្រែប្រួលពណ៌របស់ល្ពៅយក្ស | អន្តរជាតិ ជេ. ម៉ូល វិទ្យាសាស្ត្រ។ |
| ២០២៤ | ការវិភាគប្រតិចារិក និងមេតាបូឡូមផ្តល់នូវការយល់ដឹងថ្មីៗអំពីការរួញសាច់ដុំដែលមិនប្រើ នៅក្នុងសាច់មាន់៖ តួនាទីដ៏មានសក្តានុពលនៃសរសៃសាច់ដុំរមួលលឿន | អន្តរជាតិ ជេ. ម៉ូល វិទ្យាសាស្ត្រ។ |
| ឆ្នាំ ២០២៣ | ការវិភាគពហុអឹមិចបង្ហាញពីឥទ្ធិពលនៃថ្នាំ tetracycline ទៅលើការលូតលាស់របស់ឫស ryegrass។ | ទិនានុប្បវត្តិសម្ភារៈគ្រោះថ្នាក់ |
