ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ mRNA ಅನುಕ್ರಮ -PacBio
ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಪಾಲಿ-ಎ mRNA ಯಿಂದ cDNA ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ನಂತರ ಗ್ರಂಥಾಲಯ ಸಿದ್ಧತೆ
● CCS ಮೋಡ್ನಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವಿಕೆ, ಹೈಫೈ ರೀಡ್ಗಳನ್ನು ರಚಿಸುವುದು
● ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳ ಅನುಕ್ರಮ
● ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಅಗತ್ಯವಿಲ್ಲ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇದನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು
● ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ lncRNA, ಜೀನ್ ಸಮ್ಮಿಳನಗಳು, ಪಾಲಿ-ಅಡೆನಿಲೇಷನ್ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ರಚನೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ● ದಶಾಹೆಚ್ಚಿನ ನಿಖರತೆ: ಹೈಫೈ ನಿಖರತೆ >99.9% (Q30) ನೊಂದಿಗೆ ಓದುತ್ತದೆ, NGS ಗೆ ಹೋಲಿಸಬಹುದು
● ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಸಂಪೂರ್ಣ ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳ ಅನುಕ್ರಮವು ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: 1100 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಿದ ಮತ್ತು 2300 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ದಾಖಲೆಯೊಂದಿಗೆ, ನಮ್ಮ ತಂಡವು ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಯೋಜನೆಗೂ ಅನುಭವದ ಸಂಪತ್ತನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
● ● ದಶಾಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ: ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3 ತಿಂಗಳ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆಯ ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಯೋಜನೆಯ ಅನುಸರಣೆ, ದೋಷನಿವಾರಣೆ ಸಹಾಯ ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ | ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ |
| PolyA ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ mRNA CCS ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಸೀಕ್ವೆಲ್ II ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ | 20/40 ಜಿಬಿ 5/10 ಎಂ ಸಿಸಿಎಸ್ | ಕ್ಯೂ30≥85% |
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು:
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು:
● ಸಸ್ಯಗಳು:
ಬೇರು, ಕಾಂಡ ಅಥವಾ ದಳ: 450 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಎಲೆ ಅಥವಾ ಬೀಜ: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಹಣ್ಣು: 1.2 ಗ್ರಾಂ
● ಪ್ರಾಣಿ:
ಹೃದಯ ಅಥವಾ ಕರುಳು: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
ವಿಸ್ಸೆರಾ ಅಥವಾ ಮೆದುಳು: 240 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಸ್ನಾಯು: 450 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಮೂಳೆಗಳು, ಕೂದಲು ಅಥವಾ ಚರ್ಮ: 1 ಗ್ರಾಂ
● ಆರ್ತ್ರೋಪಾಡ್ಗಳು:
ಕೀಟಗಳು: 6 ಗ್ರಾಂ
ಕ್ರಸ್ಟೇಸಿಯಾ: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
● ಸಂಪೂರ್ಣ ರಕ್ತ: 1 ಟ್ಯೂಬ್
● ಕೋಶಗಳು: 106 ಜೀವಕೋಶಗಳು
| ಒಟ್ಟು (ng/μl) | ಪ್ರಮಾಣ (μg) | ಶುದ್ಧತೆ | ಸಮಗ್ರತೆ |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | ಓಡಿ260/280=1.7-2.5 ಓಡಿ260/230=0.5-2.5 ಜೆಲ್ ಮೇಲೆ ತೋರಿಸಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಥವಾ ಡಿಎನ್ಎ ಮಾಲಿನ್ಯ ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಇಲ್ಲ. | ಸಸ್ಯಗಳಿಗೆ: RIN≥7.5; ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ: RIN≥8.0; 5.0≥ 28ಎಸ್/18ಎಸ್≥1.0; ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಮೂಲ ಎತ್ತರವಿಲ್ಲ |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಕಂಟೇನರ್: 2 ಮಿಲಿ ಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ (ಟಿನ್ ಫಾಯಿಲ್ ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿಲ್ಲ)
ಮಾದರಿ ಲೇಬಲಿಂಗ್: ಗುಂಪು+ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಉದಾ. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
ಸಾಗಣೆ:
1. ಡ್ರೈ-ಐಸ್: ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಚೀಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಿ ಡ್ರೈ-ಐಸ್ನಲ್ಲಿ ಹೂಳಬೇಕು.
2. ಆರ್ಎನ್ಎಸ್ಟೇಬಲ್ ಟ್ಯೂಬ್ಗಳು: ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಟೆಬಿಲೈಸೇಶನ್ ಟ್ಯೂಬ್ನಲ್ಲಿ ಒಣಗಿಸಬಹುದು (ಉದಾ ಆರ್ಎನ್ಎಸ್ಟೇಬಲ್®) ಮತ್ತು ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶದಲ್ಲಿ ರವಾನಿಸಬಹುದು.
