16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-NGS
ಸೇವಾ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆ: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್.
● ಇತರ ವರ್ಧನೆ ಗುರಿಗಳಲ್ಲಿ 16S, 18S ಮತ್ತು ITS ನ ಸಣ್ಣ ಪ್ರದೇಶಗಳ ವರ್ಧನೆ.
● ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ನ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ಆಯ್ಕೆಗಳು.
● ಬಹು ವರ್ಧನೆ ಗುರಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಹಿಂದಿನ ಯೋಜನೆಯ ಅನುಭವ.
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ● ದಶಾಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ-ಮುಕ್ತ:ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯ ತ್ವರಿತ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ.
● ● ದಶಾಹೆಚ್ಚಿನ ರೆಸಲ್ಯೂಷನ್: ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ-ವಿಪುಲವಾಗಿರುವ ಘಟಕಗಳಲ್ಲಿ.
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅನ್ವಯಿಸುತ್ತದೆ: ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳು.
● ● ದಶಾಸಮಗ್ರ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಡೇಟಾಬೇಸ್, ಟಿಪ್ಪಣಿ, OTU/ASV ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಇತ್ತೀಚಿನ QIIME2 ಪ್ಯಾಕೇಜ್ (ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನದ ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಒಳನೋಟ).
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: ವಾರ್ಷಿಕವಾಗಿ 150 ಸಾವಿರ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸುವುದರೊಂದಿಗೆ, BMKGENE ಒಂದು ದಶಕದ ಅನುಭವ, ಹೆಚ್ಚು ಕೌಶಲ್ಯಪೂರ್ಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ತಂಡ, ಸಮಗ್ರ ವಿಷಯ ಮತ್ತು ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲವನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
ಸೇವಾ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ |
| ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ PE250 | 50/100/300K ಟ್ಯಾಗ್ಗಳು (ಜೋಡಿಗಳನ್ನು ಓದಿ) |
ಸೇವಾ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
| ಸಾಂದ್ರತೆ (ng/µL) | ಒಟ್ಟು ಮೊತ್ತ (ng) | ವಾಲ್ಯೂಮ್ (μL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● ಮಣ್ಣು/ಕೆಸರು: 1-2 ಗ್ರಾಂ
● ಕರುಳಿನ ವಿಷಯ-ಪ್ರಾಣಿ: 0.5-2 ಗ್ರಾಂ
● ಕರುಳಿನಲ್ಲಿರುವ ವಸ್ತುಗಳು-ಕೀಟ: 0.1-0.25 ಗ್ರಾಂ
● ಸಸ್ಯದ ಮೇಲ್ಮೈ (ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಕೆಸರು): 0.1-0.5 ಗ್ರಾಂ
● ಹುದುಗುವಿಕೆ ಸಾರು ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಕೆಸರು): 0.1-0.5 ಗ್ರಾಂ
● ಮಲ (ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಾಣಿಗಳು): 0.5-2 ಗ್ರಾಂ
● ಮಲ (ಇಲಿ): 3-5 ಧಾನ್ಯಗಳು
● ಪಲ್ಮನರಿ ಅಲ್ವಿಯೋಲಾರ್ ಲ್ಯಾವೆಜ್ ದ್ರವ: ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೇಪರ್
● ಯೋನಿ ಸ್ವ್ಯಾಬ್: 5-6 ಸ್ವ್ಯಾಬ್ಗಳು
● ಚರ್ಮ/ಜನನಾಂಗದ ಸ್ವ್ಯಾಬ್/ಲಾಲಾರಸ/ಮೌಖಿಕ ಮೃದು ಅಂಗಾಂಶ/ಗಂಟಲಿನ ಸ್ವ್ಯಾಬ್/ಗುದನಾಳದ ಸ್ವ್ಯಾಬ್: 2-3 ಸ್ವ್ಯಾಬ್ಗಳು
● ಮೇಲ್ಮೈ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳು: ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೇಪರ್
● ಜಲಮೂಲ/ಗಾಳಿ/ಜೈವಿಕ ಪದರ: ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೇಪರ್
● ಎಂಡೋಫೈಟ್ಗಳು: 1-2 ಗ್ರಾಂ
● ದಂತ ಪ್ಲೇಕ್: 0.5-1 ಗ್ರಾಂ
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಈ ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
- ಕಚ್ಚಾ ದತ್ತಾಂಶ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
- OTU ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ /ಶಬ್ದ ನಿವಾರಣೆ (ASV)
- OTU ಟಿಪ್ಪಣಿ
- ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಶಾನನ್, ಸಿಂಪ್ಸನ್ ಮತ್ತು ACE ಸೇರಿದಂತೆ ಬಹು ಸೂಚ್ಯಂಕಗಳು.
- ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
- ಅಂತರ-ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
- ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಹೊರಗಿನ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ನಡುವೆ
- 16S ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ
ವರ್ಗೀಕರಣ ವಿತರಣೆಯ ಹಿಸ್ಟೋಗ್ರಾಮ್
ವರ್ಗೀಕರಣದ ಸಮೃದ್ಧಿ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಶಾಖ ನಕ್ಷೆ
ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ವಿರಳೀಕರಣ ವಕ್ರರೇಖೆ
ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: NMDS
ಅಂತರ ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: LEFSE ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಆವಿಷ್ಕಾರ
ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಜೊತೆಗಿನ BMKGene ನ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹದ ಮೂಲಕ ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಡಾಂಗ್, ಸಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಯೂಕೋಮಿಯಾ ಉಲ್ಮೋಯಿಡ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ರೈಜೋಸ್ಪಿಯರ್ ಮಣ್ಣು ಮತ್ತು ತೊಗಟೆ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಟಾದ ಜೋಡಣೆ, ಕೋರ್ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಟಾ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯ', ಫ್ರಾಂಟಿಯರ್ಸ್ ಇನ್ ಮೈಕ್ರೋಬಯಾಲಜಿ, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
ಲಿ, ವೈ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಇಲಿಗಳಲ್ಲಿ ಗಾರ್ಡ್ನೆರೆಲ್ಲಾ ವಜಿನಾಲಿಸ್-ಪ್ರೇರಿತ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವಜಿನೋಸಿಸ್ ಚಿಕಿತ್ಸೆಗಾಗಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಒಕ್ಕೂಟ ಕಸಿ', ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್, 11(1), ಪುಟಗಳು 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
ಯಾಂಗ್, ಜೆ., ಫು, ವೈ. ಮತ್ತು ಲಿಯು, ಹೆಚ್. (2022) 'ನೆಲ-ಆಧಾರಿತ ಮುಚ್ಚಿದ ಜೈವಿಕ ಪುನರುತ್ಪಾದಕ ಜೀವ ಬೆಂಬಲ ಪ್ರಯೋಗದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾದ ಗಾಳಿಯ ಧೂಳಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳು “ಚಂದ್ರನ ಅರಮನೆ 365”', ಪರಿಸರ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳು, 17(1), ಪುಟಗಳು 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
ಯಿನ್, ಎಸ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಮಿಶ್ರಗೊಬ್ಬರ ತಯಾರಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಸಾರಜನಕ ರೂಪಾಂತರ ನಿಯಂತ್ರಿತ ಸಾರಜನಕ ನಷ್ಟಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್ಗಳ ಫೀಡ್ಸ್ಟಾಕ್-ಅವಲಂಬಿತ ಸಮೃದ್ಧಿ', ಬಯೋರಿಸೋರ್ಸ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜಿ, 361, ಪುಟ 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