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಪ್ರಯೋಗ ವಿನ್ಯಾಸ
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಆರ್ಎನ್ಎ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಈ ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
● ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
● ಪರ್ಯಾಯ ಪಾಲಿಅಡೆನಿಲೇಷನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (APA)
● ಫ್ಯೂಷನ್ ಪ್ರತಿಲಿಪಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಬೆಂಚ್ಮಾರ್ಕಿಂಗ್ ಯೂನಿವರ್ಸಲ್ ಸಿಂಗಲ್-ಕಾಪಿ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಸ್ (BUSCO) ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಕಾದಂಬರಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಭವಿಷ್ಯ (CDS) ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ
● lncRNA ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: lncRNA ಮತ್ತು ಗುರಿಗಳ ಮುನ್ಸೂಚನೆ
● ಮೈಕ್ರೋಸ್ಯಾಟಲೈಟ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ (SSR)
ಬುಸ್ಕೋ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಪರ್ಯಾಯ ಪಾಲಿಅಡೆನಿಲೇಷನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (APA)
ಕಾದಂಬರಿ ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ
ಈ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಪೂರ್ಣ ಪ್ರಕಟಣೆಯಲ್ಲಿ BMKGene ನ ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ mRNA ಅನುಕ್ರಮ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಮಾ, ವೈ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ನೆಮೊಪಿಲೆಮಾ ನೊಮುರೈ ವಿಷ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಮತ್ತು ಒಎನ್ಟಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮ ವಿಧಾನಗಳ ತುಲನಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ', ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್, 115(6), ಪುಟ 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
ಚಾವೊ, ಕ್ಯೂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2019) 'ಪಾಪ್ಯುಲಸ್ ಕಾಂಡದ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರ', ಸಸ್ಯ ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಜರ್ನಲ್, 17(1), ಪುಟಗಳು 206–219. doi: 10.1111/PBI.12958.
ಡೆಂಗ್, ಹೆಚ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಆಕ್ಟಿನಿಡಿಯಾ ಲ್ಯಾಟಿಫೋಲಿಯಾ (ಆಸ್ಕೋರ್ಬೇಟ್-ಸಮೃದ್ಧ ಹಣ್ಣಿನ ಬೆಳೆ) ಹಣ್ಣಿನ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಮತ್ತು ಹಣ್ಣಾಗುವಿಕೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಆಸ್ಕೋರ್ಬಿಕ್ ಆಮ್ಲದ ಅಂಶದಲ್ಲಿನ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ಆಣ್ವಿಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು', ಇಂಟರ್ನ್ಯಾಷನಲ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸೈನ್ಸಸ್, 23(10), ಪುಟ 5808. doi: 10.3390/IJMS23105808/S1.
ಹುವಾ, ಎಕ್ಸ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಪ್ಯಾರಿಸ್ ಪಾಲಿಫಿಲ್ಲಾದಲ್ಲಿ ಬಯೋಆಕ್ಟಿವ್ ಪಾಲಿಫಿಲಿನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಬಯೋಸಿಂಥೆಟಿಕ್ ಪಾತ್ವೇ ಜೀನ್ಗಳ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಭವಿಷ್ಯ', ಸಂವಹನ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ 2022 5:1, 5(1), ಪುಟಗಳು 1–10. doi: 10.1038/s42003-022-03000-z.
ಲಿಯು, ಎಂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಟುಟಾ ಅಬ್ಸೊಲುಟಾ (ಮೇರಿಕ್) ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಕ್ರೋಮ್ P450 ಜೀನ್ಗಳ ಸಂಯೋಜಿತ ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಐಸೊ-ಸೆಕ್ ಮತ್ತು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಆರ್ಎನ್ಎ-ಸೆಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ', ಕೀಟಗಳು, 14(4), ಪುಟ 363. doi: 10.3390/INESCTS14040363/S1.
ವಾಂಗ್, ಲಿಜುನ್ ಮತ್ತು ಇತರರು (2019) 'ರಿಸಿನಸ್ ಕಮ್ಯುನಿಸ್ನಲ್ಲಿ ರಿಕಿನೋಲಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಉತ್ತಮ ತಿಳುವಳಿಕೆಗಾಗಿ ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಏಕ-ಅಣು ನೈಜ-ಸಮಯದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಸಂಕೀರ್ಣತೆಯ ಸಮೀಕ್ಷೆ', ಬಿಎಂಸಿ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್, 20(1), ಪುಟಗಳು 1–17. doi: 10.1186/S12864-019-5832-9.
